研究者
J-GLOBAL ID:201801007866743153   更新日: 2024年03月11日

河口 理紗

カワグチ リサ | Kawaguchi Risa K
所属機関・部署:
職名: 講師
ホームページURL (2件): https://carushi.github.io/cb_lab/index.htmlhttps://carushi.github.io/cb_lab/index_en.html
研究分野 (3件): 分子生物学 ,  システムゲノム科学 ,  生命、健康、医療情報学
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2023 - 2027 一細胞オミクス解析の揺らぎを利用した転写因子の細胞種特異的パイオニアネス予測
  • 2023 - 2023 iPS細胞の分化過程における転写因子のパイオニアネス変化予測
  • 2017 - 2020 多階層共分散ネットワークによるオミクス間制御ファクターの解明
  • 2014 - 2017 RNA二次構造におけるゲノムワイドな変異解析アルゴリズムの開発と進化解析への応用
論文 (19件):
  • Sara Ballouz, Risa Karakida Kawaguchi, Maria T. Pena, Stephan Fischer, Megan Crow, Leon French, Frank M. Knight, Linda B. Adams, Jesse Gillis. The transcriptional legacy of developmental stochasticity. Nature Communications. 2023. 14. 1
  • Naoki Takizawa, Risa Karakida Kawaguchi. Comprehensive in virio structure probing analysis of the influenza A virus identifies functional RNA structures involved in viral genome replication. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023
  • Risa Karakida Kawaguchi, Hisanori Kiryu. RNA Secondary Structure Alteration Caused by Single Nucleotide Variants. Methods in Molecular Biology. 2023. 2586. 107-120
  • Risa Karakida Kawaguchi, Hisanori Kiryu. Genome-Wide RNA Secondary Structure Prediction. Methods in Molecular Biology. 2023. 2586. 35-48
  • Risa Karakida Kawaguchi, Ziqi Tang, Stephan Fischer, Chandana Rajesh, Rohit Tripathy, Peter K Koo, Jesse Gillis. Learning single-cell chromatin accessibility profiles using meta-analytic marker genes. Briefings in Bioinformatics. 2022
もっと見る
MISC (3件):
書籍 (3件):
  • マルチオミクス : データ駆動時代の疾患研究 : がん、老化、生活習慣病 : 最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明
    羊土社 2023 ISBN:9784758104135
  • RNA Structure Prediction, Methods in Molecular Biology
    Humana, New York. 2023 ISBN:9781071627686
  • 実験医学増刊 Vol.35 No.10 がん代謝 ワールブルグを超えて全容解明に挑む
    羊土社 2017
学歴 (3件):
  • 2014 - 2017 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻
  • 2012 - 2014 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻
  • 2008 - 2012 東京大学 理学部 生物情報科学科
学位 (1件):
  • Ph.D. (東京大学)
経歴 (7件):
  • 2023/04 - 現在 国立研究開発法人産業技術総合研究所 人工知能研究センター(インテリジェントバイオインフォマティクス研究チーム) 外来研究員
  • 2022/05 - 現在 京都大学 iPS細胞研究所 未来生命科学開拓部門 講師
  • 2019/04 - 2022/04 コールドスプリングハーバー研究所(米国) ポストドクトラルフェロー
  • 2019/04 - 2022/03 国立研究開発法人産業技術総合研究所 人工知能研究センター 外来研究員
  • 2017/04 - 2020/03 国立がん研究センター研究所 がん分子修飾制御学分野 外来研究員
全件表示
委員歴 (7件):
  • 2023/04 - 2025/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
  • 2021/09 - 2021/09 IIBMP2021 プログラム委員
  • 2018/04 - 2019/03 生命科学系フロンティアミーティング 運営委員
  • 2014 - 2019 生命情報科学若手の会 運営委員
  • 2017/04 - 2018/03 生命情報科学若手の会 代表
全件表示
受賞 (6件):
  • 2021/03 - 公益財団法人上原記念生命科学財団 海外留学助成 ポストドクトラルフェローシップ
  • 2018/09 - 日本バイオインフォマティクス学会 ポスター賞
  • 2017/03 - 東京大学大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 ERA (Excellent Research Awards) 賞
  • 2017/03 - 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 研究科長賞
  • 2016 - 東京大学大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 英語論文発表会 優秀口頭発表賞
全件表示
※ J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。 登録・更新については、こちらをご覧ください。

前のページに戻る