研究者
J-GLOBAL ID:201801013135103392   更新日: 2024年11月21日

寺田 透

テラダ トオル | Terada Tohru
所属機関・部署:
職名: 教授
ホームページURL (2件): http://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~tterada/index_ja.htmlhttp://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~tterada/index.html
研究分野 (1件): 生物物理学
研究キーワード (3件): 分子動力学 ,  バイオインフォマティクス ,  分子シミュレーション
競争的資金等の研究課題 (17件):
  • 2022 - 2027 予知生合成科学・研究総括班
  • 2022 - 2027 予測構造に基づく基質・反応特異性予測法の開発
  • 2022 - 2027 分子シミュレーションによる生体高分子の機能の予測と解析
  • 2022 - 2025 クライオ電顕を用いた鉄錯体輸送体の基質認識と輸送機構の解明
  • 2020 - 2023 マルチスケール心臓シミュレータと大規模臨床データの革新的統合による心不全パンデミックの克服
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論文 (201件):
  • Suguru Fujita, Tohru Terada. Enhanced prediction of protein functional identity through the integration of sequence and structural features. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2024. 23. 4124-4130
  • Kazutoshi Tani, Saori Maki-Yonekura, Ryo Kanno, Tatsuki Negami, Tasuku Hamaguchi, Malgorzata Hall, Akira Mizoguchi, Bruno M. Humbel, Tohru Terada, Koji Yonekura, et al. Structure of endothelin ETB receptor-Gi complex in a conformation stabilized by unique NPxxL motif. Communications Biology. 2024
  • Takayoshi Awakawa, Takahiro Mori, Lena Barra, Yusef Ahmed, Richiro Ushimaru, Yaojie Gao, Naruhiko Adachi, Toshiya Senda, Tohru Terada, Dean J. Tantillo, et al. The structural basis of pyridoxal-5′-phosphate-dependent β-NAD-alkylating enzymes. Nature Catalysis. 2024
  • Floris J. van Eerden, Songling Li, Tina Lusiany, Hendra S. Ismanto, Tohru Terada, Christoph Gerle, Kanako Akamatsu, Mika Hirose, Fuminori Sugihara, David Virya Chen, et al. Fc-independent SARS-CoV-2 infection-enhancing antibodies decouple N-terminal and receptor-binding domains by cross-linking neighboring spikes. 2024
  • Masato Homma, Takatoshi Wakabayashi, Yoshitaka Moriwaki, Nanami Shiotani, Takumi Shigeta, Kazuki Isobe, Atsushi Okazawa, Daisaku Ohta, Tohru Terada, Kentaro Shimizu, et al. Insights into stereoselective ring formation in canonical strigolactone: Identification of a dirigent domain-containing enzyme catalyzing orobanchol synthesis. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2024. 121. 26
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MISC (40件):
  • 水口千穂, 水口千穂, TSAI Pi-Cheng, 寺田透, 寺田透, 野尻秀昭, 野尻秀昭. ヘテロ六量体型芳香環二水酸化酵素における電子受容機構の構造基盤. KEK Progress Report (Web). 2023. 2023-2
  • Anri Terabayashi, Momoka Nakamura, Kyosuke Sakata, Takuya Miyakawa, Masaru Tanokura, Tohru Terada, Masaki Kojima. 2Pos062 A new program to analyze protein structures based on the geometric context. 生物物理. 2019. 59. Supplement1-2. S322-S492
  • 水口千穂, VASILEVA Delyana, 藤本瑞, 寺田透, 岡田憲典, 野尻秀昭, 野尻秀昭. プラスミド・宿主染色体由来H-NSファミリータンパク質のヘテロ多量体形成機構. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2017. 2017
  • 角埜裕基, 水口千穂, 高橋裕里香, 寺田透, 岡田憲典, 野尻秀昭. Pseudomonas属細菌由来H-NSファミリータンパク質のDNA結合ドメインが持つ塩基配列嗜好性の解析. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2017. 11th
  • Haruyuki Yamashita, Tohru Terada, Reiko Ueda, Yoshiro Ishimaru, Keiko Abe, Tomiko Asakura. Long chain fatty acids have a bitterness-masking effect on quinine and other nitrogenous bitter substances by formation of insoluble binary complexes. CHEMICAL SENSES. 2016. 41. 9. E224-E224
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講演・口頭発表等 (19件):
  • Molecular simulation studies on protein functions and improvement of the efficiency of cryo-EM data collection by machine learning
    (AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium 2019)
  • 分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析と機械学習によるクライオ電子顕微鏡撮影の効率化
    (CBI学会2019年大会 2019)
  • Molecular simulations of ion channels to investigate voltage-dependent conformational change and drug-induced blockade
    (11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences (CCS International Symposium 2019) 2019)
  • Development of a deep-learning-based method to identify “good” regions of a cryo-EM grid
    (日本生物物理学会第57回年会 2019)
  • マルコフ状態モデルによるタンパク質の立体構造変化のダイナミクス解析
    (日本生物物理学会第56回年会 2018)
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学歴 (3件):
  • 1994 - 1999 東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻
  • 1992 - 1994 東京大学 理学部 生物化学科
  • 1990 - 1992 東京大学 教養学部 理科I類
学位 (1件):
  • 博士(理学) (東京大学)
経歴 (13件):
  • 2024/04 - 現在 東京大学 大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 教授
  • 2020/04 - 2024/03 東京大学 大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 准教授
  • 2018/04 - 2020/03 東京大学 大学院情報学環 准教授
  • 2016/04 - 2018/03 東京大学 大学院農学生命科学研究科 アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット 特任准教授
  • 2014/04 - 2016/03 東京大学 大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 准教授
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所属学会 (6件):
米国生物物理学会 ,  分子シミュレーション研究会 ,  CBI(シービーアイ)学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本生物物理学会
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