研究者
J-GLOBAL ID:201801012716341050   更新日: 2024年08月14日

岡嵜 友輔

オカザキ ユウスケ | Okazaki Yusuke
所属機関・部署:
職名: 助教
ホームページURL (1件): https://yusukeokazaki.weebly.com/
研究分野 (4件): ゲノム生物学 ,  進化生物学 ,  生態学、環境学 ,  水圏生命科学
研究キーワード (6件): ウイルス ,  細菌 ,  メタゲノム ,  琵琶湖 ,  陸水学 ,  微生物生態学
競争的資金等の研究課題 (16件):
  • 2023 - 2030 湖間比較で拓く高解像度な生態系多様性研究基盤
  • 2024 - 2027 細菌由来サブミクロン粒子が生物ポンプを駆動する可能性の探索
  • 2022 - 2027 ウイルスによる赤潮崩壊現象を裏打ちする分子生態学的メカニズムに関する研究
  • 2022 - 2026 湖沼の深水層に卓越する未知の有機物循環系の解明
  • 2022 - 2026 無光層-太陽光の届かない水圏-に棲息する巨大ウイルスの生態
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論文 (24件):
  • Junyi Wu, Lingjie Meng, Morgan Gaïa, Hiroyuki Hikida, Yusuke Okazaki, Hisashi Endo, Hiroyuki Ogata. Gene transfer among viruses substantially contributes to gene gain of giant viruses. Molecular biology and evolution. 2024
  • Yosuke Nishimura, Kohei Yamada, Yusuke Okazaki, Hiroyuki Ogata. DiGAlign: Versatile and Interactive Visualization of Sequence Alignment for Comparative Genomics. 2024. 39. 1. ME23061
  • 岡崎友輔. 技術が拓く湖沼微生物生態学の最前線. 陸水学雑誌. 2024. 85. 1. 1-24
  • Hiroaki Fujita, Masayuki Ushio, Kenta Suzuki, Masato S. Abe, Masato Yamamichi, Yusuke Okazaki, Alberto Canarini, Ibuki Hayashi, Keitaro Fukushima, Shinji Fukuda, et al. Metagenomic analysis of ecological niche overlap and community collapse in microbiome dynamics. Frontiers in Microbiology. 2023. 14
  • Hiroyuki Hikida, Yusuke Okazaki, Ruixuan Zhang, Thi Tuyen Nguyen, Hiroyuki Ogata. A rapid genome-wide analysis of isolated giant viruses using MinION sequencing. Environmental microbiology. 2023
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MISC (10件):
  • 岡崎友輔. 大水深淡水湖のユニークな微生物生態系. 海洋化学研究. 2022. 35. 1. 39-42
  • 疋田弘之, 岡崎友輔, 緒方博之. ナノポアシークエンスによる巨大ウイルスゲノムの解析手法評価. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
  • 岡﨑 友輔. 湖沼の微生物生態系が教えてくれること. 日本微生物生態学会誌. 2021. 36. 2. 80-82
  • 岡崎友輔. 一杯の湖水に秘められた難題. 生物工学会誌. 2020. 98. 11. 619
  • 岡崎友輔. ネオウイルス学に出会うまで. ネオウイルス学ニュースレター. 2019. 6. 3-5
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講演・口頭発表等 (15件):
  • Low Infection Rate and Heterogeneous Virus-Host Interaction Among Freshwater Bacteria Revealed at the Single-Cell Resolution
    (Viruses of Microbes meeting 2024 2024)
  • High-resolution microbial eco-genomics in deep freshwater lakes
    (13th Asian Symposium on Microbial Ecology 2023)
  • 大水深淡水湖を対象とした微生物網羅的環境ゲノムデータベースの構築
    (日本陸水学会 第87回大会 2023)
  • Single-cell genomics uncovers microbial genomic microdiversity and virus-host interactions that had eluded high-resolution metagenomics
    (The Local Pangenome workshop 2023)
  • Single cell genomics uncovered uncultured virus-host links in a deep freshwater lake
    (Symposium of Aquatic Microbial Ecology (SAME17) 2023)
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学歴 (3件):
  • 2015 - 2018 京都大学 理学研究科 生物科学専攻 博士課程
  • 2010 - 2012 京都大学 理学研究科 生物科学専攻 修士課程
  • 2006 - 2010 京都大学 理学部
学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (5件):
  • 2023/04 - 現在 京都大学 創発PI
  • 2020/12 - 現在 京都大学 化学研究所 助教
  • 2018/04 - 2020/11 日本学術振興会特別研究員(PD)
  • 2015/04 - 2018/03 日本学術振興会特別研究員(DC1)
  • 2012/04 - 2015/03 三菱総合研究所 研究員
委員歴 (2件):
  • 2022/02 - 2025/12 日本陸水学会 企画委員
  • 2023/01 - 2024/12 日本陸水学会 将来計画ワーキンググループ
受賞 (2件):
  • 2022/09 - 日本陸水学会 第24回 吉村賞
  • 2018/03 - 日本学術振興会 第8回 育志賞
所属学会 (5件):
日本バイオインフォマティクス学会 ,  アメリカ微生物学会(ASM) ,  国際微生物生態学会(ISME) ,  日本陸水学会 ,  日本微生物生態学会
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