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J-GLOBAL ID：201702290782255980   整理番号：17A1402489

emMAW 外部記憶装置中のminimal absent wordを計算する

emMAW: computing minimal absent words in external memory

著者 (3件)： HELIOU Alice (Univ. Paris-Saclay, Palaiseau, FRA) ,  PISSIS Solon P. (King’s Coll. London, London, GBR) ,  PUGLISI Simon J. (Univ. Helsinki, Helsinki, FIN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 17  ページ： 2746-2749  発行年： 2017年09月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本稿では,minimal absent wordを計算するための初めての外部記憶装置アルゴリズムemMAWを紹介する。本アルゴリズムの無料のオープンソース実装は,たった1GBのRAMしか利用可能でないときでも,ヒトの全ゲノムを処理するのに,標準的ワークステーションで3時間を必要としない。GNU GPLの条件下の無料ソフトウェアが,https://github.com/solonas13/mawにて利用可能である。

シソーラス用語： *外部記憶装置 ,  *アルゴリズム ,  *ソフトウェア ,  遺伝学実験技術 ,  マッチング
準シソーラス用語： *オープンソースソフトウェア ,  *全ゲノム解析 ,  *文字列照合

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

タイトルに関連する用語 (2件)： 外部記憶装置 ,  計算