清水隆之

シミズタカユキ | Shimizu Takayuki

所属機関・部署：
職名：准教授

研究分野 (5件)：分子生物学 , 機能生物化学 , 細胞生物学 , 植物分子、生理科学 , 応用微生物学

研究キーワード (8件)：シグナル伝達 , 硫化水素/ポリファルファー , システイン修飾 , レドックス制御 , 環境応答 , 紅色細菌/光合成細菌 , 植物 , 藻類

競争的資金等の研究課題 (18件)：

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論文 (15件)：

Tomo Kondo, Takayuki Shimizu. Translation Enhancement by a Short Nucleotide Insertion at 5′UTR: Application to an In Vitro Cell-Free System and a Photosynthetic Bacterium. Applied Microbiology. 2023
Takayuki Shimizu, Masaru Hashimoto, Tatsuru Masuda. Thioredoxin-2 Regulates SqrR-Mediated Polysulfide-Responsive Transcription via Reduction of a Polysulfide Link in SqrR. Antioxidants. 2023
Takayuki Shimizu, Tomoaki Ida, Giuliano T Antelo, Yuta Ihara, Joseph N Fakhoury, Shinji Masuda, David P Giedroc, Takaaki Akaike, Daiana A Capdevila, Tatsuru Masuda. Polysulfide metabolizing enzymes influence SqrR-mediated sulfide-induced transcription by impacting intracellular polysulfide dynamics. PNAS Nexus. 2023. 2. 3. pgad048
Rajalakshmi Balasubramanian, Koichi Hori, Takayuki Shimizu, Shingo Kasamatsu, Kae Okamura, Kan Tanaka, Hideshi Ihara, Shinji Masuda. The Sulfide-Responsive SqrR/BigR Homologous Regulator YgaV of Escherichia coli Controls Expression of Anaerobic Respiratory Genes and Antibiotic Tolerance. Antioxidants. 2022. 11. 12
Takayuki Shimizu, Toma Aritoshi, J. Thomas Beatty, Tatsuru Masuda. Persulfide-Responsive Transcription Factor SqrR Regulates Gene Transfer and Biofilm Formation via the Metabolic Modulation of Cyclic di-GMP in Rhodobacter capsulatus. Microorganisms. 2022. 10. 5. 908-908

MISC (9件)：

清水隆之. 細菌における超硫黄分子センシング機構と金属の関係性. 月間「アグリバイオ」. 2022. 6. 4. 58-62
清水隆之. 細菌における活性硫黄種センシング機構と金属の関係性. 月刊「細胞」. 2022. 54. 3. 26-28
清水隆之, 増田真二. 硫化水素・超硫黄分子のセンシング機構. 生化学. 2021. 93. 5. 637-642
清水隆之, 増田建. テトラピロールおよびGUN1プラスチドシグナルを介した葉緑体形成 (解説特集諸刃の剣 : 光合成との付き合い方). 光合成研究 = News letter. 2021. 31. 1. 50-62
清水隆之. 細菌性ウイルス様粒子GTAによる環境適応機構の分子基盤. Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications. 2021. 35

特許 (1件)：

書籍 (1件)：

基礎生命科学実験 = Introductory course in life science experiments
東京大学出版会 2021 ISBN:9784130622271

講演・口頭発表等 (54件)：

硫化水素がシロイヌナズナの葉緑体形成における光合成器官の制御に与える影響
(第65回日本植物生理学会 2024)
Cytosolic heme metabolism by alternative localization of heme oxygenase 1 in plant cells
(第65回日本植物生理学会 2024)
紅色光合成細菌をモデルとした超硫黄分子シグナル制御システムの解析
(第3回原核光合成生物シンポジウム 2024)
D&Iとどう付き合うか
(第41回植物生理若手の会 2024)
植物の光合成活性はpre-mRNAスプライシング制御を介して側根形態に反映される
(第46回分子生物学会 2023)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (2件)：

委員歴 (1件)：

受賞 (3件)：

所属学会 (4件)：

日本植物学会 , 日本植物生理学会 , 日本光合成学会 , 日本生化学会

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清水 隆之