研究者
J-GLOBAL ID:201801012716341050   更新日: 2025年12月03日

岡嵜 友輔

オカザキ ユウスケ | Okazaki Yusuke
所属機関・部署:
職名: 助教
ホームページURL (1件): https://yusukeokazaki.weebly.com/
研究分野 (4件): ゲノム生物学 ,  進化生物学 ,  生態学、環境学 ,  水圏生命科学
研究キーワード (6件): ウイルス ,  細菌 ,  メタゲノム ,  琵琶湖 ,  陸水学 ,  微生物生態学
競争的資金等の研究課題 (17件):
  • 2023 - 2029 湖間比較で拓く高解像度な生態系多様性研究基盤
  • 2025 - 2028 湖の深水層で優占する難培養細菌群の効率的単離法の確立とその生理生態の実験的検証
  • 2025 - 2027 湖沼で優占する細菌の難培養性の背景にある適応進化の解明
  • 2024 - 2027 細菌由来サブミクロン粒子が生物ポンプを駆動する可能性の探索
  • 2022 - 2027 ウイルスによる赤潮崩壊現象を裏打ちする分子生態学的メカニズムに関する研究
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論文 (32件):
  • Wenwen Liu, Komei Nagasaka, Junyi Wu, Hiroki Ban, Ethan Mimick, Lingjie Meng, Russell Y Neches, Mohammad Moniruzzaman, Takashi Yoshida, Yosuke Nishimura, et al. Giant viruses specific to deep oceans show persistent presence and activity. mSystems. 2025. e0093225
  • Morimaru Kida, Ayuri Ohira, Yusuke Okazaki, Yasuhiko T. Yamaguchi, Akiko S. Goto, Kazuhide Hayakawa, Hiroshi Nishimura. Couples in the deep: dissolved organic and microbial communities in the oxygenated hypolimnion of a deep freshwater lake. 2025
  • Clafy Fernandes, Markus Haber, Paul Layoun, Maria-Cecilia Chiriac, Paul-Adrian Bulzu, Rohit Ghai, Vojtech Kasalicky, Tanja Shabarova, Hans-Peter Grossar, Jason Woodhouse, et al. Ecophysiology and global dispersal of the freshwater SAR11-IIIb genus Fontibacterium. Nature Microbiology. 2025. 10. 9. 2194-2206
  • Yusuke Okazaki, Yohei Nishikawa, Ryota Wagatsuma, Haruko Takeyama, Shin-ichi Nakano. Contrasting defense strategies of oligotrophs and copiotrophs revealed by single-cell-resolved virus-host pairing of freshwater bacteria. ISME Communications. 2025. ycaf086
  • Chiriac, M.C., Layoun, P., Fernandes, C., Szoke-Nagy, T., Kasalicky, V., Okazaki, Y., Woodhouse, J., Grossart, H.-P., Piwosz, K., Znachor, P., et al. Ecological success in freshwater lakes: insights from novel cultivated lineages of the abundant Nanopelagicales order. Microbiome. 2025
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MISC (13件):
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講演・口頭発表等 (21件):
  • Genomic individuality of lake bacteria at the single-cell level reflects their ecological strategies
    (International Meeting of the Microiological Society of Korea 2025 (MSK2025) 2025)
  • Hypolimnion-specific bacteria in a monomictic lake modulate their gene expression to survive winter holomixis
    (Symposium of Aquatic Microbial Ecology (SAME18) 2025)
  • 大水深湖を対象とした微生物環境ゲノムデータベースの構築
    (日本陸水学会 第89回大会 2025)
  • Unraveling genomic diversification in lake bacterioplankton through high-resolution eco-genomics
    (The 19th International Symposium on River and Lake Environment 2024)
  • シングルセルゲノム解析を用いた環境ウイルスの宿主同定と感染率評価
    (第37回日本微生物生態学会大会 2024)
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学歴 (3件):
  • 2015 - 2018 京都大学 理学研究科 生物科学専攻 博士課程
  • 2010 - 2012 京都大学 理学研究科 生物科学専攻 修士課程
  • 2006 - 2010 京都大学 理学部
学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (5件):
  • 2023/04 - 現在 京都大学 創発PI
  • 2020/12 - 現在 京都大学 化学研究所 助教
  • 2018/04 - 2020/11 日本学術振興会特別研究員(PD)
  • 2015/04 - 2018/03 日本学術振興会特別研究員(DC1)
  • 2012/04 - 2015/03 三菱総合研究所 研究員
委員歴 (4件):
  • 2025/04 - 2027/03 日本微生物生態学会評議員
  • 2025/01 - 2026/12 日本陸水学会英文誌編集委員
  • 2022/02 - 2025/12 日本陸水学会 企画委員
  • 2023/01 - 2024/12 日本陸水学会 将来計画ワーキンググループ
受賞 (2件):
  • 2022/09 - 日本陸水学会 第24回 吉村賞
  • 2018/03 - 日本学術振興会 第8回 育志賞
所属学会 (5件):
日本バイオインフォマティクス学会 ,  アメリカ微生物学会(ASM) ,  国際微生物生態学会(ISME) ,  日本陸水学会 ,  日本微生物生態学会
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