研究者
J-GLOBAL ID:201801006895806923
更新日: 2024年11月16日
谷沢 靖洋
Tanizawa Yasuhiro
所属機関・部署:
職名:
助教
競争的資金等の研究課題 (2件):
- 2020 - 2023 ゼニゴケゲノムDBの拡張開発と仮想化技術を応用した高可搬性ゲノムDBの開発
- 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
論文 (73件):
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Yuki Matsumoto, Claire Yik-Lok Chung, Sachiko Isobe, Mika Sakamoto, Xiao Lin, Ting-Fung Chan, Hideki Hirakawa, Genki Ishihara, Hon-Ming Lam, Shinobu Nakayama, et al. Chromosome-scale assembly with improved annotation provides insights into breed-wide genomic structure and diversity in domestic cats. Journal of advanced research. 2024
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Yuichi Kodama, Takeshi Ara, Asami Fukuda, Toshiaki Tokimatsu, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2024: the DDBJ Group Cloud service for sharing pre-publication data. Nucleic acids research. 2024
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Yuki Matsumoto, Claire Yik-Lok Chung, Sachiko Isobe, Mika Sakamoto, Xiao Lin, Ting-Fung Chan, Hideki Hirakawa, Genki Ishihara, Hon-Ming Lam, Shinobu Nakayama, et al. Chromosome-scale assembly with improved annotation provides insights into breed-wide genomic structure and diversity in domestic cats. Journal of Advanced Research. 2024
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Kenji Yamane, Yasuhiro Tanizawa, Hisami Kobayashi, Tomomi Kamizono, Yoichiro Kojima, Hiroki Takagi, Masanori Tohno. Proposal of Lactobacillus amylovorus subsp. animalis subsp. nov. and an emended description of Lactobacillus amylovorus. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2024. 74. 9
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Mohamed Elmanzalawi, Takatomo Fujisawa, Hiroshi Mori, Yasukazu Nakamura, Yasuhiro Tanizawa. DFAST_QC: Quality Assessment and Taxonomic Identification Tool for Prokaryotic Genomes. biorxiv (preprint). 2024
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MISC (57件):
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望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一. 様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン. 育種学研究. 2024. 26
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坂本美佳, 松前ひろみ, 小木曽映里, 望月孝子, 谷澤靖洋, KRYUKOV Kirill, 今西規, 豊田敦, 亀井克彦, 細矢剛, et al. 新規遺伝子アノテーションで明らかになるスエヒロタケ複数株におけるゲノム構成の違い. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
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黒谷賢一, 平川秀樹, 白澤健太, 谷澤靖洋, 中村保一, 磯部祥子, 野田口理孝, 野田口理孝. 生物間相互作用のモデル植物であるNicotiana benthamianaのゲノム解読. 日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM). 2023. 87th
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谷澤靖洋, 川村省吾, ROMANI Facundo, 矢倉勝, 望月孝子, 坂本美佳, 山岡尚平, 西浜竜一, 中村保一, 大和勝幸, et al. Marpolbase:ゼニゴケのための遺伝子情報および発現量データベースの開発. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
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衣川達己, 谷澤靖洋, 中村保一, 伊藤武彦, 田中裕之, 平川英樹, 篠澤章久, 篠澤章久, 馬場正, 小田賢司, et al. モモ25品種の比較ゲノム解析. 園芸学研究 別冊. 2023. 22. 1
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書籍 (4件):
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月刊アグリバイオ 2023年3月号 特集:コケ植物:遺伝子資源と機能応用
北隆館 2023
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メタゲノムデータ解析 : 16Sも!ショットガンも!ロングリードも!菌叢解析が得意になる凄技レシピ
羊土社 2021 ISBN:9784758122559
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実験医学別冊・独習 Pythonバイオ情報解析
羊土社 2021
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次世代シークエンサーDRY解析教本 改訂第2版
学研メディカル秀潤社, 学研プラス(発売) 2019 ISBN:9784780909838
講演・口頭発表等 (8件):
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Database resources of DDBJ for microbial genome assemblies and annotations
(2023)
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High quality reference genome sequences of liverwort Toward completion of the Marchantia Genome Project
(Taiwan Japan Plant Biology 2023)
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Microbial Genome Analysis
(Thailand-Japan Bilateral Workshop on Bioinformatics and Bioresources 2022)
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ゲノム解析から紐解く乳酸菌の多様性
(日本乳酸菌学会設立30周年記念シンポジウム 2021)
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DDBJにおけるSARS-Cov-2ゲノムのデータ登録・公開への取り組み
(2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・ 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021) 2021)
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学位 (1件):
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