- 2023 - 2026 Kaiシステムの自律振動過程で生じるKaiC-KaiA/KaiB結合モードの時間依存的変調
- 2012 - 2016 イェロープロテインの構造と光反応: 一般性と多様性
- 2011 - 2014 蛋白質の構造機能要素の抽出と応用の為の基盤整備
- 2011 - 2013 PASドメインタンパク質の相互作用多様化機構の解析
- 2008 - 2012 天然変性蛋白質のモデル系開発と揺らぎと構造形成相関の解析
- 2009 - 2010 PASドメインタンパク質の多様な情報伝達は共通の機構で駆動しているか?
- 2008 - 2010 蛋白質機能を支えるダイナミクスの解明
- 2006 - 2007 センサータンパク質における多様な機能獲得機構の解析
- 2003 - 2007 機能性タンパク質の動力学と折り畳み
- 2005 - 2006 蛋白質の構造と機能を司る弱い相互作用
- 2004 - 2005 多様なPASドメインタンパク質の相互作用機構は同一か
- 2004 - 2005 アミノ酸配列の単純化によるタンパク質構造構築原理と機能分化機構の研究
- 2002 - 2003 PASドメイン類似タンパク質PYPの相互作用解析
- 2001 - 2003 イェロープロテインの構造、物性および機能
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