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J-GLOBAL ID：201702290065907669   整理番号：17A1429262

ゲノム系統学的解析は卵菌類peronosporalean系統における多系性の多重インスタンスを支持する【Powered by NICT】

Phylogenomic analysis supports multiple instances of polyphyly in the oomycete peronosporalean lineage

著者 (8件)： Ascunce Marina S. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Ascunce Marina S. (Department of Plant Pathology, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Huguet-Tapia Jose C. (Department of Plant Pathology, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Ortiz-Urquiza Almudena (Department of Microbiology and Cell Science, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Keyhani Nemat O. (Department of Microbiology and Cell Science, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Braun Edward L. (Department of Biology and Genetics Institute, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Goss Erica M. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, USA) ,  Goss Erica M. (Department of Plant Pathology, University of Florida, Gainesville, FL, USA)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 114  ページ： 199-211  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 卵菌類の生物学的多様化の研究は,一世紀以上も困難な作業であった。パイオニア研究者は形態学的特徴を用いて,この不均一な一群を記述し,生理学的および遺伝的ツールは,これらの微生物の知識を拡大した。しかし,矛盾する系統発生により制限される卵菌類多様化に関する研究。17卵菌類分類群からの全ゲノムデータを用いて,これらのゲノム間の共有277コアオーソロガス遺伝子のデータセットを得た。連接最尤と合体ベースの方法を用いた場合にこのデータセットの解析は卵菌類系統発生の高調和と強く支持された推定値をもたらした;一つの重要な例外はAlbugoの位置した。著者らの結果は,Phytophthora Hyaloperonosporaクレードの姉妹クレードとしてPhytopythium vexans(以前はPythiumクレードK)の位置を支持した。Pythium sensu latoを含む残りのクレードは二単系統群を形成した。1群はPythiumクレードA,BおよびCに対応する三分類群で構成されており,他のグループはクレードF,GおよびIを示す分類群を含み,以前のPythium系統発生と一致した。しかし,PythiumクレードF,G,I投与群ではPhytophthora Hyaloperonospora Phytopythium属クレードの姉妹として配置,Pythium sensu latoの単系統性の欠如を確認した。多種合体方法は白発疹さび病,Albugo laibachii,を高い信頼性を持って設置できなかったことを明らかにした。著者らの解析は,ゲノムデータは卵菌類系統発生を解決し,卵菌類生活様式の進化を研究するための系統学的枠組みを提供することができることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *卵菌類 ,  最尤法 ,  クラスタ ,  系統発生 ,  *多重化 ,  信頼性 ,  *ゲノム ,  Pythium ,  多様化 ,  ライフスタイル ,  Phytophthora ,  遺伝
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  クレード ,  分類群 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 卵菌類 ,  ゲノミクス ,  コアオーソロガス遺伝子 ,  Pythium ,  系統ゲノミクス ,  ライフスタイル

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  系統学 ,  解析 ,  卵菌類 ,  系統 ,  多重 ,  インスタンス ,  支持