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J-GLOBAL ID：201802213079253082   整理番号：18A1296470

腸メタゲノムデータベースにおける遺伝毒性および/または炎症性細菌遺伝子の存在と炎症性腸疾患との関連の可能性【JST・京大機械翻訳】

The Presence of Genotoxic and/or Pro-inflammatory Bacterial Genes in Gut Metagenomic Databases and Their Possible Link With Inflammatory Bowel Diseases

著者 (9件)： Roche-Lima Abiel (Center for Collaborative Research in Health Disparities - RCMI Program, Medical Sciences Campus, University of Puerto Rico) ,  Carrasquillo-Carrion Kelvin (Center for Collaborative Research in Health Disparities - RCMI Program, Medical Sciences Campus, University of Puerto Rico) ,  Gomez-Moreno Ramon (Department of Biochemistry, Medical Sciences Campus, University of Puerto Rico) ,  Gomez-Moreno Ramon (Molecular Sciences Research Center, University of Puerto Rico) ,  Cruz Juan M. (Department of Biochemistry, Medical Sciences Campus, University of Puerto Rico) ,  Velazquez-Morales Dayanara M. (Center for Collaborative Research in Health Disparities - RCMI Program, Medical Sciences Campus, University of Puerto Rico) ,  Rogozin Igor B. (National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine) ,  Baerga-Ortiz Abel (Department of Biochemistry, Medical Sciences Campus, University of Puerto Rico) ,  Baerga-Ortiz Abel (Molecular Sciences Research Center, University of Puerto Rico)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 9  ページ： 116  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ヒト腸内微生物相は,重要な生化学的プロセスを仲介する微生物の動的コミュニティである。腸内微生物組成の違いは,炎症性腸疾患(IBD)および他の腸疾患と関連している。本研究では,健康なヒト被験者のコホートに対するIBDを有する個人からのサンプルのメタゲノムのウォールゲノム配列(mWGSs)において見出された8つの遺伝毒性および/または炎症性細菌遺伝子の頻度を定量化し比較した。【方法】8つの選択された遺伝子配列は,大腸菌からのclbN,CLBB,cif,CNF-1,usp,TCPC,Enterococcus faecalisからのgelE,およびAkkermansia mucininiからのMurBであった。また,大腸菌およびE.faecalis由来の保存MurB遺伝子の配列を,試料中の腸内細菌または腸球菌の存在のマーカーとして含めた。遺伝子配列は,炎症を促進するか,または培養細胞または動物モデルにおいてDNA損傷を引き起こすために正常な細胞過程を破壊するために以前に報告された能力に基づいて選択された。それはIBDにおける役割にリンクすることができた。選択された配列は,ヒト微生物プロジェクト(HMP)を通してアクセスされた3つの異なるmWGSデータセットにおいて検索された:健康なコホート(N=251),クローン病コホート(N=60)および潰瘍性大腸炎コホート(N=17)。結果:最初に,腸内細菌科と腸球菌からのMurBハウスキーピング遺伝子の配列は,IBDにおいてより頻繁に見られた(IBDで32%大腸菌,IBDで12%,IBDで13%E.faecalis),IBDでこれら両分類群のより高い存在の以前の報告を確認した。著者らの研究におけるいくつかの配列,特にuspとgelEに対して,それらの頻度は健常コホートにおけるよりもIBDコホートにおいてより鋭く増加し,これらの試料における大腸菌またはE.faecalisの存在の増加によって容易に説明されないIBDとの関連を示唆した。結論:著者らの結果は,これらの遺伝毒性または炎症誘発性遺伝子配列とIBDsのいくつかの存在の間の有意な関連を示唆する。さらに,これらの結果は,個々の細菌遺伝子に対する可能な臨床相関の検出におけるHMPデータベースの力と限界を示す。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 大腸菌 ,  潰瘍性大腸炎 ,  *データベース ,  Enterococcus ,  腸内微生物 ,  ヒト ,  Crohn病 ,  培養細胞 ,  *炎症 ,  母集団
準シソーラス用語： 腸内細菌 ,  遺伝子配列 ,  *メタゲノム ,  健康 ,  *炎症性腸疾患 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： メタゲノミクス ,  ヒトミクロビオーム ,  炎症性腸疾患 ,  バイオインフォマティクス ,  USP ,  Gele ,  次世代シーケンシングデータ

分類 (1件)： 消化器の基礎医学  (GH01020E)

タイトルに関連する用語 (8件)： 腸 ,  メタゲノム ,  データベース ,  遺伝毒性 ,  炎症 ,  細菌遺伝子 ,  炎症性腸疾患 ,  可能性