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J-GLOBAL ID：201802212156922016   整理番号：18A2064828

喘息における気道病理学的不均一性: トポロジー的データ解析を用いた疾患マイクロクラスタの可視化【JST・京大機械翻訳】

Airway pathological heterogeneity in asthma: Visualization of disease microclusters using topological data analysis

著者 (15件)： Siddiqui Salman (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Shikotra Aarti (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Richardson Matthew (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Doran Emma (Genentech, South San Francisco, Calif) ,  Choy David (Genentech, South San Francisco, Calif) ,  Bell Alex (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Bell Alex (Department of Mathematics, University of Leicester, Leicester, United Kingdom) ,  Austin Cary D. (Genentech, South San Francisco, Calif) ,  Eastham-Anderson Jeffrey (Genentech, South San Francisco, Calif) ,  Hargadon Beverley (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Arron Joseph R. (Genentech, South San Francisco, Calif) ,  Wardlaw Andrew (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Brightling Christopher E. (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom) ,  Heaney Liam G. (Centre for Infection and Immunity, Health Sciences Building, Queens University Belfast, Belfast, United Kingdom) ,  Bradding Peter (Department of Infection Immunity and Inflammation, Institute for Lung Health, University of Leicester, Glenfield Hospital, Leicester, United Kingdom)
資料名： Journal of Allergy and Clinical Immunology  (Journal of Allergy and Clinical Immunology)
巻： 142  号： 5  ページ： 1457-1468  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0182B  ISSN： 0091-6749  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 喘息は気道壁内の病理学的変化により支えられる複雑な慢性疾患である。構造的気道病理学と細胞炎症の変化が喘息の発現と重症度にどのように寄与するかはほとんど理解されていない。したがって,疾患クラスタと微小クラスタを可視化する目的で,トポロジー的データ解析(TDA)を用いて病理学的不均一性を評価した。202人の成人患者(142人の喘息患者と60人の健康な被験者)と外部複製集団(重症喘息の59人の患者)の発見集団を評価した。病理学と遺伝子発現を気管支生検試料で調べた。病理学的変数のみを用いてTDAを適用し,病理学的に駆動された視覚ネットワークを作成した。発見コホートにおいて,TDAはグループレベル統計によりマスクされた複数のマイクロクラスタ/領域を持つ4グループ/ネットワークを同定した。特に,TDA群1は,軽度から中等度の喘息患者への健康な被験者を結びつけるトポロジー的連続体を表すマイクロクラスタを有する健常被験者の高い割合から成った。中等度から重度の喘息を伴う3つの付加的なTDA群(気道平滑筋細胞高,網膜基底膜~高,および再モデル化~低群)を同定し,病理学的および臨床的特徴を変化させた多数の微小クラスターを含んだ。相互排他的なT_H2とT_H17組織遺伝子発現特徴は,すべての病理学的群で確認された。重症喘息サブグループに適用した発見と外部複製は,持続的相同性の分析を通して,非常に類似した「病理学的データ形状」のみを同定した。TDAを用いて喘息の新しい病理学的表現型を同定し複製した。この方法は他の複雑な慢性疾患に適用できる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  遺伝子発現 ,  *病理学 ,  *不均一性 ,  炎症 ,  成人 ,  表現型 ,  生検 ,  *データ解析 ,  患者 ,  *喘息 ,  *可視化 ,  *位相幾何学
準シソーラス用語： 被験者 ,  健康 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 重症ぜん息 ,  改造 ,  気道炎症 ,  トポロジー的データ解析 ,  表現型

分類 (1件)： 呼吸器の疾患  (GI03000Z)

タイトルに関連する用語 (9件)： 喘息 ,  気道 ,  病理学 ,  不均一性 ,  トポロジー ,  データ解析 ,  疾患 ,  マイクロクラスタ ,  可視化