研究者
J-GLOBAL ID:201801015914910574   更新日: 2024年07月30日

露崎 弘毅

ツユザキ コウキ | Tsuyuzaki Koki
所属機関・部署:
職名: 特任講師
ホームページURL (1件): https://sites.google.com/view/kokitsuyuzaki/top
研究分野 (1件): ゲノム生物学
研究キーワード (10件): 多変量解析 ,  ソフトウェア開発 ,  データ統合 ,  オープンソース・ソフトウェア ,  バイオインフォマティクス ,  トランスクリプトーム ,  非モデル生物 ,  細胞間相互作用 ,  微生物学 ,  薬学
競争的資金等の研究課題 (6件):
  • 2023 - 2028 バルクエピゲノムデータにおけるCell-type Deconvolution法の確立
  • 2024 - 2027 メタボロミクス研究における細胞系譜解析手法の開拓と応用
  • 2024 - 2027 質量分析データリポジトリの大規模再解析による代謝研究基盤の構築
  • 2022 - 2026 貫通した消化管の起源をウニ幼生から探る
  • 2019 - 2023 非負値テンソル分解を用いたオーファン受容体結合リガンドの同定及び機能解明
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論文 (21件):
  • 露崎弘毅. 行列・テンソル分解によるヘテロバイオデータ統合解析の数理 -第5回 ランダムウォーク-. JSBi Bioinformatics Review. 2024. 5. 1. 1-15
  • Koki Tsuyuzaki, Manabu Ishii, Itoshi Nikaido. Sctensor detects many-to-many cell-cell interactions from single cell RNA-sequencing data. BMC bioinformatics. 2023. 24. 1. 420-420
  • Koki Tsuyuzaki, Naoki Yoshida, Tetsuo Ishikawa, Yuki Goshima, Eiryo Kawakami. Non-negative tensor factorization workflow for time series biomedical data. STAR Protocols. 2023. 4. 3. 102318-102318
  • Koki Tsuyuzaki. dcTensor: An R package for discrete matrix/tensor decomposition. Journal of Open Source Software. 2023. 8. 88. 5664-5664
  • Koki Tsuyuzaki. iTensor: An R package for independent component analysis-based matrix/tensor decomposition. Journal of Open Source Software. 2023. 8. 87. 5496-5496
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MISC (2件):
書籍 (5件):
  • 実験医学増刊 Vol.41 No.15 マルチオミクス データ駆動時代の疾患研究〜がん、老化、生活習慣病 最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明
    羊土社 2023 ISBN:4758104131
  • バイオDBとウェブツール : ラボで使える最新70選 : 知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤
    羊土社 2022 ISBN:9784758104067
  • RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ (実験医学別冊)
    羊土社 2019 ISBN:9784758122436
  • シングルセル解析 実験ガイド(実験医学別冊)
    羊土社 2017 ISBN:9784758122344
  • 次世代シーケンサー DRY解析教本
    秀潤社 2015 ISBN:9784780909203
講演・口頭発表等 (39件):
  • 君たちはどう生きるか?
    (IIBMP2023 ナイトセッション 2023)
  • オープニング
    (IIBMP2023 LLMワークショップ 2023)
  • 生命科学にパラダイムシフトを起こすテンソル分解技術
    (IPSJ-ONE 2022 2022)
  • 多様な多次元データ構造を扱うテンソルパッケージの紹介
    (第44回日本分子生物学会年会 シンポジウム「現実世界のノイズと多様性に挑むデータサイエンス・機械学習」 2021)
  • 細胞間相互作用解析ワークショップ
    (BioC Asia 2021 2021)
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学歴 (3件):
  • 2012 - 2015 東京理科大学大学院 薬科学専攻 博士後期課程
  • 2010 - 2012 東京理科大学大学院 薬科学専攻 修士課程
  • 2006 - 2010 東京理科大学 薬学部 生命創薬科学科
学位 (1件):
  • 薬科学 (東京理科大学)
経歴 (9件):
  • 2023/04 - 現在 理化学研究所 客員研究員
  • 2023/04 - 現在 千葉大学 国際高等研究基幹 特任講師
  • 2023/04 - 現在 千葉大学 大学院 医学研究院 人工知能(AI)医学 特任講師
  • 2022/04 - 2023/03 中央大学 理工学部 兼任教員
  • 2020/04 - 2023/03 理化学研究所 基礎科学特別研究員
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委員歴 (2件):
  • 2021/11 - 2021/11 BioC Asia 2021 大会長
  • 2021/09 - 2021/09 2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021) プログラム委員
受賞 (2件):
  • 2013/10 - 生命医薬情報学連合大会 2013 BioHack Competition MeSHRフレームワーク
  • 2012/03 - 東京理科大学 修士論文最優秀賞 Two-way AIC: マイクロアレイデータに基づく発現量変動遺伝子検出の新手法
所属学会 (1件):
日本バイオインフォマティクス学会
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