- 2022 - 2027 予知生合成科学・研究総括班
- 2022 - 2027 予測構造に基づく基質・反応特異性予測法の開発
- 2022 - 2027 分子シミュレーションによる生体高分子の機能の予測と解析
- 2022 - 2025 クライオ電顕を用いた鉄錯体輸送体の基質認識と輸送機構の解明
- 2020 - 2023 マルチスケール心臓シミュレータと大規模臨床データの革新的統合による心不全パンデミックの克服
- 2017 - 2022 タンパク質の複合体構造・分子間相互作用・ダイナミクス・機能の予測と解析
- 2015 - 2018 リガンド結合パスウェイ仮説の理論的検証
- 2012 - 2015 マルチスケールシミュレーションによるタンパク質へのリガンド結合過程の研究
- 2011 - 2015 タンパク質・糖鎖相互作用予測システムおよびデータベースの開発
- 2007 - 2008 ミニ蛋白質に共通するフォールディング機構の解明
- 2006 - 2007 高精度のドッキング機能を有するタンパク質間相互作用予測システムの開発
- 2005 - 2007 高精度タンパク質構造モデリングおよび構造評価手法の開発
- 2005 - 2005 高精度のドッキング機能を有するタンパク質間相互作用予測システムの開発
- 2004 - 2005 複合体形成に伴うタンパク質の立体構造変化パスウェイの予測・解析法の開発
- 2004 - 2005 大規模分散データの真に透過で効率的な共有を実現する分散共有配列システムの開発
- 2004 - 2004 ホモロジーモデリングとアビニシオ法の統合による高精度タンパク質構造予測手法の開発
- 2003 - 2003 ホモロジーモデリングとアビニシオ法の統合による高精度タンパク質構造予測手法の開発
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