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J-GLOBAL ID：201802211346530563   整理番号：18A0965323

宿主内C型肝炎ウイルス変異株の伝染性【JST・京大機械翻訳】

Transmissibility of intra-host hepatitis C virus variants

著者 (5件)： Campo David S. (Division of Viral Hepatitis, Molecular Epidemiology and Bioinformatics, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, USA) ,  Zhang June (Division of Viral Hepatitis, Molecular Epidemiology and Bioinformatics, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, USA) ,  Zhang June (Department of Electrical Engineering, University of Hawaii, Manoa, USA) ,  Ramachandran Sumathi (Division of Viral Hepatitis, Molecular Epidemiology and Bioinformatics, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, USA) ,  Khudyakov Yury (Division of Viral Hepatitis, Molecular Epidemiology and Bioinformatics, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 10  ページ： 881  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 宿主内C型肝炎ウイルス(HCV)集団は遺伝的に不均一であり,サブ集団で組織化されている。輸血を除いて,HCVの伝達は少数の遺伝的変異体を介して起こり,その効果はしばしばボトルネックとして記述される。ボトルネックに関連する伝染の確率は,通常,ソースとレシピエントの場合に同定されたHCV集団間の遺伝的差異を説明するために使用され,それは新しい宿主における集団を成功裏に確立するためにHCV変異体の宿主内HCV進化と生物学的容量によってさらに悪化する可能性がある。透過性を実験的超深配列(UDS)データから測定できる特性として定式化した。UDSデータは疫学的に定義されたソースを含む1つの大きなC型肝炎発生から得られ,HCVバリアントのKステップネットワークが構築され,ソースからの個々のHCV変異体の透過性とネットワーク中心性の間の潜在的関連性を同定するために使用された。透過の既知方向性を有する9つの他のHCV発生から得られた付加的データセットを検証のために用いた。透過性はソースの変異体の高頻度に依存せず,少数の変異体の伝達の以前の観察を支持した。中心性のすべての試験された測定の中で,透過性の最高の相関がHamming中心性(r=0.720;p=1.57E-71)で見出された。発生源からのHCV変異体の間の遺伝的距離と透過性の差の間の相関は0.3276(Mantel試験,p=9.99E-5)であることが分かり,遺伝的近接性と透過性の間の関係を示した。0.565-0.947の範囲の強い相関が,9つの付加的な透過クラスタの7つのHamming中心性と透過性の間で観察された(p<0.05)。伝送は排他的な確率過程ではない。本研究で形式的に測定された透過性は,ソースからのHCV株によって占められる遺伝的空間における変異体の位置を定義する特定の生物学的性質と関連している。この測定は他の高度に不均一なウイルスにも適用できる。発生調査の精度の改善に加えて,この知見は慢性HCV感染の確立に寄与する分子機構の理解を助ける。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ ,  疫学 ,  *C型肝炎 ,  確率過程 ,  *感染 ,  *C型肝炎ウイルス ,  ネットワーク ,  指向性 ,  *ウイルス ,  遺伝
準シソーラス用語： 分子機構 ,  C型肝炎ウイルス感染 ,  近接性 ,  遺伝距離 ,  透過性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (37件)：

• Hepatology; Global epidemiology of hepatitis C virus infection: new estimates of age-specific antibody to HCV seroprevalence; K Mohd Hanafiah, J Groeger, AD Flaxman, ST Wiersma; 57; 4; 2013; 1333-1342; 10.1002/hep.26141; citation_id=CR1
• World J Gastroenterol; Epidemiology of hepatitis C virus infection; M Alter; 13; 17; 2007; 2436-2441; 10.3748/wjg.v13.i17.2436; citation_id=CR2
• Ann Intern Med; The increasing burden of mortality from viral hepatitis in the United States between 1999 and 2007; KN Ly, J Xing, RM Klevens, RB Jiles, JW Ward, SD Holmberg; 156; 4; 2012; 271-278; 10.7326/0003-4819-156-4-201202210-00004; citation_id=CR3
• Topics Antiviral Med; The hidden epidemic of hepatitis C virus infection in the United States: occult transmission and burden of disease; JW Ward; 21; 1; 2013; 15-19; citation_id=CR4
• Healthcare-Associated Hepatitis B and C Outbreaks Reported to CDC in 2008-2013 [http://www.cdc.gov/hepatitis/Outbreaks/HealthcareHepOutbreakTable.htm].

タイトルに関連する用語 (4件)： 宿主 ,  C型肝炎ウイルス ,  変異株 ,  伝染