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J-GLOBAL ID：201702293760700849   整理番号：17A1164036

油汚染土壌ジアゾ栄養生物Azoarcus olearius DQS IV~Tはモデルのイネ科植物内部寄生菌Azoarcussp.BH72に類似した遺伝的および表現型である【Powered by NICT】

The oil-contaminated soil diazotroph Azoarcus olearius DQS-4^T is genetically and phenotypically similar to the model grass endophyte Azoarcus sp. BH72

著者 (24件)： Faoro Helisson (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Parana, 81531-980, Brazil) ,  Faoro Helisson (Laboratory of Gene Expression Regulation, Instituto Carlos Chagas, Fiocruz-PR, Curitiba, Parana, 81350-010, Brazil) ,  Rene Menegazzo Rodrigo (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Parana, 81531-980, Brazil) ,  Battistoni Federico (Department of Microbial Biochemistry and Genomics, Instituto de Investigaciones Biologicas Clemente Estable (IIBCE), Montevideo, 11600, Uruguay) ,  Gyaneshwar Prasad (Department of Biological Sciences, University of Wisconsin - Milwaukee, WI, 53211, USA) ,  do Amaral Fernanda P. (Division of Plant Science and Biochemistry, C. S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, MO, 65211, USA) ,  Taule Cecilia (Department of Microbial Biochemistry and Genomics, Instituto de Investigaciones Biologicas Clemente Estable (IIBCE), Montevideo, 11600, Uruguay) ,  Rausch Sydnee (Department of Biological Sciences, University of Wisconsin - Milwaukee, WI, 53211, USA) ,  Goncalves Galvao Patricia (Embrapa Agrobiologia, Seropedica, Rio de Janeiro, 23891-000, Brazil) ,  de los Santos Cecilia (Department of Microbial Biochemistry and Genomics, Instituto de Investigaciones Biologicas Clemente Estable (IIBCE), Montevideo, 11600, Uruguay) ,  Mitra Shubhajit (Department of Biological Sciences, University of Wisconsin - Milwaukee, WI, 53211, USA) ,  Heijo Gabriela (Department of Microbial Biochemistry and Genomics, Instituto de Investigaciones Biologicas Clemente Estable (IIBCE), Montevideo, 11600, Uruguay) ,  Sheu Shih-Yi (Laboratory of Microbiology, Department of Seafood Science, National Kaohsiung Marine University, Kaohsiung City, 811, Taiwan) ,  Chen Wen-Ming (Laboratory of Microbiology, Department of Seafood Science, National Kaohsiung Marine University, Kaohsiung City, 811, Taiwan) ,  Mareque Cintia (Department of Microbial Biochemistry and Genomics, Instituto de Investigaciones Biologicas Clemente Estable (IIBCE), Montevideo, 11600, Uruguay) ,  Zibetti Tadra-Sfeir Michelle (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Parana, 81531-980, Brazil) ,  Ivo Baldani J. (Embrapa Agrobiologia, Seropedica, Rio de Janeiro, 23891-000, Brazil) ,  Maluk Marta (The James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, UK) ,  Paula Guimaraes Ana (Embrapa Agrobiologia, Seropedica, Rio de Janeiro, 23891-000, Brazil) ,  Stacey Gary (Division of Plant Science and Biochemistry, C. S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, MO, 65211, USA) ,  de Souza Emanuel M. (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Parana, 81531-980, Brazil) ,  Pedrosa Fabio O. (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Parana, 81531-980, Brazil) ,  Magalhaes Cruz Leonardo (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal do Parana, Curitiba, Parana, 81531-980, Brazil) ,  James Euan K. (The James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, UK)
資料名： Environmental Microbiology Reports  (Environmental Microbiology Reports)
巻： 9  号： 3  ページ： 223-238  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2562A  ISSN： 1758-2229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 台湾の油汚染土壌から分離したN_2固定ベータプロテオバクテリア,Azoarcus olearius DQS,4~Tのゲノム配列を決定し,比較した他のAzoarcus株であった。ゲノム配列はAzoarcussp.BH72,モデル内生ジアゾ栄養生物が,五非植物関連株(Azoarcus CIB,Azoarcus EBN1,Azoarcus KH32C,A.toluclasticus MF63~TおよびAzoarcus PA01)低シンテニーと高いシンテニーを示した。平均ヌクレオチド同一性(ANI)はDQS,4~TはAzoarcus BH72,A.oleariusを種に含まれるべきと98.98%の同一性を共有することを明らかにした。DQS,4~Tのゲノムは植物コロニー形成と植物成長促進に関連するいくつかの遺伝子を含んでいた,窒素固定,植物接着と根表面コロニー形成である。これら遺伝子の存在と一致して,DQS,4~Tはイネ(Oryza sativa)とSetaria viridisコロニーを形成し,根の主に細胞間空間と通気組織内で観察された。草の成長を促進するが,A.olearius株による植物成長促進の機構(s)は知られていない,DQS,4~TとBH72のゲノムはインドール酢酸(IAA)合成もリン酸塩可溶化のための遺伝子を含有しなかった。その発生源にもかかわらず,両DQS,4~Tのゲノムと挙動は,それが内生窒素固定植物成長促進細菌であるする能力を有することを示唆した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ヌクレオチド ,  *イネ科 ,  *汚染土壌 ,  ゲノム ,  *遺伝 ,  窒素固定 ,  *表現型 ,  リン酸塩 ,  植物成長 ,  コロニー
準シソーラス用語： 植物成長促進細菌 ,  コロニー形成 ,  シンテニー ,  ゲノム配列 ,  *Azoarcus , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 油汚染土壌 ,  ジアゾ栄養生物 ,  Azoarcus ,  モデル ,  イネ科植物 ,  菌 ,  類似 ,  遺伝 ,  表現型