研究者
J-GLOBAL ID:201801017244158780   更新日: 2023年05月08日

村上 洋一

ムラカミ ヨウイチ | Murakami Yoichi
所属機関・部署:
職名: 准教授
ホームページURL (1件): http://www.murakamilab.tuis.ac.jp
研究分野 (2件): システムゲノム科学 ,  生命、健康、医療情報学
研究キーワード (4件): バイオインフォマティクス ,  タンパク質間相互作用予測 ,  機械学習 ,  データベース
競争的資金等の研究課題 (6件):
  • 2020 - 2023 遠隔看護による「患者と共にある医療」を目指すセルフモニタリングシステムの開発
  • 2020 - 2023 深層学習による特定のタンパク質間の結合部位予測と標的部位の絞り込みシステムの開発
  • 2019 - 2023 看護臨床判断を支援するAI活用に向けた新技術の創生
  • 2019 - 2022 在宅医療を支える看護判断を導くAI構築と拡張知能(EI)の活用
  • 2014 - 2017 配列情報に基づく蛋白質相互作用予測の高度化と創薬標的探索のための支援システム開発
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論文 (24件):
  • Yoichi Murakami, Kenji Mizuguchi. Recent developments of sequence-based prediction of protein-protein interactions. Biophysical Reviews. 2022. 14. 6. 1393-1411
  • 水野 芳子, 西村 あをい, 村上 洋一, 前田 はる香, 山浦 那津子. 多様な施設で行う小児看護学実習の学びの特徴. 東京情報大学研究論集. 2022. 25. 2. 45-54
  • Akira Saito, Daiki Tsuchiya, Seiji Sato, Atsushi Okamoto, Yoichi Murakami, Kenji Mizuguchi, Hiroyuki Toh, Wataru Nemoto. Update of the GRIP web service. Journal of Receptors and Signal Transduction. 2020. 40. 4. 348-356
  • 中野心太, 早稲田篤志, 村上洋一, 岸本頼紀, 花田真樹, 関口竜也, 折田彰, 布広永示. 不正アクセスの痕跡情報を用いたタイムライン型イベントログ可視化機能の開発. 東京情報大学研究論集. 2020. 24. 1. 1-10
  • Yoichi Murakami. Study of Characterization of Promiscuous Binding Sites in Protein-Small Molecule Complexes. Proceedings of the 2019 6th International Conference on Bioinformatics Research and Applications. 2019
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MISC (6件):
  • 林子易, 鈴木優介, 井関文一, 村上洋一. Jupyter を使用したリアルタイム学習進捗監視システムの実装 - プログラミングを効率的に教えるための新しいツール -. 電子情報通信学会技術研究報告 (Web). 2022. 122. 191. 42-47
  • 鈴木 優介, 林 子易, 井関 文一, 村上 洋一. JupyterLab 上での実行ログのリアルタイム取得と学習状況の可視化. 電子情報通信学会技術研究報告 (Web). 2022. 121. 406. 54-58
  • 村上 洋一, 水口 賢司. 【情報システム】インタラクトームレベルのデータセットを用いたタンパク質間相互作用予測とその応用. 東京情報大学研究論集. 2018. 22. 1. 63-74
  • 村上洋一. 計算科学によるタンパク質間相互作用予測と創薬応用. 新・実学ジャーナル. 2018. 1+2月号. 1-2
  • Eiji Kanamori, Yuko Tsuchiya, Yoichi Murakami, Joy Sarmiento, Shide Liang, Daron Standley, Matsuyuki Shirota, Kengo Kinoshita, Haruki Nakamura. Prediction of Protein-Protein Complex Structures Using a Docking Server, surFit. PROTEIN SCIENCE. 2012. 21. 178-178
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特許 (1件):
  • エピトープ均質化抗体パネル、ならびにその作製方法および利用
書籍 (3件):
  • ケモインフォマティクスにおけるデータ収集の最適化と解析手法
    技術情報協会 2023 ISBN:9784861049446
  • 情報のちから-情報×看護で情報社会・少子超高齢社会の課題に挑む (シリーズ実学の森)
    東京農業大学出版会 2018 ISBN:4886944833
  • in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術
    技術情報協会 2018 ISBN:9784861046889
学歴 (3件):
  • 2012 - 博士(理学)大阪大学
  • 2006 - 2009 大阪大学大学院 生命機能研究科 生命機能専攻
  • 2004 - 2006 University of Sussex School of Life Sciences, MSc. Bioinformatics
学位 (1件):
  • 博士(理学) (大阪大学)
経歴 (6件):
  • 2019/04 - 現在 東京情報大学 総合情報学部 総合情報学科 准教授
  • 2017/04 - 2019/03 東京情報大学 総合情報学部 総合情報学科 助教
  • 2015/04 - 2017/03 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト プロジェクト研究員
  • 2012/04 - 2015/03 東北大学 情報科学研究科 博士研究員
  • 2009/04 - 2012/03 医薬基盤研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト 特任研究員
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所属学会 (3件):
情報処理学会 ,  CBI(シービーアイ)学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会
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