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J-GLOBAL ID：201802210476436377   整理番号：18A0793159

脂質エレクトロポア形成の空間時間的熱マップの計算:統計的アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Computing Spatiotemporal Heat Maps of Lipid Electropore Formation: A Statistical Approach

著者 (6件)： Wriggers Willy (Institute of Biomedical Engineering, Old Dominion University) ,  Wriggers Willy (Department of Mechanical and Aerospace Engineering, Old Dominion University) ,  Castellani Federica (Frank Reidy Research Center for Bioelectrics, Old Dominion University) ,  Kovacs Julio A. (Institute of Biomedical Engineering, Old Dominion University) ,  Kovacs Julio A. (Department of Mechanical and Aerospace Engineering, Old Dominion University) ,  Vernier P. Thomas (Frank Reidy Research Center for Bioelectrics, Old Dominion University)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 4  ページ： 22  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 脂質二分子層や溶媒のような液体への良く構造化された蛋白質の分子動力学シミュレーションを解釈するために独自に開発されたマルチスケール時空間熱マップ戦略を拡張した。著者らの解析は,エレクトロポレーションの実験的および理論的研究,すなわち,十分な大きさの電場の影響下での細胞膜の外部に課されたブリーチングを形成する。エレクトロポレーションのナノスケール構造を理解するために,脂質と溶媒の粗粒相互作用ネットワークの時間領域データを,最も関連する構成分子の空間熱マップに変換した。この応用は,二分子層における脂質の接触形成と破壊活性を説明することにより,以前のグラフベースの活性機能を利用する。周期的境界条件下での脂質相互作用ネットワークの新しい解析により,破壊活性により測定された二分子層の破壊は外部に課された細孔形成と関連することを示した。さらに,破壊活性は,速い自由度と遅い自由度の間の架橋を通して,個々の脂質と溶媒分子の重要性を統計的にランク付けするために使用できる。熱マップ法は,少数の重要な脂質と溶媒分子を強調し,機能的に関連する機構に対する軌跡を効率的に探索することを可能にした。このアルゴリズムはオープンソースパッケージTimeScapesにより自由に分散される。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子動力学 ,  タンパク質 ,  電場 ,  相互作用 ,  アルゴリズム ,  エレクトロポレーション ,  脂質二分子膜 ,  細胞膜 ,  ネットワーク ,  計算機シミュレーション ,  二分子層 ,  構造形成 ,  自由度 ,  *脂質
準シソーラス用語： ナノスケール ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 分子動力学 ,  軌道解析 ,  多重時間スケール ,  相互情報 ,  距離幾何学 ,  接触ネットワーク

分類 (1件)： 生体膜一般  (EF04010G)

タイトルに関連する用語 (4件)： 脂質 ,  マップ ,  計算 ,  統計