研究者
J-GLOBAL ID：201801005138618374   更新日: 2024年04月09日

齋藤 徹

サイトウ トオル | Saito Toru
所属機関・部署：
広島市立大学 情報科学研究科医用情報科学専攻

広島市立大学 情報科学研究科医用情報科学専攻 について


職名： 准教授
研究分野 (3件)： 生物物理学 ,  無機・錯体化学 ,  基礎物理化学
研究キーワード (5件)： 多階層シミュレーション ,  半経験的分子軌道法 ,  強相関電子系 ,  酸化反応 ,  金属酵素
競争的資金等の研究課題 (9件)：
  • 2024 - 2027 酸化還元酵素の阻害活性予測モデルの開発
  • 2021 - 2024 金属酵素の酵素反応機構およびリガンド相互作用の定量的解明
  • 2022 - 2023 生体分子シミュレーションを用いたウレアーゼ阻害剤の設計
  • 2019 - 2022 生体分子中の窒素の特性を,中性子回折と計算化学により解明する
  • 2018 - 2019 新規医薬品設計に向けた薬物代謝反応の計算化学的研究
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論文 (100件)：
  • Miki Kaneko, Yu Takano, Toru Saito. C-H Bond Dissociation Enthalpy Prediction with Machine Learning Reinforced Semi-empirical Quantum Mechanical Calculations. Chemistry Letters. 2024. 53. upae016
  • Yuto Shiotake, Yu Takano, Toru Saito. Semi-empirical and machine learning-based prediction of site of metabolisms mediated by aldehyde oxidase. Chemical Physics Letters. 2023. 833. 140942-140942
  • Shunya Suenaga, Yu Takano, Toru Saito. Unraveling Binding Mechanism and Stability of Urease Inhibitors: A QM/MM MD Study. Molecules. 2023. 28. 6. 2697-2697
  • 齋藤徹. 開殻電子状態を有する生体高分子の分子シミュレーション. アンサンブル. 2023. 25. 13-18
  • May Myat Moe, Toru Saito, Midas Tsai, Jianbo Liu. Singlet O2Oxidation of the Radical Cation versus the Dehydrogenated Neutral Radical of 9-Methylguanine in a Watson-Crick Base Pair. Consequences of Structural Context. The Journal of Physical Chemistry B. 2022. 126. 29. 5458-5472
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MISC (2件)：
  • K. Yamaguchi, S. Yamanaka, H. Isobe, K. Kawakami, Y. Kitagawa, R. Takeda, T. Saito, M. Nishihara, M. Okumura. Instability in chemical bonds from broken-symmetry single-reference to symmetry-adapted multireference approaches to strongly correlated electron systems. AIP Conference Proceedings. 2009. 1108. 20-29
  • 庄司光男, 齋藤徹, 伊藤正秀, 小泉健一, 北河康隆, 山中秀介, 奥村光隆, 山口兆, 藤岡準治, 井頭麻子, et al. 七核銅錯体における電子状態と磁性についての理論的解明. 日本化学会講演予稿集. 2007. 87th. 1
書籍 (6件)：
  • Approximate spin projection for broken-symmetry method and its application" in Symmetry (Group Theory) and Mathematical Treatment in Chemistry
    IntechOpen 2018
  • “Approximate Spin Projection for Geometry Optimization of Biradical Systems: Case Studies of Through-Space and Through-Bond Systems” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics
    Springer Verlag 2012
  • Calculation of Magnetic Properties and Spectroscopic Parameters of Manganese Clusters with Density Functional Theory” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics
    Springer Verlag 2012
  • Density Functional Study of Manganese Complexes: Protonation Effects on Geometry and Magnetism” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics
    Springer Verlag 2012
  • Electronic and Spin Structures of the CaMn4O5(H2O)4 Cluster in OEC of PSII Refined to 1.9 Å X-ray Resolution" Advances in Quantum Chemistry
    Elsevier 2012
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講演・口頭発表等 (141件)：
  • QM計算とQM/MM-MD計算によるDNA塩基対の二重プロトン移動の機構解析
    (日本化学会第104春季年会 2024)
  • SQM-MLによる芳香族化合物のNMR化学シフトの自動予測
    (日本化学会第104春季年会 2024)
  • ケモインフォマティクスによるIDO1阻害剤の結合自由エネルギーの評価
    (日本化学会第104春季年会 2024)
  • SQM-MLモデルによる結合解離自由エネルギーの予測
    (日本化学会第104春季年会 2024)
  • 半経験的手法と機械学習を併用した薬物代謝部位予測
    (第51回構造活性相関シンポジウム 2023)
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学歴 (3件)：
  • 2009 - 2012 大阪大学 理学研究科 化学専攻 博士後期課程
  • 2007 - 2009 大阪大学 理学研究科 化学専攻 博士前期課程
  • 2003 - 2007 大阪大学 理学部 化学科
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (大阪大学)
経歴 (7件)：
  • 2023/04 - 現在 広島市立大学 大学院情報科学研究科 医用情報科学専攻 准教授
  • 2019/04 - 2023/03 広島市立大学 大学院情報科学研究科 医用情報科学専攻 講師
  • 2016/04 - 2019/03 広島市立大学 大学院情報科学研究科 医用情報科学専攻 助教
  • 2014/05 - 2016/03 大阪大学 大学院理学研究科 化学専攻 招へい研究員(兼任)
  • 2014/02 - 2016/03 大阪大学 未来戦略機構 第三部門 特任助教(常勤)
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受賞 (7件)：
  • 2024/03 - 指導学生の受賞:最優秀修士学位論文賞「量子化学計算と機械学習を併用した薬物代謝部位予測法の開発」
  • 2024/03 - 指導学生の受賞:最優秀卒業論文賞「量子化学計算と機械学習を併用した反応速度定数の予測」
  • 2023/03 - 指導学生の受賞:最優秀卒業論文賞「自由エネルギー解析に基づく ウレアーゼ阻害能の定量的評価」
  • 2022/06 - 日本蛋白質科学会 日本蛋白質科学会若手奨励賞
  • 2022/03 - 広島市立大学 教員表彰(研究および社会貢献)
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所属学会 (4件)：
日本蛋白質科学会 ,  日本化学会 ,  分子科学会 ,  理論化学会
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