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J-GLOBAL ID：201802211339311278   整理番号：18A0470791

比較エピゲノミクスはジャガイモとトマトにおける重複遺伝子の進化を明らかにする【Powered by NICT】

Comparative epigenomics reveals evolution of duplicated genes in potato and tomato

著者 (9件)： Wang Lin (State Key Laboratory of Ecological Pest Control for Fujian and Taiwan Crops, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian, 350002, China) ,  Xie Jiahui (State Key Laboratory of Ecological Pest Control for Fujian and Taiwan Crops, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian, 350002, China) ,  Hu Jiantuan (State Key Laboratory of Ecological Pest Control for Fujian and Taiwan Crops, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian, 350002, China) ,  Lan Binyuan (State Key Laboratory of Ecological Pest Control for Fujian and Taiwan Crops, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian, 350002, China) ,  You Chenjiang (College of Life Sciences and Oceanography, Guangdong Provincial Key Laboratory for Plant Epigenetics, Shenzhen University, Shenzhen, 518060, China) ,  You Chenjiang (Department of Botany and Plant Sciences, Institute of Integrative Genome Biology, University of California, Riverside, CA, 92521, USA) ,  Li Fenglan (College of Life Sciences, Northeast Agricultural University, Harbin, 150030, China) ,  Wang Zhengjia (State Key Laboratory of Subtropical Silviculture, Zhejiang Agriculture and Forestry University, Hangzhou, Zhejiang, 311300, China) ,  Wang Haifeng (State Key Laboratory of Ecological Pest Control for Fujian and Taiwan Crops, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian, 350002, China)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 93  号： 3  ページ： 460-471  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 倍数化後の重複遺伝子の進化は,多くの進化生物学研究の主題であった。ジャガイモ(Solanum tuberosum)およびトマト(Solanum lycopersicum)はasteridsの最初の二配列決定されたゲノムであり,共通の倍数化イベントを共有している。しかし,倍数体から誘導された重複遺伝子の進化に及ぼすDNAメチル化の後成的役割は完全には理解されていない。ここでは,ジャガイモとトマトにおける重複遺伝子の進化におけるDNAメチル化の役割を調べた。DNAメチル化の全体的なレベルは異なっているが,ジャガイモとトマトで類似しているDNAメチル化のパターン。異なるタイプの重複遺伝子のジャガイモとトマトにおける異なるメチル化パターンを示すことができる。添加では,重複遺伝子のメチル化レベルの差異は遺伝子発現の相違と関連していたことを見出した。特に,大部分重複遺伝子対の1コピーは常に異なるトマト果実の成熟段階を通じた他のコピーと比較して低メチルを高orであり,これらの遺伝子は転写因子(TF)活性に関連した特定の機能に濃縮されている。百重複TFの転写はトマト果実の成熟段階,そのうちのいくつかは,よく知られた果実成熟TFである時のDNAメチル化により調節されることが示された。まとめると,著者らの結果は,DNAメチル化は重複遺伝子の分岐進化を促進し,トマト果実の成熟などの重要な生物学的過程において役割を果たしている可能性があるという考えを支持する。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： メチル化 ,  *トマト ,  *遺伝子 ,  ゲノム ,  転写因子 ,  倍数体 ,  遺伝子発現 ,  *ジャガイモ
準シソーラス用語： 生物学的過程 ,  果実の成熟 ,  DNAメチル化 ,  倍数体化 ,  *オーバーラップ遺伝子 ,  *エピゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 比較エピゲノミクス ,  DNAメチル化 ,  重複遺伝子 ,  倍数体化 ,  ジャガイモ ,  トマト

分類 (2件)： 野菜  (FC03043X) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： エピゲノミクス ,  ジャガイモ ,  トマト ,  重複遺伝子 ,  進化