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J-GLOBAL ID：201802212384111416   整理番号：18A1394118

系統発生シグナルの選択と純粋性は,自由生活のLitostomateans(原生動物門,繊毛虫門)の進化史の再構築におけるアルファ-チューブリンの有用性に挑戦する【JST・京大機械翻訳】

Selection and paucity of phylogenetic signal challenge the utility of alpha-tubulin in reconstruction of evolutionary history of free-living litostomateans (Protista, Ciliophora)

著者 (2件)： Rajter Lubomir (Department of Zoology, Comenius University in Bratislava, 842 15 Bratislava, Slovak Republic) ,  Vdacny Peter (Department of Zoology, Comenius University in Bratislava, 842 15 Bratislava, Slovak Republic)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 127  ページ： 534-544  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クラスLitostomateaは高度に多様ではあるが単系統群を表し,自由生活と内共生繊毛虫の両方を結合している。リボソームRNA遺伝子とITS領域配列は,主要な同腹子系統を認識し,定義するのに役立ったが,それらの相互関係を明確に解明するための十分な系統発生シグナルを提供しなかった。本研究では,α-チューブリンをコードする遺伝子を追加することにより,主な自由生活捕食系統間の解像度を改善することを試みた。しかし,著者らの系統発生分析は,自由生活の住血吸虫の進化史の再構築におけるα-チューブリンの性能を挑戦した。繊毛虫α-チューブリン遺伝子に関連するいくつかの相互に相互接続された問題を同定した:系統発生的シグナルの不足,分子ホモプラスおよび非中性進化。正の選択は分子ホモプラシー(平行進化)を発生させる可能性があるが,負の選択は少数の変化を引き起こす可能性があり,したがって系統発生的な情報性がほとんどない可能性がある。両問題はヌクレオチド及びアミノ酸α-チューブリン配列において遭遇し,種々の選択的圧力の作用を示した。多くの必須の生物学的過程におけるα-チューブリンの関与を考慮すると,この蛋白質は,系統発生的関係の再構築のための不適切な分子マーカーになる可能性があるという選択により,非常に強く影響を受ける可能性がある。したがって,チューブリン遺伝子が系統発生および/または系統発生分析に含まれるとき,大きな注意が払われなければならない。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *チューブリン ,  *再構成 ,  *系統発生 ,  ヌクレオチド ,  吸虫類 ,  *繊毛虫類 ,  遺伝子 ,  rRNA ,  アミノ酸 ,  HOMO
準シソーラス用語： 平行進化 ,  ホモプラシー ,  系統解析 ,  αチューブリン ,  内部共生 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： D_N/D_s比 ,  ハプテン ,  分子ホモプラシー ,  Rhynchostomatia ,  リボソームRNA ,  置換率

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 系統発生 ,  シグナル ,  原生動物門 ,  繊毛虫門 ,  進化史 ,  再構築 ,  チューブリン ,  有用性