- 2022 - 2025 日本近世史料学の再構築 -基幹史料集の多角的利用環境形成と社会連携を通じて
- 2020 - 2025 コンテキストに応じた人文科学データパッケージ化に関する研究
- 2021 - 2025 日本近世における政教関係の形成と確立
- 2020 - 2024 寺院史料の調査と個別的動向の解明に立脚した近世宗教政策像の更新
- 2017 - 2020 家光政権期における寺社政策の基礎的研究
- 2015 - 2019 近世初期永青文庫細川家文書の総合的解析による藩政確立過程の研究
- 2015 - 2018 近世中後期における仏教教団の地域的編成と対幕藩交渉
- 2014 - 2017 日本近世の神仏習合思想とその展開
- 2012 - 2017 日本目録学の基盤確立と古典学研究支援ツールの拡充-天皇家・公家文庫を中心に-
- 2011 - 2015 島原の乱と近世的軍制の基礎的研究
- 2011 - 2013 近世仏教を見直す-天台宗を中心に-
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