- 2022 - 2027 いつ、どこで、どのように、核酸の高次構造は形成し機能するのかを予測する
- 2021 - 2024 生物種の分類枠組みを超えた網羅解析による多元応答深化の解明
- 2021 - 2024 多元応答ゲノム機構の解明
- 2018 - 2023 細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御
- 2019 - 2022 細胞内で機能するRNA構造スイッチの最適化および合理的設計技術の構築
- 2019 - 2022 核酸構造のトポロジーによる遺伝子発現の化学的制御
- 2016 - 2019 核酸構造の多様性に基づく新規の遺伝暗号Dimensional Codeの解析
- 2014 - 2017 複数遺伝子の同時・並列転写制御によるヒト細胞内での遺伝子発現ネットワークの構築
- 2012 - 2015 遺伝子発現に重要な関与をする核酸の非標準構造のエネルギーデータベース化とその活用
- 2012 - 2014 新生RNAの合理的な構造遷移速度制御に基づく細胞内におけるRNAスイッチの機能化
- 2010 - 2011 Protein Folding Codonによるタンパク質機能調節機構の解明
- 2009 - 2010 Protein-RNA conjugateによる細胞内代謝産物のイメージング
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