露崎弘毅

ツユザキコウキ | Tsuyuzaki Koki

所属機関・部署：
職名：特任講師
ホームページURL (1件)： https://sites.google.com/view/kokitsuyuzaki/top

研究分野 (1件)：ゲノム生物学

研究キーワード (10件)：多変量解析 , ソフトウェア開発 , データ統合 , オープンソース・ソフトウェア , バイオインフォマティクス , トランスクリプトーム , 非モデル生物 , 細胞間相互作用 , 微生物学 , 薬学

競争的資金等の研究課題 (3件)：

論文 (20件)：

Koki Tsuyuzaki, Manabu Ishii, Itoshi Nikaido. Sctensor detects many-to-many cell-cell interactions from single cell RNA-sequencing data. BMC bioinformatics. 2023. 24. 1. 420-420
Koki Tsuyuzaki, Naoki Yoshida, Tetsuo Ishikawa, Yuki Goshima, Eiryo Kawakami. Non-negative tensor factorization workflow for time series biomedical data. STAR Protocols. 2023. 4. 3. 102318-102318
Koki Tsuyuzaki. dcTensor: An R package for discrete matrix/tensor decomposition. Journal of Open Source Software. 2023. 8. 88. 5664-5664
Koki Tsuyuzaki. iTensor: An R package for independent component analysis-based matrix/tensor decomposition. Journal of Open Source Software. 2023. 8. 87. 5496-5496
Koki Tsuyuzaki, Kentaro Yamamoto, Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Itoshi Nikaido. WormTensor: a clustering method for time-series whole-brain activity data from C. elegans. BMC Bioinformatics. 2023. 24. 1

MISC (2件)：

書籍 (5件)：

実験医学増刊 Vol.41 No.15 マルチオミクスデータ駆動時代の疾患研究〜がん、老化、生活習慣病最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明
羊土社 2023 ISBN:4758104131
バイオDBとウェブツール : ラボで使える最新70選 : 知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤
羊土社 2022 ISBN:9784758104067
RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ (実験医学別冊)
羊土社 2019 ISBN:9784758122436
シングルセル解析実験ガイド(実験医学別冊)
羊土社 2017 ISBN:9784758122344
次世代シーケンサー DRY解析教本
秀潤社 2015 ISBN:9784780909203

講演・口頭発表等 (39件)：

君たちはどう生きるか?
(IIBMP2023 ナイトセッション 2023)
オープニング
(IIBMP2023 LLMワークショップ 2023)
生命科学にパラダイムシフトを起こすテンソル分解技術
(IPSJ-ONE 2022 2022)
多様な多次元データ構造を扱うテンソルパッケージの紹介
(第44回日本分子生物学会年会シンポジウム「現実世界のノイズと多様性に挑むデータサイエンス・機械学習」 2021)
細胞間相互作用解析ワークショップ
(BioC Asia 2021 2021)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (9件)：

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委員歴 (1件)：

受賞 (2件)：

所属学会 (1件)：

日本バイオインフォマティクス学会

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露崎 弘毅