研究者
J-GLOBAL ID:201801012716341050   更新日: 2024年04月06日

岡嵜 友輔

オカザキ ユウスケ | Okazaki Yusuke
所属機関・部署:
職名: 助教
ホームページURL (1件): https://yusukeokazaki.weebly.com/
研究分野 (4件): ゲノム生物学 ,  進化生物学 ,  生態学、環境学 ,  水圏生命科学
研究キーワード (6件): ウイルス ,  細菌 ,  メタゲノム ,  琵琶湖 ,  陸水学 ,  微生物生態学
競争的資金等の研究課題 (14件):
  • 2023 - 2030 湖間比較で拓く高解像度な生態系多様性研究基盤
  • 2022 - 2027 ウイルスによる赤潮崩壊現象を裏打ちする分子生態学的メカニズムに関する研究
  • 2022 - 2026 湖沼の深水層に卓越する未知の有機物循環系の解明
  • 2022 - 2026 無光層-太陽光の届かない水圏-に棲息する巨大ウイルスの生態
  • 2022 - 2025 溶存有機物の長期残存性を規定する分子複雑性とその規定要因の解明
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論文 (23件):
  • Yosuke Nishimura, Kohei Yamada, Yusuke Okazaki, Hiroyuki Ogata. DiGAlign: Versatile and Interactive Visualization of Sequence Alignment for Comparative Genomics. 2024. 39. 1. ME23061
  • 岡崎友輔. 技術が拓く湖沼微生物生態学の最前線. 陸水学雑誌. 2024. 85. 1. 1-24
  • Hiroaki Fujita, Masayuki Ushio, Kenta Suzuki, Masato S. Abe, Masato Yamamichi, Yusuke Okazaki, Alberto Canarini, Ibuki Hayashi, Keitaro Fukushima, Shinji Fukuda, et al. Metagenomic analysis of ecological niche overlap and community collapse in microbiome dynamics. Frontiers in Microbiology. 2023. 14
  • Hiroyuki Hikida, Yusuke Okazaki, Ruixuan Zhang, Thi Tuyen Nguyen, Hiroyuki Ogata. A rapid genome-wide analysis of isolated giant viruses using MinION sequencing. Environmental microbiology. 2023
  • Hiroaki Fujita, Masayuki Ushio, Kenta Suzuki, Masato S. Abe, Masato Yamamichi, Yusuke Okazaki, Alberto Canarini, Ibuki Hayashi, Keitaro Fukushima, Shinji Fukuda, et al. Facilitative interaction networks in experimental microbial community dynamics. Frontiers in Microbiology. 2023. 14
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MISC (9件):
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講演・口頭発表等 (13件):
  • High-resolution microbial eco-genomics in deep freshwater lakes
    (13th Asian Symposium on Microbial Ecology 2023)
  • Single-cell genomics uncovers microbial genomic microdiversity and virus-host interactions that had eluded high-resolution metagenomics
    (The Local Pangenome workshop 2023)
  • Single cell genomics uncovered uncultured virus-host links in a deep freshwater lake
    (Symposium of Aquatic Microbial Ecology (SAME17) 2023)
  • “湖の微生物生態系”を対象としたゲノム・多型・遺伝子発現の網羅的比較解析
    (日本微生物生態学会第35回大会 2022)
  • 湖沼深水層の細菌の生態学
    (日本陸水学会第86回大会 2022)
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学歴 (3件):
  • 2015 - 2018 京都大学 理学研究科 生物科学専攻 博士課程
  • 2010 - 2012 京都大学 理学研究科 生物科学専攻 修士課程
  • 2006 - 2010 京都大学 理学部
学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (5件):
  • 2023/04 - 現在 京都大学 創発PI
  • 2020/12 - 現在 京都大学 化学研究所 助教
  • 2018/04 - 2020/11 日本学術振興会特別研究員(PD)
  • 2015/04 - 2018/03 日本学術振興会特別研究員(DC1)
  • 2012/04 - 2015/03 三菱総合研究所 研究員
委員歴 (2件):
  • 2022/02 - 2025/12 日本陸水学会 企画委員
  • 2023/01 - 2024/12 日本陸水学会 将来計画ワーキンググループ
受賞 (2件):
  • 2022/09 - 日本陸水学会 第24回 吉村賞
  • 2018/03 - 日本学術振興会 第8回 育志賞
所属学会 (5件):
日本バイオインフォマティクス学会 ,  アメリカ微生物学会(ASM) ,  国際微生物生態学会(ISME) ,  日本陸水学会 ,  日本微生物生態学会
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