エフェクター駆動真菌病原体進化の遺伝的基礎を理解するための個体群と比較ゲノミクスの利用【JST・京大機械翻訳】

Plissonneau Clemence; Plissonneau Clemence; Benevenuto Juliana; Mohd-Assaad Norfarhan; Mohd-Assaad Norfarhan; Fouche Simone; Hartmann Fanny E.; Croll Daniel; Croll Daniel

文献

J-GLOBAL ID：201802213108040004 整理番号：18A0805232

エフェクター駆動真菌病原体進化の遺伝的基礎を理解するための個体群と比較ゲノミクスの利用【JST・京大機械翻訳】

Using Population and Comparative Genomics to Understand the Genetic Basis of Effector-Driven Fungal Pathogen Evolution

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巻： 8 ページ： 119 発行年： 2017年
JST資料番号： U7094A ISSN： 1664-462X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

菌類植物病原体によって引き起こされる流行は,農業生態系に対する主要な脅威を引き起こし,世界的な食品安全性に影響を及ぼす。ハイスループット配列決定は,病原体が作物に病気を引き起こす方法を理解する上で大きな進歩を可能にした。数百の真菌ゲノムが現在利用可能であり,これらのゲノムを分析することは,疾患におけるエフェクタ遺伝子の重要な役割を強調した。エフェクタは宿主代謝を操作することにより感染を増強する小分泌蛋白質である。真菌ゲノムは100sの推定エフェクタ遺伝子を保有するが,密接に関連する種に対してさえも,エフェクタ遺伝子間の相同性の欠如は進化的及び機能的解析を困難にする。さらに,エフェクタ遺伝子は,集合するのが難しい急速に進化する染色体区画にしばしば見られる。これらの課題に対処するために,集団と比較ゲノミクスツールセットをどのように組み合わせることができるかをレビューした。著者らは,病原体のライフスタイルと異なる環境への適応を伴うゲノム規模の多型性に関連する研究を強調する。著者らは,ゲノム全体の関連研究が,迅速な適応の基礎となるエフェクターおよび他の病原性関連遺伝子を同定するためにどのように使用できるかを示す。また,真菌ゲノムのコアと付属領域への区画化がエフェクタ遺伝子の進化をどのようにしているかについて議論する。ゲノム進化の理解が宿主-病原体共進化の軌跡に重要な洞察を提供することを論じた。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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