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J-GLOBAL ID：201802211002454975   整理番号：18A1191431

ヒト破骨細胞における骨ミネラル密度GWAS変異体の発現量的形質遺伝子座研究【JST・京大機械翻訳】

Expression Quantitative Trait Locus Study of Bone Mineral Density GWAS Variants in Human Osteoclasts

著者 (16件)： Mullin Benjamin H (Department of Endocrinology and Diabetes, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Australia) ,  Mullin Benjamin H (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Zhu Kun (Department of Endocrinology and Diabetes, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Australia) ,  Zhu Kun (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Xu Jiake (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Brown Suzanne J (Department of Endocrinology and Diabetes, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Australia) ,  Mullin Shelby (Department of Endocrinology and Diabetes, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Australia) ,  Mullin Shelby (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Tickner Jennifer (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Pavlos Nathan J (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Dudbridge Frank (Department of Health Sciences, University of Leicester, Leicester, UK) ,  Walsh John P (Department of Endocrinology and Diabetes, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Australia) ,  Walsh John P (Medical School, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Wilson Scott G (Department of Endocrinology and Diabetes, Sir Charles Gairdner Hospital, Nedlands, Australia) ,  Wilson Scott G (School of Biomedical Sciences, University of Western Australia, Crawley, Australia) ,  Wilson Scott G (Department of Twin Research and Genetic Epidemiology, King’s College London, London, UK)
資料名： Journal of Bone and Mineral Research  (Journal of Bone and Mineral Research)
巻： 33  号： 6  ページ： 1044-1051  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1633A  ISSN： 0884-0431  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨粗鬆症は強い遺伝的成分を有する複雑な疾患である。ゲノムワイド関連研究(GWAS)は,骨パラメータに関連する共通の遺伝的変異体を同定するのに非常に成功している。最近発表された研究により,骨ミネラル密度(BMD)に対する最大GWASの結果が報告されており(n=142,487),遺伝的に有意なレベルで推定BMD(eBMD)と関連した307の条件的に独立した一塩基多型(SNP)を同定した。これらの変異体の大部分は非コードSNPである。疾患特異的細胞型を用いた発現量的形質遺伝子座(eQTL)研究は,観察されたGWAS関連が仲介される可能性がある遺伝子を同定するためにGWASからの結果とますます統合されている。著者らは,158人の参加者からin vitroで分化した細胞を用いて,独特のヒト破骨細胞特異的eQTLデータセットを作成した。著者らは,この資源を用いて,近い遺伝子(±500kb)との関連のために最近同定されたBMD GWAS SNPの307を特性化した。複数の試験に対する補正後,24の変異体が破骨細胞様細胞における32の遺伝子の発現と有意に関連していることが分かった。バイオインフォマティクス分析は,これらの変異体とそれらとの強い連鎖不均衡におけるそれらが調節領域に富むことを示唆した。同定されたeQTL関連のいくつかは,骨,特にIQGAP1,CYP19A1,CTNNB1,およびCOL6A3において役割を持つ遺伝子に関連している。多くの関連性に対する証拠の支持は,公開されているeQTLデータセットから得られた。また,GLDNとCYP19A1遺伝子の両方に関連する染色体15q21.2上の調節領域の存在に対する強い証拠を生み出した。結論として,ユニークな破骨細胞特異的eQTL資源を生成し,これを用いて,破骨細胞生物学の機能的研究を知らせるべき最近同定されたBMD GWAS遺伝子座に対する32eQTL関連を同定した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 骨粗鬆症 ,  *遺伝子 ,  キャラクタリゼーション ,  *破骨細胞 ,  *遺伝 ,  調節遺伝子 ,  *ヒト ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  in vitro実験 ,  *骨密度 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 連鎖不平衡 ,  バイオインフォマティクス ,  細胞型 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 細胞/組織シグナル伝達-パラクリン経路 ,  破骨細胞 ,  骨粗鬆症 ,  遺伝子研究 ,  人間関連研究

分類 (5件)： 代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： ヒト ,  破骨細胞 ,  骨ミネラル密度 ,  GWAS ,  変異体 ,  発現量的形質遺伝子座 ,  研究