文献

J-GLOBAL ID：201702290792233172   整理番号：17A1560143

BacDiveメタデータベースによる細菌表現型データを可能にする次世代生物多様性解析の動員と統合【Powered by NICT】

Mobilization and integration of bacterial phenotypic data-Enabling next generation biodiversity analysis through the BacDive metadatabase

著者 (4件)： Reimer Lorenz C. (Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Sohngen Carola (Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Vetcininova Anna (Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Overmann Jorg (Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 261  ページ： 187-193  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物データおよびメタデータは科学文献,データベースと未発表の実験室ノートを通して散乱とそれによってしばしばアクセスすることは困難である。(メタ)データのホットスポットは,カルチャーコレクションの内部記述と一次文献における新規分類群の最初の記述である。ここでは,原核生物メタデータベースBacDiveにより公表されたメタデータを生成した三の典型的な動員プロジェクトについて述べた。粘液細菌のReichenbach収集したディジタル12,535タイプライタ指数カードに関する情報を含んでいる。合計37,156データ点をテキストマイニングによって抽出した。第二移動プロジェクトでは,紙形式に関する解析的プロファイル指数(API)試験を対象とした。全体として6820API試験はデジタル化され,4524種の微生物菌株の生理学的データを提供した。第三に,35,651データ点を得,International Journalof Systematic and Evolutionary Microbiologyの523新種記述からのメタデータの抽出について述べた。全てのデータセットはBacDiveに集積したと発表された。それによってこれらのメタデータを利用でき,探索可能になっただけでなく,歪分類,単離源,栽培条件,分子生物学データに関連していた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 分子生物学 ,  ホットスポット ,  新種 ,  粘液細菌目 ,  微生物 ,  *生物多様性 ,  単離 ,  *メタデータ ,  *表現型 ,  *データベース ,  生理学 ,  原核生物
準シソーラス用語： 菌株 ,  テキストマイニング ,  分類群 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： メタデータ ,  細菌の生物多様性 ,  細菌表現型 ,  データ移動 ,  データベース

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： メタデータ ,  細菌 ,  表現型 ,  次世代 ,  生物 ,  多様性解析 ,  統合