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J-GLOBAL ID：201802210431062195   整理番号：18A1840257

集団ダイズゲノムからのQTLに基づく共線性解析を用いた新規大豆油含量関連遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of novel soybean oil content-related genes using QTL- based collinearity analysis from the collective soybean genome

資料名： Nongye Kexue Xuebao(Yingwenban)  (Nongye Kexue Xuebao(Yingwenban))
巻： 17  号： 8  ページ： 1727-1735  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2625A  ISSN： 2095-3119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ダイズは食用植物油の世界的主要供給源である。ダイズ油関連量的形質遺伝子座(QTL)は集団ゲノムに位置しているので,これらの分布QTLの分類システムを確立することが急務である。共線プラットフォームは,QTL間の関係を特性化し,同定するのに有用であり,新しい遺伝子発見に役立つ可能性がある。本研究では,共線形MCScanXアルゴリズムと集団的ダイズゲノム情報を用いて,ダイズ油関連QTLをマッピングした共線性ブロックを構築した。結果は,666の共線性ブロックが20の染色体を通してダイズゲノムにおいて検出され,そして,521の共線性関係が242の有効ダイズ油関連QTLの231に存在したことを示した。これは214の包接関係と307の交差関係を含んだ。それらの間で,ダイズ油含有量に関連するQTL間の共線性は,2つの染色体上に共線性を持つQTLの大部分によって,7つの染色体の最大と1つの染色体の最小に関して示された。共線性を持つダイズ油QTLにおける重複するホットスポット領域を用いて,新規な油含量関連遺伝子についてマイニングした。全体として,ダイズにおける油含量と関連した23の推定機能遺伝子を同定し,多くの注釈データベースを用いてそれらを注釈した。著者らの知見はダイズ油関連QTL間の進化的関係を解明するための価値ある枠組みを提供し,ダイズ油含量に関連する機能的マーカー支援育種の基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  アノテーション ,  育種 ,  キャラクタリゼーション ,  アルゴリズム ,  ホットスポット ,  量的形質遺伝子座 ,  *大豆油 ,  *遺伝子 ,  *ダイズ ,  *ゲノム ,  染色体 ,  線形性
準シソーラス用語： 機能遺伝子 ,  ゲノム情報 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 豆類  (FC03035U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 集団 ,  ダイズ ,  ゲノム ,  QTL ,  解析 ,  大豆油 ,  含量 ,  遺伝子 ,  同定