研究者
J-GLOBAL ID:201801010559076795   更新日: 2024年03月30日

小田 隆

オダ タカシ | Oda Takashi
所属機関・部署:
職名: 研究員
研究分野 (1件): 構造生物化学
研究キーワード (7件): 古細菌 ,  DNA修復 ,  中性子小角散乱 ,  天然変性タンパク質 ,  X線小角散乱 ,  X線結晶構造解析 ,  構造生物学
競争的資金等の研究課題 (7件):
  • 2020 - 2023 新規標的因子が関わるパラミクソウイルスC蛋白質の機能とその分子基盤, 病原性解明
  • 2020 - 2023 配列が著しく異なる2つの天然変性タンパク質に共通する構造と機能の解明
  • 2018 - 2023 新世代中性子構造生物学の開拓
  • 2018 - 2021 セグメント重水素化中性子散乱法による天然変性タンパク質の動的構造解析
  • 2017 - 2018 天然変性タンパク質Hefの揺らいだ構造と機能の解明
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論文 (29件):
  • Rintaro Inoue, Tomotaka Oroguchi, Takashi Oda, Bela Farago, Anne Martel, Lionel Porcar, Mamoru Sato, Masaaki Sugiyama. Internal dynamics of multidomain protein as revealed by an optimized neutron spin echo measurement and all-atom molecular dynamics simulation. Physical Review Research. 2023. 5. 4
  • Yusuke Nakasone, Hiroto Murakami, Shunrou Tokonami, Takashi Oda, Masahide Terazima. Time-resolved study on signaling pathway of photoactivated adenylate cyclase and its nonlinear optical response. The Journal of biological chemistry. 2023. 105285-105285
  • Hideaki Ohtomo, Tsutomu Yamane, Takashi Oda, Noriyuki Kodera, Jun-ichi Kurita, Yasuo Tsunaka, Romain Amyot, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura. Dynamic solution structures of whole human NAP1 dimer bound to one and two histone H2A-H2B heterodimers obtained by integrative methods. Journal of Molecular Biology. 2023. 168189-168189
  • Michinari Maekawa, Takashi Oda, Ryo Hanai. Biochemical analysis of the replication initiator protein of staphylococcal plasmid pC194. Biochimie. 2022
  • Taiki Tominaga, Hiroshi Nakagawa, Masae Sahara, Takashi Oda, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama. Data Collection for Dilute Protein Solutions via a Neutron Backscattering Spectrometer. Life (Basel, Switzerland). 2022. 12. 5
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MISC (32件):
  • 中川洋, 井上倫太郎, 小田隆, 小田隆, 矢木(内海)真穂, 斉尾智英, 苙口友隆, 長田裕也, 杉山正明, 佐藤衛, et al. 蛋白質の階層構造ダイナミクスの解明. 量子ビームサイエンスフェスタ(Web). 2023. 2022
  • 富永大輝, 中川洋, 佐原雅恵, 小田隆, 井上倫太郎, 杉山正明. BL02による希薄タンパク質溶液のデータ収集最適化. 量子ビームサイエンスフェスタ(Web). 2023. 2022
  • 井上倫太郎, 小田隆, 中川洋, 富永大輝, 川北至信, 佐藤衛, 杉山正明. 小角散乱及び中性子準弾性散乱によるHef-IDRの構造・ダイナミクス解析. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2022. 22nd (Web)
  • 小田隆, 小田隆, 井上倫太郎, 富永大輝, 中川洋, 守島健, 岩瀬裕希, 石野良純, 佐藤衛, 杉山正明. 好熱性古細菌由来天然変性タンパク質の生理的温度における動的構造とダイナミクス. 日本中性子科学会年会講演概要集. 2022. 22nd
  • 小田隆, 大井里香, 古寺哲幸, 安藤敏夫, 小沼剛, 菅瀬謙治, 苙口友隆, 井上倫太郎, 杉山正明, 石野園子, et al. X線小角散乱と計算科学を用いた統合的解析による天然変性タンパク質の動的構造と機能の理解. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2022. 2022
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講演・口頭発表等 (19件):
  • 区分重水素化タンパク質を用いた中性子小角散乱解析
    (日本中性子科学会第23回年会 2023)
  • Analysis of flexible structure of multi-domain protein by SANS using segment deuteration technique.
    (IUCr2023 2023)
  • 好熱性古細菌由来天然変性タンパク質の生理的温度における動的構造とダイナミクス
    (2022)
  • 中性子散乱実験に向けた区分重水素化タンパク質の調製
    (2021)
  • DNA修復にかかわるHefの天然変性領域の揺らいだ構造と機能
    (第4回LLPS研究会・ASUKA若手交流会2019 2019)
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学位 (1件):
  • 博士(理学) (横浜市立大学)
経歴 (3件):
  • 2023/04 - 現在 日本原子力研究開発機構 J-PARCセンター 研究員
  • 2020/04 - 2023/03 立教大学 理学部 生命理学科 助教
  • 2009/04 - 2020/03 横浜市立大学 博士研究員 / 特任助教
委員歴 (1件):
  • 2019/04 - 現在 PF 小角散乱ユーザーグループ 幹事
所属学会 (4件):
日本農芸化学会 ,  日本中性子科学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本生物物理学会
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