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J-GLOBAL ID：201702290545158908   整理番号：17A1057676

ワモンアザラシ(Pusa hispida)脂肉トランスクリプトームのde novo集合:PCB曝露に関連した分子健康指標の同定を可能にするツール【Powered by NICT】

De novo assembly of the ringed seal (Pusa hispida) blubber transcriptome: A tool that enables identification of molecular health indicators associated with PCB exposure

著者 (8件)： Brown Tanya M. (Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada) ,  Brown Tanya M. (Memorial University, St. John’s, Newfoundland A1B 3X9, Canada) ,  Hammond S. Austin (Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada) ,  Hammond S. Austin (Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada) ,  Behsaz Bahar (Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada) ,  Veldhoen Nik (Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada) ,  Birol Inanc (Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada) ,  Helbing Caren C. (Department of Biochemistry and Microbiology, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3P6, Canada)
資料名： Aquatic Toxicology  (Aquatic Toxicology)
巻： 185  ページ： 48-57  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0823B  ISSN： 0166-445X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Pusa hispida,ワモンアザラシは北極海洋生態系におけるキーストーン種であり,毒性損傷に対するポリ塩化ビフェニル(PCB)曝露を結びつけるための有用な海洋哺乳類を証明した。ワモンアザラシ(342,863転写物の53%であった注釈付き)の最初のデノボ集合化トランスクリプトーム,北極カナダ,ラブラドルにおける局所PCB源に曝露されたワモンアザラシの個体群への適用を報告した。局所ワモンアザラシ(n=4)におけるエネルギー代謝不均衡の適応を見出し,海洋哺乳類中のPCB曝露とその影響の指標であることを五種類の有意な遺伝子転写標的プラスミノーゲン受容体(Plg R(KT)),溶質キャリアファミリー25メンバー43受容体(Slc25a43),アンキリン反復ドメイン含有蛋白質,26様受容体(Ankrd26),HIS30(まだ注釈付きではない)とHIS16(まだ注釈付きではない)を同定した。これら五遺伝子標的の存在量のプロファイルは,qPCRアッセイを用いて43ワモンアザラシから採取した脂肉試料で検証した。全五遺伝子標的,(Plg R(KT),r~2=0.43),(Slc25a43,~2=0.51),(Ankrd26,~2=0.43),(HIS30, r~2=0.39)と(HIS16, r~2=0.31)のmRNA転写物レベルは脂肪PCBsのレベルの増加と相関していた。本研究からの結果は海洋哺乳類におけるPCB関連影響の理解に寄与し,鰭脚類における将来の分子と毒物学研究のための新しいツールを提供する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 定量的PCR法 ,  エネルギー代謝 ,  毒性 ,  カナダ ,  遺伝子ターゲティング ,  *トランスクリプトーム ,  毒物学 ,  タンパク質 ,  mRNA ,  アノテーション ,  個体群 ,  ポリ塩化ビフェニル ,  受容体
準シソーラス用語： 海洋哺乳類 ,  *ワモンアザラシ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： トランスクリプトーム ,  de novo集合 ,  ひれ足類 ,  環状シール ,  ポリ塩化ビフェニル ,  RNA-seq

分類 (2件)： その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  動物に対する影響  (EE05040R)

タイトルに関連する用語 (11件)： ワモンアザラシ ,  脂 ,  肉 ,  トランスクリプトーム ,  集合 ,  PCB ,  曝露 ,  分子 ,  健康指標 ,  同定 ,  ツール