寺田透

テラダトオル | Terada Tohru

所属機関・部署：
職名：准教授
ホームページURL (2件)： http://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~tterada/index_ja.html , http://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~tterada/index.html

研究分野 (1件)：生物物理学

研究キーワード (3件)：分子動力学 , バイオインフォマティクス , 分子シミュレーション

競争的資金等の研究課題 (14件)：

全件表示

論文 (198件)：

Atsushi Yamagata, Kaori Ito, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Tohru Terada, Mikako Shirouzu. Structural basis for antiepileptic drugs and botulinum neurotoxin recognition of SV2A. Nature Communications. 2024
Fan Zhao, Yoshitaka Moriwaki, Tomohiro Noguchi, Kentaro Shimizu, Tomohisa Kuzuyama, Tohru Terada. QM/MM Study of the Catalytic Mechanism and Substrate Specificity of the Aromatic Substrate C-Methyltransferase Fur6. Biochemistry. 2024. 63. 6. 806-814
Masato Homma, Takatoshi Wakabayashi, Yoshitaka Moriwaki, Nanami Shiotani, Takumi Shigeta, Kazuki Isobe, Atsushi Okazawa, Daisaku Ohta, Tohru Terada, Kentaro Shimizu, et al. Insights into stereoselective ring formation in canonical strigolactone: Discovery of a dirigent domain-containing enzyme catalyzing orobanchol synthesis. 2023
Tomoki Sawa, Yoshitaka Moriwaki, Hanting Jiang, Kohji Murase, Seiji Takayama, Kentaro Shimizu, Tohru Terada. Comprehensive computational analysis of the molecular mechanism of self-incompatibility in Brassicaceae using improved structure prediction. 2023
Tomoki Sawa, Yoshitaka Moriwaki, Hanting Jiang, Kohji Murase, Seiji Takayama, Kentaro Shimizu, Tohru Terada. Comprehensive computational analysis of the SRK-SP11 molecular interaction underlying self-incompatibility in Brassicaceae using improved structure prediction for cysteine-rich proteins. bioRxiv. 2023

MISC (39件)：

Anri Terabayashi, Momoka Nakamura, Kyosuke Sakata, Takuya Miyakawa, Masaru Tanokura, Tohru Terada, Masaki Kojima. 2Pos062 A new program to analyze protein structures based on the geometric context. 生物物理. 2019. 59. Supplement1-2. S322-S492
水口千穂, VASILEVA Delyana, 藤本瑞, 寺田透, 岡田憲典, 野尻秀昭, 野尻秀昭. プラスミド・宿主染色体由来H-NSファミリータンパク質のヘテロ多量体形成機構. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2017. 2017
角埜裕基, 水口千穂, 高橋裕里香, 寺田透, 岡田憲典, 野尻秀昭. Pseudomonas属細菌由来H-NSファミリータンパク質のDNA結合ドメインが持つ塩基配列嗜好性の解析. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2017. 11th
Haruyuki Yamashita, Tohru Terada, Reiko Ueda, Yoshiro Ishimaru, Keiko Abe, Tomiko Asakura. Long chain fatty acids have a bitterness-masking effect on quinine and other nitrogenous bitter substances by formation of insoluble binary complexes. CHEMICAL SENSES. 2016. 41. 9. E224-E224
Yoshitaka Moriwaki, Tohru Terada, Kouhei Tsumoto, Kentaro Shimizu. Insight into a Rapid Heme Transfer Reaction between Near Transporter Domains of Staphylococcus Aureus: A Theoretical Study using QM/MM and MD Simulations. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 381A-381A

講演・口頭発表等 (19件)：

Molecular simulation studies on protein functions and improvement of the efficiency of cryo-EM data collection by machine learning
(AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium 2019)
分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析と機械学習によるクライオ電子顕微鏡撮影の効率化
(CBI学会2019年大会 2019)
Molecular simulations of ion channels to investigate voltage-dependent conformational change and drug-induced blockade
(11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences (CCS International Symposium 2019) 2019)
Development of a deep-learning-based method to identify “good” regions of a cryo-EM grid
(日本生物物理学会第57回年会 2019)
マルコフ状態モデルによるタンパク質の立体構造変化のダイナミクス解析
(日本生物物理学会第56回年会 2018)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (13件)：

全件表示

所属学会 (6件)：

米国生物物理学会 , 分子シミュレーション研究会 , CBI(シービーアイ)学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本蛋白質科学会 , 日本生物物理学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

寺田 透