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J-GLOBAL ID：201802211293181621   整理番号：18A0806677

特異的遺伝子座増幅断片配列決定を用いたSweet Osmanthus(Osmanthus fragrans Lour.)における最初の遺伝地図【JST・京大機械翻訳】

The First Genetic Map in Sweet Osmanthus (Osmanthus fragrans Lour.) Using Specific Locus Amplified Fragment Sequencing

著者 (6件)： He Yanxia (Plant Germplasm Resources and Genetic Laboratory, College of Life Sciences, Henan University) ,  Yuan Wangjun (Institute of Pharmacy, Pharmaceutical College of Henan University) ,  Dong Meifang (Plant Germplasm Resources and Genetic Laboratory, College of Life Sciences, Henan University) ,  Han Yuanji (Plant Germplasm Resources and Genetic Laboratory, College of Life Sciences, Henan University) ,  Shang Fude (Plant Germplasm Resources and Genetic Laboratory, College of Life Sciences, Henan University) ,  Shang Fude (Woe Key Laboratory of Plant Stress Biology, Henan University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 1621  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Osmanthus fragransはかなりの商業価値の観賞植物であり,この種の遺伝子連鎖地図はこれまでに報告されていない。特異的遺伝子座増幅フラグメント配列決定(SLAF-seq)は,大量の一塩基多型(SNP)が同定され,高分解能遺伝子タイピングを可能にする最近開発された技術である。本研究では,206.92Mのpaired-end readsと173,537のSLAFマーカーで構成されるSLAF-seqを用いて,O.fragransの最初の遺伝的地図を作成した。合計90,715の多形SLAFマーカーの中で,15317の多形性SLAFsを遺伝子地図構築のために用いることができた。統合地図は,23の遺伝子連鎖群に分類された14,189の高品質SLAFsを含み,合計長は2962.46cMで,平均距離は2つの隣接マーカー間で0.21cmであった。さらに,マッピングされたマーカーから23,664のSNPが同定された。知る限り,これはO.fragransの遺伝地図の最初である。著者らの結果は,SLAF-seqがマーカーを開発し,高密度連鎖地図を構築するための非常に効果的な方法であることをさらに実証した。本研究で報告されたSNPマーカーと遺伝子地図は将来の研究における価値ある資源である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 一塩基多型 ,  *遺伝 ,  観賞植物 ,  *モクセイ属 ,  高分解能 ,  連鎖地図 ,  *遺伝子地図
準シソーラス用語： SNPマーカー ,  高密度 ,  高品質 ,  多型性 ,  遺伝子タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝地図 ,  擬似試験 ,  SLAF-seq ,  SNP ,  Osmanthus fragrans

分類 (3件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  精油,香料  (YG03020H)

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝子座 ,  増幅 ,  断片 ,  Osmanthus ,  遺伝地図