- 2021 - 2025 沖縄島北部の森林で生じた渡らない生活史は鳥類にどんな地域固有性をもたらしたか?
- 2018 - 2021 「天然の実験室」を活用した外来リス根絶と生態系回復に関する研究
- 2014 - 2019 海の島と陸の島に棲む希少鳥類・コマドリの地域的減少が遺伝的多様性に及ぼす影響評価
- 2011 - 2013 侵略的外来種ソウシチョウと在来生物群集の関係はシカ密度増加でどのように変化するか
- 2010 - 2012 トカラ列島における森林性鳥類の生物地理:渡瀬線を挟んだ島々での繁殖分布と集団構造
- 2009 - 2011 異所的集団の種分化研究と種分類学-DNAバーコードを超えて
- 2006 - 2008 鳥類は樹木病原菌の伝搬にどのくらい関与するのか?
- 2005 - 2007 島嶼性希少鳥類の遺伝的構造解析を応用した島嶼林ネットワークの評価
- 2003 - 2004 群集のプロセスを考慮した生態系管理の奄美大島における実践的試み
- 2002 - 2004 南西諸島北部地域における森林性希少鳥類アカヒゲの個体群動態のモデル化
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