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J-GLOBAL ID：201802212074460715   整理番号：18A1594023

定着した系統ゲノミクスはクモ類(双翅目,尾類)の進化を明らかにし,ヌクレオチドとアミノ酸間の不一致を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Anchored phylogenomics unravels the evolution of spider flies (Diptera, Acroceridae) and reveals discordance between nucleotides and amino acids

著者 (14件)： Gillung Jessica P. (Bohart Museum of Entomology, University of California, One Shields Ave, Davis, CA 95616, USA) ,  Gillung Jessica P. (California State Collection of Arthropods, 3294 Meadowview Rd, Sacramento, CA 95832, USA) ,  Winterton Shaun L. (California State Collection of Arthropods, 3294 Meadowview Rd, Sacramento, CA 95832, USA) ,  Bayless Keith M. (California Academy of Sciences, 55 Music Concourse Drive, San Francisco, CA 94118, USA) ,  Khouri Ziad (Bohart Museum of Entomology, University of California, One Shields Ave, Davis, CA 95616, USA) ,  Borowiec Marek L. (School of Life Sciences, Social Insect Research Group, Arizona State University, Tempe, AZ, 85287, USA) ,  Yeates David (National Research Collections Australia, Clunies Ross Street, Acton, ACT 2601, GPO Box 1700, Canberra, ACT 2601, Australia) ,  Kimsey Lynn S. (Bohart Museum of Entomology, University of California, One Shields Ave, Davis, CA 95616, USA) ,  Misof Bernhard (Center for Molecular Biodiversity Research, Zoological Research Museum Alexander Koenig, 53113 Bonn, Germany) ,  Shin Seunggwan (Department of Biological Sciences, University of Memphis, 3700 Walker Avenue, Memphis, TN 38152, USA) ,  Zhou Xin (Department of Entomology, China Agricultural University, Beijing 100193, China) ,  Mayer Christoph (Center for Molecular Biodiversity Research, Zoological Research Museum Alexander Koenig, 53113 Bonn, Germany) ,  Petersen Malte (Center for Molecular Biodiversity Research, Zoological Research Museum Alexander Koenig, 53113 Bonn, Germany) ,  Wiegmann Brian M. (Department of Entomology & Plant Pathology, North Carolina State University, 3114 Gardner Hall, Raleigh, NC 27695-7613, USA)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 128  ページ： 233-245  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 系統ゲノミクスの開始は,生物多様性に関する新しい展望を提供しながら,多数の挑戦的進化的疑問の解決に貢献した。しかし,いくつかの例において,大規模なゲノムデータセットの分析は,系統発生の相反する推定をもたらすこともできる。ここで著者らは,43のグループ内のacrocer類分類群の240の遺伝子座の固定されたハイブリッド濃縮とトランスクリプトームのデータに基づいて構築された,双翅類の捕食寄生者ファミリーの最初の系統学的規模研究を提示する。クモのハエ進化のタイミングに対する新しい仮説を提案した。これは,Aroceridaeの起源が以前に提案されていたよりも若いことを示すために,化石化された出生死過程を含む発散時間年代測定における最近の進歩を示している。著者らの系統発生学的推論のロバスト性を試験するために,著者らは,スーパーマトリックスと石炭ベースのアプローチ,最尤法とBayes法を含む異なる系統発生評価基準を用いて,データの順列,均一対不均一モデル,代替データと分類セットのような他のアプローチと組み合わせたデータセットを分析した。アミノ酸とヌクレオチドに基づく結果としてのトポロジーは強く支持されるが,主にPanopinaeの単系統性に関しては決定的に不一致である。対立は第3コドン位置における組成不均一性と飽和を制御することにより解決されず,異なるバイアスが異なるデータ源にどのように影響するかのより良い理解の必要性を強調した。著者らの研究において,ヌクレオチドに基づく結果は,データの変化と異なる分析法の両方に対してよりロバストであり,先端の形態と宿主利用のパターンの現在の理解とより互換性があった。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  互換性 ,  トランスクリプトーム ,  *双翅類 ,  *ヌクレオチド ,  生物多様性 ,  形態 ,  化石 ,  系統発生 ,  *アミノ酸 ,  バイアス ,  コドン ,  位相幾何学 ,  最尤法
準シソーラス用語： *ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ベイズ推論 ,  バイオインフォマティクス ,  衝突 ,  双翅目 ,  化石化された出生死プロセス ,  系統誤差

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： 定着 ,  系統 ,  ゲノミクス ,  クモ類 ,  双翅目 ,  尾 ,  進化 ,  ヌクレオチド ,  アミノ酸