元岡大祐

モトオカダイスケ | Motooka Daisuke

所属機関・部署：
職名：講師

研究分野 (1件)：感染症内科学

競争的資金等の研究課題 (7件)：

2022 - 2025 尿路性器癌における全身循環細菌叢及び細菌関連代謝が構築する癌局所免疫状態の解明
2021 - 2024 リアルタイム真菌種同定方法の開発とクリニカルメタゲノミクスへの応用
2021 - 2024 メチル化CpG結合蛋白質による等温DNA増幅反応阻害機構の解析およびその応用
2018 - 2021 クリニカルメタゲノミクスと病原体ゲノミクスの高感度化
2016 - 2019 メタゲノム解析における高感度ウイルス検出法の開発

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論文 (310件)：

Takahiro Yamaguchi, Michio Jinnai, Doan Tran Nguyen Minh, Oanh Nguyen Hoang, Hien Le Thi, Phong Ngo Thanh, Phuong Hoang Hoai, Phuc Nguyen Do, Chinh Dang Van, Daisuke Motooka, et al. IncA/C plasmid encoding blaCTX-M-55 in non-O1 Vibrio cholerae isolates from the edible river fish Mastacembelus sp. Microbiology resource announcements. 2024. 13. 3. e0122623
Shohei Minami, Tomohiro Kotaki, Yusuke Sakai, Shinya Okamura, Shiho Torii, Chikako Ono, Daisuke Motooka, Rina Hamajima, Ryotaro Nouda, Jeffery A Nurdin, et al. Vero cell-adapted SARS-CoV-2 strain shows increased viral growth through furin-mediated efficient spike cleavage. Microbiology spectrum. 2024. e0285923
Yoshiaki Yasumizu, Makoto Kinoshita, Martin Jinye Zhang, Daisuke Motooka, Koichiro Suzuki, Daisuke Okuzaki, Satoshi Nojima, Soichiro Funaki, Yasushi Shintani, Naganari Ohkura, et al. Spatial transcriptomics elucidates medulla niche supporting germinal center response in myasthenia gravis thymoma. 2024
Tsutomu Endo, Kiyonori Kobayashi, Takafumi Matsumura, Chihiro Emori, Manabu Ozawa, Shimpei Kawamoto, Daisuke Okuzaki, Keisuke Shimada, Haruhiko Miyata, Kentaro Shimada, et al. Multiple ageing effects on testicular/epididymal germ cells lead to decreased male fertility in mice. Communications Biology. 2024
Kentaro Shimizu, Haruhiko Hirata, Natsuko Tokuhira, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Akiko Ueda, Jotaro Tachino, Moe Koide, Akinori Uchiyama, Hiroshi Ogura, et al. Dysbiosis of gut microbiota in patients with severe COVID-19. Acute medicine & surgery. 2024. 11. 1. e923

MISC (34件)：

アルカディ・ムハッマド, 石井英治, Dang Tat Truong, 元岡大祐, 松田重輝, 飯田哲也, 児玉年央, 奥崎大介. RNAダイレクトシーケンスで明らかになった腸炎ビブリオのトランスクリプトーム複雑性(Transcriptome Complexity of Vibrio parahaemolyticus revealed by direct RNA sequencing). 日本細菌学雑誌. 2023. 78. 1. 131-131
森田諒, 森田諒, 纐纈律子, LU Xiuyuan, 佐々木正大, 中山英美, LIU Yu-chen, 奥崎大介, 元岡大祐, WING James Badger, et al. COVID-19の再燃と同時期にCD4+T細胞認識からの逃避変異を認めた液性免疫不全者におけるSARS-CoV-2の持続感染例. 日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web). 2023. 70th
森亮一, 金湘殷, Liu Yu-Chen, 亀岡章一郎, 福田茉莉, 元岡大祐, 奥崎大介, 下川功. 空間的トランスクリプトーム解析を用いた炎症関連瘢痕形成遺伝子の同定及び機能解析. 日本病理学会会誌. 2022. 111. 1. 215-215
山口雅也, 川西邦夫, 小林桃子, 元岡大祐, 奥崎大介, 川端重忠. 選抜ワークショップ4:病原性(細胞内侵入/増殖/寄生・免疫回避)、生体防御老化により肺炎球菌感染症が重症化する機構のマウスモデルを用いた探索. 日本細菌学雑誌. 2022. 77. 1. 53-53
Al Kadi Mohamad, 石井英治, Dang Tat Truong, 元岡大祐, 松田重輝, 飯田哲也, 児玉年央, 奥崎大介. 腸炎ビブリオのトランスクリプトームが示す複雑なランドスケープ(The complex landscape of Vibrio parahaemolyticus transcriptome). 日本細菌学雑誌. 2022. 77. 1. 80-80

書籍 (3件)：

Whole Genome Sequencing of SARS-CoV-2 by Hybridization Capture Method
2022
シングルセル解析技術の現状とその応用例
日本インターフェロン・サイトカイン学会(JSICR) Newsletter vol.48 2021
今すぐ始める!メタゲノム解析実験プロトコール
羊土社 2016 ISBN:9784758101974

講演・口頭発表等 (13件)：

次世代シーケンス技術を用いた下水中ウイルスのゲノム解析
(下水免疫のイノベーションと社会実装課題 2023)
FFPE検体を用いたNGS解析で出来ること
(第34回日本臨床口腔病理学会総会・学術大会 2023)
シングルセル解析の現状と今後について
(第33回日本サイメトリー学会 2023)
Longitudinal alterations of the gut microbiota and mycobiota on COVID-19 severity
(第96回日本細菌学会総会 2023)
NGSで何が解析できるか、微研NGSコアファシリティの紹介と活用について
(超実践的バイオインフォマティクスセミナー〜明日から研究に組み込める情報解析〜第1回 2022)

受賞 (2件)：

2023/04 - 文部科学省令和5年度科学技術分野の文部科学大臣表彰研究支援賞「次世代シーケンサーを用いた方法論の開発と研究支援への貢献」
2022/02 - COI学術交流会第4回COI学術交流会最優秀ポスター賞

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