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J-GLOBAL ID：201802211193473415   整理番号：18A0786824

比較ゲノム解析はAcidithiobacillus ferriovorans株CF27のライフスタイルと鉄酸化性酸性チオバシルゲノムのキメラ性質に関する洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genome Analysis Provides Insights into Both the Lifestyle of Acidithiobacillus ferrivorans Strain CF27 and the Chimeric Nature of the Iron-Oxidizing Acidithiobacilli Genomes

著者 (10件)： Tran Tam T. T. (Aix-Marseille Universite, CNRS, LCB) ,  Mangenot Sophie (Laboratoire de Biologie Moleculaire pour l’Etude des Genomes, C.E.A., Institut de Genomique - Genoscope) ,  Magdelenat Ghislaine (Laboratoire de Biologie Moleculaire pour l’Etude des Genomes, C.E.A., Institut de Genomique - Genoscope) ,  Payen Emilie (Laboratoire de Biologie Moleculaire pour l’Etude des Genomes, C.E.A., Institut de Genomique - Genoscope) ,  Rouy Zoe (CNRS UMR8030, CEA/DSV/IG/Genoscope, Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Genomique et le Metabolisme) ,  Belahbib Hassiba (Aix-Marseille Universite, CNRS, LCB) ,  Grail Barry M. (College of Natural Sciences, Bangor University) ,  Johnson D. Barrie (College of Natural Sciences, Bangor University) ,  Bonnefoy Violaine (Aix-Marseille Universite, CNRS, LCB) ,  Talla Emmanuel (Aix-Marseille Universite, CNRS, LCB)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1009  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 鉄酸化化学種Acidithiobacillus ferrivoransは,低温(<10°C)で第一鉄を酸化し,無機硫黄化合物を還元することができる少数の好酸性菌の一つである。At.ferovorans株CF27のゲノムを完成させるために,新しい配列を作成し,更新集合と機能的アノテーションを行い,ゲノムが公開されている他のAcidithiobacillus種との比較分析を行った。At.ferovorans CF27ゲノムは3,409,655bpの染色体と46,453bpのプラスミドから成る。at.ovorans CF27は低温,金属(loid)に富む環境への適応を可能にする遺伝子を持ち,環境変化を感知することを可能にする他に,At.ferovorans CF27をhosti条件を回避し,好ましい場所に向かって移動させることを可能にする。興味あることに,At.ferovorans CF27のゲノムは多数のゲノム島(大部分は未知機能の遺伝子を含む)を示し,多くの遺伝子が時間とともに水平遺伝子移動により獲得されることを示唆した。さらに,At.ferovorans CF27に特異的ないくつかの遺伝子が同定され,他のAcidithiobacillus種と比較してこの株の表現型の違いの原因となる可能性があることが確認された。分析されたAt.ferovorans CF27特異的遺伝子クラスターの内側に位置するほとんどの遺伝子は,第一鉄増殖および硫黄付着細胞の両方により発現され,それらが偽遺伝子ではなく,両方の状況で役割を果たしている可能性があることを示した。Acidithiobacillus infersのゲノムの分類学的組成の分析は,それらが自然にキメラであることを示し,それらが特定の分類学的クラスに属するという前提を支持し,他の蛋白質サブグループと異なる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 硫黄 ,  低温 ,  *酸化 ,  プラスミド ,  *キメラ ,  遺伝子 ,  *ゲノム ,  表現型 ,  好酸性 ,  タンパク質 ,  硫黄化合物 ,  *酸性
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  *Acidithiobacillus ,  *比較ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Acidithiobacillus ,  鉄の酸化 ,  硫黄代謝 ,  キメラゲノム ,  好酸性菌 ,  心理的耐性

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (11件)： 比較ゲノム ,  解析 ,  Acidithiobacillus ,  株 ,  ライフスタイル ,  鉄酸 ,  化性 ,  酸性 ,  キメラ ,  性質 ,  洞察