- 2024 - 2028 回遊魚の森-川-海ネットワーク構造推定のための大規模な同位体地図の作成とその応用
- 2024 - 2028 温暖化に対するアユ個体群の頑強性と河川連続性・分断との関係解明
- 2023 - 2027 流域・河道の洪水撹乱評価手法を用いた河川生物群集レジリエンスの実証的研究
- 2023 - 2024 氾濫原-輪中景観における災害軽減/生態系保全のための自然・文化を基盤とする解決策の体系化:持続的な地域の共創に向けた社会規範の再構築に向けて
- 2023 - 2024 耳石ストロンチウム同位体比で暴くアユの流域内生息場所利用の履歴
- 2020 - 2024 Eco-DRR施設群の性能評価および最適計画に関する基礎的研究
- 2019 - 2022 河床環境-河床変動統合解析による石礫床河川の生息場時空間動態の解明
- 2019 - 2022 山地河川における環境DNAを用いた水生生物分布推定手法の最適化に関する研究
- 2016 - 2021 木曽三川流域における生物群集を対象とした河川生態系の管理手法に関する研究
- 2017 - 2020 溶存酸素動態を新機軸とする永続可能な河川ワンド環境のインテリジェントデザイン
- 2016 - 2019 河川中上流域における河床環境評価と河床変動解析を統合した数値解析モデルの開発
- 2017 - 2019 木曽川における近年のイシガイ科二枚貝類生息量の変化とその要因~約10年前と現在の比較から~
- 2016 - 2017 河道掘削後に自然形成された氾濫原水域におけるイシガイ類生息環境の変化
- 2014 - 2017 流域地質に依存する河川ハビタット構造と魚類群集に対する土砂量レジーム変化の影響
- 2013 - 2017 流域地質構造が河川景観に及ぼす影響の解明とそれを踏まえた河道設計・管理手法の構築
- 2011 - 2015 生態系の連結性が生物多様性に与える影響とその再生手法に関する研究
- 2013 - 2014 沖積河川における深掘れの分布要因と形成プロセスに関する研究
- 2012 - 2013 沖積河川における露盤化と深掘れの変遷および実態に関する研究
- 2012 - 2013 ダムによる下流河川への影響は、流程に沿ってどのように変化するか?河床および瀬・淵構造と付着藻類に注目して
- 2010 - 2011 横断構造物の切り下げが魚類生息環境に与える影響と斜路式およびプール型魚道の機能評価
- 2007 - 2008 河川景観要素に対する魚類群集構造の応答に関する研究
- ダム下流で改善すべき環境要因の優先順位付け
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