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J-GLOBAL ID：201702290317952114   整理番号：17A1244993

格子外ビーズ蛋白質モデルの構造最適化のための2摂動【Powered by NICT】

Two Perturbations for Geometry Optimization of Off-lattice Bead Protein Models

著者 (1件)： Takeuchi Hiroshi (Division of Chemistry, Graduate School of Science, Hokkaido University, Sapporo, 060-0810, Japan)
資料名： Molecular Informatics  (Molecular Informatics)
巻： 36  号： 8  ページ： null  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2686A  ISSN： 1868-1743  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原子クラスタのための以前に開発された最適化アルゴリズムを参考にして,著者らは二種類のビーズ(親水性および疎水性のもの)で表現された粗粒蛋白質モデルの構造最適化のための効率的な方法を開発した。法では,二種類の幾何学的摂動の,中心指向性ビーズ移動及び一ビーズ回転は,新しい形態を調査するために使用し,局所最適化は摂動後に実施した。中心指向性ビーズの動きは疎水性ビーズに使用され,1ビーズ回転は,疎水性および親水性ビーズで行った。最適化法を13 20 21,および34ビーズからなる蛋白質モデルに適用した。この方法は文献で報告された1321および34ビーズモデルの大域的最小値を生成し,20ビーズを用いた蛋白質モデルの最低エネルギーを更新した。これらの結果は,本方法が蛋白質の最適構造を探索するために有効であることを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *構造最適化 ,  親水性 ,  *粒状材 ,  *最適化 ,  *摂動 ,  疎水性 ,  *タンパク質 ,  ポテンシャルエネルギー ,  指向性 ,  *モデル
準シソーラス用語： 大域的最適化 ,  ローカル最適化 ,  最適アルゴリズム ,  原子クラスタ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 大域的最適化 ,  蛋白質モデル ,  ポテンシャルエネルギー

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 格子 ,  ビーズ ,  蛋白質 ,  モデル ,  構造最適化 ,  摂動