研究者
J-GLOBAL ID:201801015797365179   更新日: 2024年10月11日

山置 佑大

ヤマオキ ユウダイ | Yamaoki Yudai
所属機関・部署:
職名: 助教
ホームページURL (1件): http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/bio/
研究分野 (4件): 生物物理学 ,  構造生物化学 ,  生体化学 ,  生物分子化学
研究キーワード (18件): 構造生物学 ,  生物物理学 ,  核酸化学 ,  細胞構造生物学 ,  NMR ,  in-cell NMR ,  核酸構造 ,  ダイナミクス ,  分子間相互作用 ,  グアニン四重鎖 ,  i-motif ,  RNAアプタマー ,  リボザイム ,  DNA複製 ,  木質バイオマス ,  リグニン ,  アミロイド ,  高圧
競争的資金等の研究課題 (8件):
  • 2024 - 2025 分子混雑環境下の核酸の運動性解析
  • 2022 - 2025 細胞内環境下におけるエピゲノム修飾を含む核酸の構造ダイナミクス解析
  • 2019 - 2021 In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内核酸の構造安定性および相互作用の評価
  • 2017 - 2019 細胞内外で活性をスイッチする機能性核酸のIn-cell NMR法等を用いた創製
  • 2016 - 2018 細胞の外と内とで蛋白質捕捉活性がオフからオンに切り替わる機能性RNAの創製
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論文 (21件):
  • Afaf Eladl*, Yudai Yamaoki*, Keisuke Kamba*, Shoko Hoshina, Haruka Horinouchi, Keiko Kondo, Shou Waga, Takashi Nagata, Masato Katahira (*: equally contributed). NMR characterization of the structure of the intrinsically disordered region of human origin recognition complex subunit 1, hORC1, and of its interaction with G-quadruplex DNAs. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2023. in press
  • Omar Eladl*, Yudai Yamaoki*, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira (*: equally contributed). Complex formation of an RNA aptamer with a part of HIV-1 Tat through induction of base triples in living human cells proved by in-cell NMR. International Journal of Molecular Sciences. 2023. in press. 10. 9069-9069
  • Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Tomoki Sakamoto, Shohei Takami, Masato Katahira. Shedding light on the base-pair opening dynamics of nucleic acids in living human cells. Nature Communications. 2022. 13. 1. 7143
  • Omar Eladl*, Yudai Yamaoki*, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira (*: equally contributed). Detection of interaction between an RNA aptamer and its target compound in living human cells using 2D in-cell NMR. Chemical Communications. 2022. 59. 1. 102-105
  • Kohei Miyauchi, Hiroshi Imamura, Yudai Yamaoki, Minoru Kato. Small-angle X-ray scattering data of a guanine-rich DNA derived from the promoter region of c-MYC gene in solution. Data in Brief. 2022. 42. 108285
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MISC (56件):
  • 阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人. 分子クラウディング環境が三重鎖構造DNAの構造ダイナミクスに与える影響のNMR法を用いた解析. 学術変革領域研究(A)「物質共生」領域会議, 九州大学病院キャンパス. 2023
  • 阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人. 分子クラウディング環境が三重鎖構造DNAの構造ダイナミクスに与える影響のNMR法を用いた解析. 学術変革領域研究(A)「物質共生」若手シンポジウム, 九州大学病院キャンパス. 2023
  • 阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人. ヒト生細胞内におけるDNA三重鎖構造形成の初観測および分子込み合い環境下におけるDNA三重鎖構造の塩基対開閉ダイナミクスの解析. 第103回日本化学会春季年会. 2023
  • 川上愛加, 山置佑大, 近藤敬子, 阪本知樹, 永田崇, 片平正人. 核酸から成る液滴のNMR法を用いた物理化学的解析. 第45回日本分子生物学会年会. 2022
  • 阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人. 分子込み合い環境下におけるDNA三重鎖構造の塩基対の開閉ダイナミクスの緩和分散法を用いた解析. 第61回NMR討論会. 2022
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書籍 (5件):
  • Experimental Approaches of NMR Spectroscopy -Methodology and Application to Life Science and Material Science 2nd Edition
    Springer 2023
  • 生命金属ダイナミクス ~生体内における金属の挙動と制御~
    NTS 2021
  • ヒト生細胞中における核酸NMRシグナルの初計測
    生物物理誌 2019
  • ヒト生細胞中のDNAおよびRNAのNMRシグナル観測に初めて成功
    新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号(平成30年2月号) 2018
  • カリウムイオンを感知して自律的に自らの活性をスイッチングするRNA アプタマーの開発
    新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第48号(平成29年8月号) 2017
講演・口頭発表等 (6件):
  • In-cell NMR法によるヒト生細胞内環境下の核酸の構造およびダイナミクスの解析
    (第21回若手NMR研究会 2021)
  • In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内核酸の構造およびダイナミクスの評価
    (第57回 日本生物物理学会年会 2019)
  • In-cell NMR法によるヒト細胞内DNAおよびRNAの観測
    (第19回若手NMR研究会 2018)
  • Evaluation of the structural stability and dynamics of nucleic acids inside the living cells by using in-cell NMR spectroscopy
    (The 18th Annual Meeting of the Protein Society of Japan 2018)
  • Development of K+-responsive Tat-binding RNA aptamer and hammerhead ribozyme
    (FIBER FUTURE COLLEGE 35 2017)
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学位 (1件):
  • 博士(エネルギー科学) (京都大学)
経歴 (3件):
  • 2020/04 - 現在 京都大学 エネルギー理工学研究所 助教
  • 2016/02 - 2020/03 京都大学 エネルギー理工学研究所 研究員
  • 2013/04 - 2015/03 日本学術振興会特別研究員
委員歴 (2件):
  • 2022/09 - 第22回若手NMR研究会 世話人
  • 2013/06 - 第14回若手NMR研究会 世話人
受賞 (7件):
  • 2023/03 - 2022年度京都大学エネルギー理工学研究所表彰 研究奨励賞
  • 2021/08 - ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, JEOL RESONANCE Poster Award
  • 2019/09 - 日本生物物理学会 若手招待講演賞
  • 2016/09 - The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC), Outstanding Poster Award
  • 2016/08 - The 27th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems (ICMRBS), Young Investigator Award
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所属学会 (7件):
日本化学会 ,  日本核酸化学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本核磁気共鳴学会 ,  日本RNA学会 ,  日本生物物理学会
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