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J-GLOBAL ID：201802212003680745   整理番号：18A0742132

出芽酵母の1011の分離株におけるゲノム進化

Genome evolution across 1,011 Saccharomyces cerevisiae isolates

著者 (22件)： PETER Jackson (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  FRIEDRICH Anne (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  PFLIEGER David (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  SIGWALT Anastasie (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  FREEL Kelle (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  SCHACHERER Joseph (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  DE CHIARA Matteo (Univ. Cote d’Azur, Nice, FRA) ,  YUE Jia-Xing (Univ. Cote d’Azur, Nice, FRA) ,  BERGSTROEM Anders (Univ. Cote d’Azur, Nice, FRA) ,  BARRE Benjamin (Univ. Cote d’Azur, Nice, FRA) ,  LLORED Agnes (Univ. Cote d’Azur, Nice, FRA) ,  LITI Gianni (Univ. Cote d’Azur, Nice, FRA) ,  CRUAUD Corinne (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  LABADIE Karine (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  AURY Jean-Marc (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  ISTACE Benjamin (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  ENGELEN Stefan (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  LEMAINQUE Arnaud (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  WINCKER Patrick (Genoscope, Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Evry, FRA) ,  LEBRIGAND Kevin (Univ. Cote d’Azur, Valbonne, FRA) ,  BARBRY Pascal (Univ. Cote d’Azur, Valbonne, FRA) ,  WINCKER Patrick (Univ. d’Evry Val d’Essonne, Evry, FRA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 556  号： 7701  ページ： 339-344  発行年： 2018年04月19日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 集団ゲノミクスの大規模研究は,自然個体群の表現型多様性を調べるのに不可欠である。今回我々は,出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)の1011の分離株について,全ゲノム塩基配列解読および表現型解析を行った結果を報告する。これらの結果を総合することで,この酵母の表現型において種規模の全体像を形作るゲノムバリアントの正確な進化的描像が得られた。ゲノム解析から,この種が単一の「出中国」起源を持ち,その後数回の独立した栽培化事象を経たことが裏付けられた。栽培化を経験した分離株は,倍数性,異数性,ゲノム量に高い多様性が見られるが,野生分離株におけるゲノム進化は主に一塩基多型の蓄積によって駆動されていた。共通して見られる特徴はヘテロ接合性の広範な消失であり,これが,主として無性なこの種における個体間多様性の不可欠な供給源になっている。実験的に特定された機能的多型を含む一塩基多型の大半は,非常に低い頻度で存在していた。ゲノム規模の関連によって特定されたバリアントで最も数が多かったのはコピー数変化であり,これは一塩基多型よりも大きな表現型効果を有していた。今回の情報資源は,この古典的なモデル系における今後の集団ゲノミクスおよび遺伝子型-表現型研究の指針となるだろう。Copyright Nature Japan KK 2018

シソーラス用語： モデル ,  *ゲノム ,  *酵母 ,  遺伝子型 ,  ヌクレオチド配列 ,  コピー数 ,  個体群 ,  一塩基多型 ,  表現型
準シソーラス用語： ヘテロ接合性 ,  異数性 ,  栽培化 ,  ゲノミクス ,  *ゲノム進化 ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (3件)： 出芽酵母 ,  分離株 ,  ゲノム進化