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J-GLOBAL ID：201802211784531340   整理番号：18A1141610

オントロジーアラインメント評価イニシアティブにおける解剖学トラックからの経験【JST・京大機械翻訳】

Experiences from the anatomy track in the ontology alignment evaluation initiative

著者 (4件)： Dragisic Zlatan (Department of Computer and Information Science and Swedish e-Science Research Centre, Linkoping University, Linkoping, Sweden) ,  Ivanova Valentina (Department of Computer and Information Science and Swedish e-Science Research Centre, Linkoping University, Linkoping, Sweden) ,  Li Huanyu (Department of Computer and Information Science and Swedish e-Science Research Centre, Linkoping University, Linkoping, Sweden) ,  Lambrix Patrick (Department of Computer and Information Science and Swedish e-Science Research Centre, Linkoping University, Linkoping, Sweden)
資料名： Journal of Biomedical Semantics (Web)  (Journal of Biomedical Semantics (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 56  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7401A  ISSN： 2041-1480  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Ontology Alignment評価イニシアティブにおける最も長い走行軌道の1つは,2つの解剖学的オントロジーを整列させることに焦点を合わせたAnatomy軌道である。Anatomトラックは2005年に開始された。2005年と2006年に,この軌道におけるタスクは,AnatomyとOpenGalen AnatomモデルのFoundationモデルを調整することであった。2007年以来,トラックで使用されているオントロジーは,Adult Mouse AnatomyとNCI Thesaurusの一部である。2015年以来,Anatomトラックにおけるデータはまた,オントロジー評価イニシアティブのInteractiveトラックにおいても使用されている。本論文では,2007~2016年のAnatomyトラックと2015~2016年のInteractiveトラックのAnatomy部分に焦点を合わせた。著者らは,データセットと変化を記述する。そして,それは,オントロジーアラインメントシステムのために,それが持つ課題と同様に,年の間に入った。さらに,トラックに参加した全てのシステムの概要とそれらを用いた技術を示した。システムの性能結果を議論し,一般的な傾向を要約した。約50のシステムがAnatom軌道に参加した。多くの異なる技術を用いた。最も一般的なマッチング技術は,ストリングベースの戦略と構造ベースの技術である。多くのシステムも補助情報を使用する。アラインメントの品質は,トラックの開始以来,最良の実行システムに対して増加し,より多くのシステムは,提案されたアラインメントのコヒーレンスをチェックし,修理戦略を実行する。さらに,オラクルとの相互作用は有益である。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アラインメント ,  マッチング ,  *オントロジー ,  *トラック ,  品質 ,  相互作用 ,  解剖学 ,  コヒーレンス ,  走行
準シソーラス用語： オラクル ,  *オントロジーアライメント , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： オントロジーアラインメント ,  生物医学オントロジー ,  オントロジーアラインメント評価イニシアチブ

分類 (1件)： 人工知能  (JE08000Z)

引用文献 (174件)：

• Achichi M, Cheatham M, Dragisic Z, Euzenat J, Faria D, Ferrara A, Flouris G, Fundulaki I, Harrow I, Ivanova V, Jiménez-Ruiz E, Kuss E, Lambrix P, Leopold H, Li H, Meilicke C, Montanelli S, Pesquita C, Saveta T, Shvaiko P, Splendiani A, Stuckenschmidt H, Todorov K, Trojahn C, Zamazal O. Results of the ontology alignment evaluation initiative 2016 In: Shvaiko P, Euzenat J, Jiménez-Ruiz E, Cheatham M, Hassanzadeh O, Ichise R, editors. Proceedings of the 11th International Workshop on Ontology Matching, volume 1766 of CEUR Workshop Proceedings: 2016. p. 73-129.
• Aguirre JL, Eckert K, Euzenat J, Ferrara A, van Hage WR, Hollink L, Meilicke C, Nikolov A, Ritze D, Scharffe F, Shvaiko P, Sváb-Zamazal O, Trojahn C, Jiménez-Ruiz E, Cuenca Grau B, Zapilko B. Results of the ontology alignment evaluation initiative 2012. In: Shvaiko P, Euzenat J, Kementsietsidis A, Mao M, Noy N, Stuckenschmidt H, editors. Proceedings of the 7th International Workshop on Ontology Matching, volume 946 of CEUR Workshop Proceedings: 2012. p. 73-115.
• Bioinformatics; Cobra: a bio-ontology editor; S Aitken, R Korf, B Webber, J Bard; 21; 6; 2005; 825-6; 10.1093/bioinformatics/bti097; citation_id=CR3
• Ba M, Diallo G. Servomap and servomap-lt results for oaei 2012. In: Shvaiko P, Euzenat J, Kementsietsidis A, Mao M, Noy N, Stuckenschmidt H, editors. Proceedings of the 7th International Workshop on Ontology Matching, volume 946 of CEUR Workshop Proceedings: 2012. p. 197-204.
• J Biomed Semant; Towards valid and reusable reference alignments - ten basic quality checks for ontology alignments and their application to three different reference data sets; E Beisswanger, U Hahn; 3; Suppl 1; 2012; S4:1-S4:14; 10.1186/2041-1480-3-S1-S4; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： オントロジーアラインメント ,  評価 ,  解剖学 ,  トラック ,  経験