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J-GLOBAL ID：201802213544598990   整理番号：18A1296499

Cryptococcus neoformans及びCryptococcus gattiiの分類群内多様性,集団遺伝構造及び進化経路の推定【JST・京大機械翻訳】

Estimating the Intra-taxa Diversity, Population Genetic Structure, and Evolutionary Pathways of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii

著者 (7件)： Munoz Marina (Grupo de Investigaciones Microbiologicas-UR (GIMUR), Programa de Biologia, Facultad de Ciencias Naturales y Matematicas, Universidad del Rosario) ,  Munoz Marina (Centro de Tecnologia en Salud (CETESA), Upqua SAS) ,  Munoz Marina (Posgrado Interfacultades Doctorado en Biotecnologia, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia) ,  Camargo Milena (Centro de Tecnologia en Salud (CETESA), Upqua SAS) ,  Camargo Milena (Departamento de Biologia Molecular e Inmunologia, Fundacion Instituto de Inmunologia de Colombia) ,  Camargo Milena (Doctorado en Ciencias Biomedicas y Biologicas, Universidad del Rosario) ,  Ramirez Juan D. (Grupo de Investigaciones Microbiologicas-UR (GIMUR), Programa de Biologia, Facultad de Ciencias Naturales y Matematicas, Universidad del Rosario)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 9  ページ： 148  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Cryptococcus複合体のメンバーにはCryptococcus neneoans(脳の最も一般的な真菌感染)とCryptococcus gattii(世界中の高い影響出現病原体)が含まれている。現在,真菌多遺伝子座配列タイピングデータベース(Fungal MLSTデータベース)は,これらの病原体の分子タイピングに用いられる遺伝子の価値あるデータリポジトリを構成する。著者らは,7つのハウスキーピング遺伝子に対するFungal MLSTデータベースで利用可能なデータを分析し,分類群内多様性,個体群遺伝構造および進化パターンの記述におけるその寄与を評価することを目的とした。Fungal MLSTデータベースはC.neneoans(n=487)に対してC.gattii(n=344)よりも多くの報告があるが,対立遺伝子多様性に関して両種について類似の結果が得られた。系統発生学的再構成は両種における分子型によるグループ化を明らかにし,進化パターン(C.neneoansの場合における卒業性とC.gattiiの場合における点状進化)における差異を提案することを可能にした。加えて,C.neneoansは37クローン複合体(CC;CC1が優勢)から成る集団遺伝構造,高架橋[分子型による配列型(ST)グループ化なし,系統発生分析における顕著な発散事象,および少数の遺伝子移入イベント(主にVNIとVNIVの間)を示した。対照的に,C.gattiiは50CCs(CCによるST数のより大きな均一性)と分子型によるクラスタ化を示し,系統発生ネットワークにおける顕著な架橋事象を示した。ハウスキーピング遺伝子の配列に基づくCryptococcus複合体の種に対する分子レベルでの関係を理解することは,これらの新興病原体の進化史を記述するための情報を提供する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ハウスキーピング遺伝子 ,  データベース ,  クラスタ化 ,  複合体 ,  *Cryptococcus neoformans ,  対立遺伝子 ,  *Cryptococcus ,  クローン ,  病原体 ,  系統発生 ,  遺伝子 ,  再構成
準シソーラス用語： 系統解析 ,  多座位配列タイピング ,  *Cryptococcus gattii , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： C.neoformans ,  C.Gattii ,  多遺伝子座配列タイピング(MLST) ,  対立遺伝子多様性 ,  人口構造 ,  進化史

分類 (5件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  感染症・寄生虫症の診断  (GD01020S) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (7件)： Cryptococcus ,  分類 ,  多様性 ,  集団遺伝構造 ,  進化 ,  経路 ,  推定