文献

J-GLOBAL ID：201802211356283437   整理番号：18A0475706

いくつかの基本的な集団遺伝学分析のサンプリング近縁種の影響【Powered by NICT】

Effects of sampling close relatives on some elementary population genetics analyses

著者 (1件)： Wang Jinliang (Institute of Zoology, Zoological Society of London, London, UK)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 18  号： 1  ページ： 41-54  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの分子生態学分析は遺伝子型個体は集団からランダムにサンプリングされると仮定し,個体群の代表である。現実的,しかし,例えば,局在化した稚魚は多産種から引き出されるため試料は過剰な近縁種(ECR)を含む可能性がある。我々の知識はE CRが日常的に行った基本遺伝学分析にどのように影響するか,とE CRが最良の不偏で正確なパラメータ推定を与えることをいかに取り扱っているかについて限られている。マーカーデータのいくつかのポピュラーな集団遺伝学分析に対するECR効果,対立遺伝子頻度,F-,予測ヘテロ接合性(H_e),対立遺伝子の効果的で観察された数,Hardy-Weinberg平衡(HWE)と連鎖平衡(LE)の試験の推定を含むを定量化した。もその影響を緩和するために正確なパラメータ推定を得るためにECRを取り扱うためのいくつかの戦略を検討した。シミュレーションによって支援された,私の分析研究は,ECRは,上記マーカー解析の全てに大きなと全体的な影響を持つことを示した。ECRを無視した単純の単純な手法は,精度とパラメータしばしば偏った推定値をもたらすことができ,HWEおよびLEのあまりにも多くの偽除去を引き起こす可能性がある。,ECR,慎重なアプローチ,ECRを説明しナイーブ対立遺伝子頻度推定を用いた目標パラメータ(例えば,H_e)を推定することを同定し,除去する単純,大胆なアプローチは,バイアスと偽HWEおよびLE除去を除去が,推定精度を大幅に減らすことができる。,対立遺伝子頻度,対立遺伝子頻度に依存する標的パラメータ推定におけるECRを考慮した尤度手法は,通常,不偏で最も正確なパラメータ推定値を生成する。四つのアプローチのどれが最も効果的で効率的な実施する特定のマーカー分析に依存する。結果を理解する集団特性とマーカー特性のマーカーデータを用いたとの関連で考察した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 対立遺伝子 ,  パラメータ推定 ,  *遺伝学 ,  推定量 ,  遺伝子頻度 ,  遺伝子型 ,  バイアス ,  予測 ,  稚魚 ,  個体群 ,  *集団遺伝
準シソーラス用語： 尤度 ,  推定精度 ,  ヘテロ接合性 ,  *近縁種 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 対立遺伝子頻度 ,  F統計 ,  遺伝的変異 ,  Hardy-Weinberg平衡 ,  連鎖平衡

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 集団遺伝学 ,  分析 ,  サンプリング ,  近縁種