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J-GLOBAL ID：201802212293764965   整理番号：18A0819525

標的mRNA超並列配列決定法を用いた体液同定-EUROFORGEN/EDNAP共同運動の結果【JST・京大機械翻訳】

Body fluid identification using a targeted mRNA massively parallel sequencing approach - results of a EUROFORGEN/EDNAP collaborative exercise

著者 (37件)： Ingold S. (Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Switzerland) ,  Dorum G. (Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Switzerland) ,  Hanson E. (National Center for Forensic Science, University of Central Florida, Orlando, USA) ,  Berti A. (Carabinieri Scientific Department of Rome- Genetic Unit, Rome, Italy) ,  Branicki W. (Malopolska Centre of Biotechnology of the Jagiellonian University, Gronostajowa st. 7A, 30-387, Krakow, Poland) ,  Brito P. (National Institute of Legal Medicine and Forensic Sciences, Portugal) ,  Elsmore P. (Orchid Cellmark Ltd., Abingdon, UK) ,  Gettings K.B. (National Institute of Standards and Technology, Material Measurement Laboratory, Gaithersburg, MD, United States) ,  Giangasparo F. (Department of Pharmacy and Forensic Science, King’s College London, Franklin-Wilkins Building, 150 Stamford Street, London, UK) ,  Gross T.E. (Institute of Legal Medicine, Medical Faculty, University of Cologne, Germany) ,  Hansen S. (Department of Forensic Biology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Hanssen E.N. (Department of Forensic Biology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Kampmann M.-L. (Section of Forensic Genetics, Department of Forensic Medicine, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Denmark) ,  Kayser M. (Department of Genetic Identification, Erasmus MC University Medical Center Rotterdam, Rotterdam, The Netherlands) ,  Laurent F.-X. (Laboratoire de Police Scientifique de Lyon, Institut National de Police Scientifique, F-69134, Ecully, France) ,  Morling N. (Section of Forensic Genetics, Department of Forensic Medicine, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Denmark) ,  Mosquera-Miguel A. (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Spain) ,  Parson W. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Austria) ,  Parson W. (Forensic Science Program, Pennsylvania State University, PA, USA) ,  Phillips C. (Forensic Genetics Unit, Institute of Forensic Sciences, University of Santiago de Compostela, Spain) ,  Porto M.J. (National Institute of Legal Medicine and Forensic Sciences, Portugal) ,  Pospiech E. (Malopolska Centre of Biotechnology of the Jagiellonian University, Gronostajowa st. 7A, 30-387, Krakow, Poland) ,  Roeder A.D. (Orchid Cellmark Ltd., Abingdon, UK) ,  Schneider P.M. (Institute of Legal Medicine, Medical Faculty, University of Cologne, Germany) ,  Schulze Johann K. (Institute of Legal Medicine, University of Muenster, Germany) ,  Steffen C.R. (National Institute of Standards and Technology, Material Measurement Laboratory, Gaithersburg, MD, United States) ,  Syndercombe-Court D. (Department of Pharmacy and Forensic Science, King’s College London, Franklin-Wilkins Building, 150 Stamford Street, London, UK) ,  Trautmann M. (Gerhard-Domagk-Institute of Pathology, University Hospital Muenster, Germany) ,  van den Berge M. (Division of Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, P.O. Box 24044, 2490 AA, The Hague, The Netherlands) ,  van der Gaag K.J. (Division of Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, P.O. Box 24044, 2490 AA, The Hague, The Netherlands) ,  Vannier J. (Laboratoire de Police Scientifique de Lyon, Institut National de Police Scientifique, F-69134, Ecully, France) ,  Verdoliva V. (Carabinieri Scientific Department of Rome- Genetic Unit, Rome, Italy) ,  Vidaki A. (Department of Genetic Identification, Erasmus MC University Medical Center Rotterdam, Rotterdam, The Netherlands) ,  Xavier C. (Institute of Legal Medicine, Medical University of Innsbruck, Austria) ,  Ballantyne J. (National Center for Forensic Science, University of Central Florida, Orlando, USA) ,  Ballantyne J. (Department of Chemistry, University of Central Florida, PO Box 162366, Orlando, FL, 32816-2366, USA) ,  Haas C. (Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Switzerland)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 34  ページ： 105-115  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 以前の研究において,Illina MiSeq/FGX MPSプラットフォームに対して最適化されたヒト体液の同定のための標的mRNA配列決定のためのアッセイを提示した。このアッセイは,イオン電流PGM/S5プラットフォームに対する付加的な自家設計アッセイと共に,17EUROFORGENとEDNAP実験室内の共同運動の基礎であり,体液を同定する標的mRNA配列決定の有効性を試験した。作業は,指定されたプロトコルに従って,供給された乾燥体液の染色を分析すること,およびヒトの起源について,参加者自身のbonfまたはモックのcase研究サンプルを分析することであった。Illina MiSeq/FGXおよびIon Torrent PGM/S5プラットフォームに対する提供されたプライマープールは,それぞれ33および29の体液特異的標的を含み,血液,唾液,精液,膣分泌,月経血液および皮膚を同定した。結果は,非標的体液における数がほとんどない場合には,体液または関心のある組織において中程度から高い計数値を示した。読み取り数にはいくつかの実験室間変動があったが,全体として,実験室の結果は,高度に発現したマーカーが高い読出し数を示し,より少ない発現マーカーがより低い計数を示した。血液,月経血,唾液及び精液マーカー及び試料が良くクラスター化されたデータについて部分最小二乗(PLS)分析を行った。この協調的mRNA超並列配列決定(MPS)運動の結果は,方法論的MPSパネルのレパートリーに加えることができる信頼できる体液同定法として標的mRNA配列決定を支援した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  精液 ,  プロトコル ,  *体液 ,  ヒト ,  部分最小二乗法 ,  パネル ,  イオン電流 ,  月経 ,  *mRNA ,  分泌 ,  *超並列処理 ,  クラスタ化
準シソーラス用語： 月経血 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 法科学 ,  体液同定 ,  mRNAプロファイリング ,  超並列シークエンシング

分類 (1件)： 法医学  (GA03000B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 標的 ,  mRNA ,  超並列 ,  体液 ,  同定 ,  共同運動