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J-GLOBAL ID：201802212118996849   整理番号：18A0787244

インドネシア,Towuti湖からの鉄含有堆積物における細胞外DNAの保存と重要性【JST・京大機械翻訳】

Preservation and Significance of Extracellular DNA in Ferruginous Sediments from Lake Towuti, Indonesia

著者 (8件)： Vuillemin Aurele (GFZ German Research Centre for Geosciences, Section 5.3: Geomicrobiology) ,  Horn Fabian (GFZ German Research Centre for Geosciences, Section 5.3: Geomicrobiology) ,  Alawi Mashal (GFZ German Research Centre for Geosciences, Section 5.3: Geomicrobiology) ,  Henny Cynthia (Research Center for Limnology, Indonesian Institute of Sciences) ,  Wagner Dirk (GFZ German Research Centre for Geosciences, Section 5.3: Geomicrobiology) ,  Crowe Sean A. (Department of Microbiology and Immunology, University of British Columbia, Vancouver) ,  Crowe Sean A. (Department of Earth, Ocean, and Atmospheric Sciences, University of British Columbia, Vancouver) ,  Kallmeyer Jens (GFZ German Research Centre for Geosciences, Section 5.3: Geomicrobiology)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1440  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞外DNAは土壌と堆積物に普遍的であり,水生系における環境DNAの支配的画分を構成する。理論において,細胞外DNAは,水カラムと堆積物において,土地に関して生じるプロセスによって生じる保存のいろいろな等級において持続するゲノム要素から成った。細胞外DNAは栄養源として取り込まれ,微生物によって排出されるか,分解されるか,あるいは鉱物マトリックス上に吸着されるので,過去の環境からの情報を保存する可能性がある。細胞外DNAが湖沼条件を記録するかどうかを試験するために,インドネシア,Towutiの無酸素堆積物から細胞外および細胞内DNAを連続的に抽出した。著者らは,堆積物中の細胞外DNAの内因性源から外因性を識別するために,両画分に16S rRNA遺伝子Illina配列を適用した。堆積物中の細胞外DNAとして排他的に見出された環境配列は複数の起源に由来した。例えば,Actinobacteria,Verrucomibia,およびAcidobacteriaは流域の土壌から由来した。水カラムにおける限られた一次生産性は有酸素光域における藍藻類の配列をほとんどもたらさなかったが,水体の層別化は好気性及び嫌気性従属栄養による二次生産を主にもたらした。水-堆積物界面における沈降有機物とプランクトン配列の主な分解者であるChloroflexiとPlancomycetesは,埋没の初期段階の間に優先的に保存された。細胞外DNAの内因性供給源を追跡するために,細胞内DNAにおける分類群の相対存在量を用いて,微生物集団が成長し,減少するか,または堆積物深さによる低密度で持続することを定義した。細胞溶解は細胞外DNAの重要な付加的供給源となり,他の微生物属が深さとともにより豊富になったので,以前の遺伝的集合を徐々にカバーした。活性微生物による栄養素としての細胞外DNAの使用は,最も低いGC含量を有する配列の選択的除去をもたらした。浅い湖沼堆積物中に保存された細胞外DNAは初期の環境状況を反映しているが,徐々に改変され,それによりその層序的状況からシフトすると結論した。細胞外DNAの外因性および内因性源の識別は,湖内および堆積後の過程を同時に扱うことを可能にする。より深い堆積物において,静止期の蓄積と細胞溶解からの配列は,古代DNAが標的化されると厳しい抽出と特異的プライマーを必要とする。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 栄養素 ,  プランクトン ,  *鉄 ,  沈降 ,  藍藻類 ,  *DNA【核酸】 ,  流域 ,  好気性 ,  湖沼堆積物 ,  湖沼 ,  ゲノム ,  有機物 ,  嫌気性 ,  *堆積物
準シソーラス用語： *細胞外DNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 細胞外DNA ,  細胞内DNA ,  環境アーカイブ ,  細胞溶解 ,  GC含量 ,  含鉄堆積物 ,  towuti湖 ,  ICDP掘削

分類 (3件)： 有機地球化学  (DD01043K) ,  河川汚濁  (SB02020F) ,  重金属とその化合物一般  (SB05021R)

タイトルに関連する用語 (7件)： インドネシア ,  湖 ,  鉄 ,  堆積物 ,  細胞外DNA ,  保存 ,  重要性