研究者
J-GLOBAL ID:201801006323904398   更新日: 2024年02月01日

森 智弥

モリ トモヤ | Mori Tomoya
所属機関・部署:
職名: 助教
ホームページURL (1件): https://kdb.iimc.kyoto-u.ac.jp/profile_private/ja.22dad5ec779719b8.html
研究分野 (1件): 生命、健康、医療情報学
研究キーワード (4件): 空間オミクス解析 ,  シングルセルオミクス解析 ,  離散アルゴリズム ,  バイオインフォマティクス
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2023 - 2026 空間オミクスに基づく生体組織ドメイン推定および解析法の確立
  • 2019 - 2022 単一細胞オミックスデータに基づく細胞系譜推定および比較アルゴリズムの開発
  • 2017 - 2019 DNAメチル化情報に基づく細胞の詳細な分類と評価手法の開発
  • 2014 - 2016 確率ブーリアンネットワークを用いた細胞内シグナル伝達機構のモデル化とその解析
論文 (19件):
  • Tomoya Mori, Toshiro Takase, Kuan-Chun Lan, Junko Yamane, Cantas Alev, Azuma Kimura, Kenji Osafune, Jun K. Yamashita, Tatsuya Akutsu, Hiroaki Kitano, et al. eSPRESSO: topological clustering of single-cell transcriptomics data to reveal informative genes for spatio-temporal architectures of cells. BMC Bioinformatics. 2023. 24. 1
  • Feiqi Wang, Tatsuya Akutsu, Tomoya Mori. Metrics for RNA Secondary Structure Comparison. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2586. 79-88
  • Tatsuya Akutsu, Tomoya Mori, Naotoshi Nakamura, Satoshi Kozawa, Yuhei Ueno, Thomas N Sato. On the complexity of tree edit distance with variables. 33rd International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2022). 2022. 248. 44:1-44:14
  • Reiichi Sugihara, Yuki Kato, Tomoya Mori, Yukio Kawahara. Alignment of single-cell trajectory trees with CAPITAL. Nature Communications. 2022. 13. 1
  • Tomoya Mori, Tatsuya Akutsu. Attractor detection and enumeration algorithms for Boolean networks. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2022. 20. 2512-2520
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MISC (7件):
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特許 (2件):
書籍 (3件):
  • RNA Structure Prediction, Methods in Molecular Biology
    Humana, New York 2023 ISBN:9781071627679
  • 実験医学別冊 空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド
    羊土社 2022 ISBN:9784758122610
  • 実験医学増刊34(17):再生医療と疾患解明の鍵となる組織幹細胞
    羊土社 2016 ISBN:9784758103589
講演・口頭発表等 (11件):
  • Periodic attractor identification using a priori information in Boolean networks
    (International Conference On Intelligent Computing 2022)
  • 空間トランスクリプトームの自己組織化マップクラスタリングによる三次元組織インシリコ再構築
    (第3回幹細胞情報学研究イニシアチブ研究会 2021)
  • 分岐を考慮した時系列シングルセルデータのアラインメント
    (第61回BIO研究発表会 2020)
  • 自己組織化マップによるマウス原腸胚構造 in silico 三次元再構築と空間識別遺伝子の同定
    (第42回 日本分子生物学会年会 2019)
  • Novel computational model of gastrula morphogenesis to identify spatial discriminator genes by self-organizing map (SOM) clustering
    (Japan-Germany International Workshop 2019-1 The Human Cell Type Authentication Initiative 2019)
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学歴 (3件):
  • 2012 - 2015 京都大学 大学院情報学研究科 知能情報学専攻
  • 2010 - 2012 京都大学 大学院情報学研究科 知能情報学専攻
  • 2006 - 2010 同志社大学 工学部 インテリジェント情報工学科
学位 (1件):
  • 博士(情報学) (京都大学)
経歴 (6件):
  • 2018/04/01 - 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 助教
  • 2016/04/01 - 京都大学 iPS細胞研究所 特定研究員
  • 2015/11/01 - 京都大学 iPS細胞研究所 日本学術振興会 特別研究員 (PD)
  • 2015/10/01 - 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 日本学術振興会 特別研究員 (PD)
  • 2014/04/01 - 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 日本学術振興会 特別研究員 (DC2)
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委員歴 (5件):
  • 2023/06 - 現在 情報処理学会 論文誌ジャーナル/JIP編集委員会 小委員会(基盤グループ [Computing Group])編集委員
  • 2022/04 - 現在 情報処理学会 論文誌数理モデル化と応用編集委員会
  • 2021/04 - 現在 情報処理学会 論文誌バイオ情報学編集委員会
  • 2021/03 - 現在 Frontiers in Genetics Review Editor
  • 2019/04 - 2023/03 情報処理学会 調査研究運営委員会 バイオ情報学研究運営委員
受賞 (2件):
  • 2013/03 - 情報処理学会 山下記念研究賞
  • 2012/03 - 情報処理学会バイオ情報学研究会 学生奨励賞
所属学会 (2件):
情報処理学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会
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