研究者
J-GLOBAL ID:201801010026608450   更新日: 2024年07月25日

大滝 大樹

オオタキ ヒロキ | Otaki Hiroki
所属機関・部署:
職名: 助教
研究分野 (4件): 生物物理学 ,  薬系化学、創薬科学 ,  生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 ,  基礎物理化学
研究キーワード (4件): 化学物理 ,  生物物理 ,  計算化学 ,  量子化学
論文 (28件):
  • Hiroki Otaki, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii, Yuji Sugita, Kiyoshi Yagi. Similarity scores of vibrational spectra reveal the atomistic structure of pentapeptides in multiple basins. Physical Chemistry Chemical Physics. 2024. 26. 13. 9906-9914
  • Hiroki Otaki, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii, Yuji Sugita, Kiyoshi Yagi. Similarity scores of vibrational spectra reveal the atomistic structure of pentapeptides in multiple basins. ChemRxiv. 2023. 10.26434/chemrxiv-2023-qn9rc
  • Toshihide Maki, Zheyang Zhou, Yukari Irie, Takahide Matsunaga, Takae Onodera, Shoji Imamichi, Yuka Sasaki, Mitsuko Masutani, Hiroki Otaki, Eri Sakuda, et al. Singlet-oxygen photosensitizers with a tetrad structure and a single BODIPY chromophore: An evidence for transition state stabilization of intersystem crossing. Dyes and Pigments. 2022. 210. 110963-110963
  • Hiroki Otaki, Yuzuru Taguchi, Noriyuki Nishida. Conformation-Dependent Influences of Hydrophobic Amino Acids in Two In-Register Parallel β-Sheet Amyloids, an α-Synuclein Amyloid and a Local Structural Model of PrPSc. ACS Omega. 2022. 7. 35. 31271-31288
  • Satoshi Mizuta, Hiroki Otaki, Takeshi Ishikawa, Juliann Nzembi Makau, Tomoko Yamaguchi, Takuya Fujimoto, Nobuyuki Takakura, Nobuki Sakauchi, Shuji Kitamura, Hikaru Nono, et al. Lead Optimization of Influenza Virus RNA Polymerase Inhibitors Targeting PA-PB1 Interaction. Journal of Medicinal Chemistry. 2022. 65. 1. 369-385
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MISC (11件):
  • 大滝大樹. 分子動力学計算を用いたDNA分解酵素の失活メカニズムの解明. スーパーコンピューティングニュース. 2024. 26. 2. 47-51
  • 大滝大樹. 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析. スーパーコンピューティングニュース. 2022. 24. 3. 81-87
  • 大滝大樹. 分子動力学シミュレーションによる自己炎症性疾患に関わるタンパク質の研究. スーパーコンピューティングニュース. 2021. 23. 特集号1. 28-34
  • 水田賢志, 大滝大樹, 渡邊健. インフルエンザRNAポリメラーゼを阻害するキノリノン誘導体の開発研究. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2021. 141st
  • 水田賢志, 大滝大樹, 渡邊健. インフルエンザRNAポリメラーゼPA-PB1蛋白質間相互作用阻害剤の開発研究. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2020. 140th
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特許 (5件):
  • キノリノン化合物および抗RNAウイルス薬
  • 抗ウィルス薬
  • キノリノン化合物および抗RNAウイルス治療薬
  • 荷電粒子線応用装置
  • 荷電粒子線応用装置
書籍 (1件):
  • Molecular Spectroscopy: A Quantum Chemistry Approach
    Wiley-VCH 2019 ISBN:9783527344611
講演・口頭発表等 (77件):
  • Designing cyclic peptides to inhibit pathogenic amyloid conversion in human prion diseases as potential therapeutic agents
    (第1回AMED-SCARDA「ワクチン開発のための世界トップレベル研究開発拠点の形成事業」合同シンポジウム 2024)
  • 分子動力学シミュレーションと残基間相互作用ネットワークによるDNA分解酵素変異体の相互作用解析
    (日本化学会 第103春季年会 2023)
  • 分子動力学計算とネットワークグラフを用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析
    (第36回分子シミュレーション討論会 2022)
  • 分子動力学計算とネットワーク解析を用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析
    (第128回日本物理学会九州支部例会 2022)
  • Molecular dynamics study of the three prime repair exonuclease 1 and its mutants
    (第60回日本生物物理学会年会 2022)
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学歴 (4件):
  • 2013 - 京都大学
  • 2009 - 2012 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻
  • 2005 - 2007 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻
  • 2001 - 2005 京都大学 理学部 理学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (7件):
  • 2023/04 - 現在 長崎大学 薬学部 助教
  • 2015/07 - 現在 長崎大学 大学院医歯薬学総合研究科 助教
  • 2015/07 - 2024/03 国立研究開発法人理化学研究所 客員研究員
  • 2015/04 - 2015/06 国立研究開発法人理化学研究所 特別研究員
  • 2013/04 - 2015/03 工学院大学 基礎・教養教育部門 非常勤講師
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受賞 (2件):
  • 2012/02 - 2012 NTHU-KAIST-KYOTO Junior Chemist Symposium Best PowerPoint Presentation Award
  • 2011/10 - 分子科学会 第5回分子科学討論会 分子科学会優秀ポスター賞
所属学会 (6件):
日本物理学会 ,  分子科学会 ,  分子シミュレーション学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  CBI学会 ,  日本生物物理学会
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