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J-GLOBAL ID：201802213894760348   整理番号：18A0889315

シプロフロキサシン耐性株の配列決定と分析【JST・京大機械翻訳】

The transcriptome sequencing analysis of ciprofloxacin-resistant avian Pasteurella multocida

著者 (5件)： Kong Lingyan (安徽農業大学動物科技学院,安徽合肥230036;湖北省農業科学院畜牧獣医研究所,湖北武漢430064) ,  Luo Qingping (湖北省農業科学院畜牧獣医研究所,湖北武漢,430064) ,  Lu Qin (湖北省農業科学院畜牧獣医研究所,湖北武漢,430064) ,  Shao Huabin (湖北省農業科学院畜牧獣医研究所,湖北武漢,430064) ,  Li Jinnian (安徽農業大学動物科技学院,安徽合肥,230036)
資料名： Zhongguo Yufang Shouyixuebao  (Zhongguo Yufang Shouyixuebao)
巻： 39  号： 4  ページ： 262-266  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3099A  ISSN： 1008-0589  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： AvianPasteurellamultocida(Pm)の感受性株とシプロフロキサシン(Cip)耐性株の差次的発現遺伝子を同定した。本研究では、ハイスループットトランスクリプトーム配列のRNA-seq技術を用い、感受性株とCip耐性株に対して検査を行い、Pm70株のゲノム(NC_002663.1)を参考にして、スプライシングと品質評価を行い、配列データの処理を行った後、発現差異遺伝子を獲得した。蛍光定量PCRを用いて、トランスクリプトーム配列における差異発現遺伝子を検証した。結果、すべてのサンプルシークエンシングデータを参考にPm70全ゲノムのマッチング率は95.87%以上に達し、遺伝子差異発現に対して分析後、19個の差次的発現遺伝子が得られ、そのうち15個はアップレギュレーションし、4個は下方制御された。GO機能の濃縮分析により、差次的発現遺伝子は主に輸送輸送機能であり、差異発現遺伝子に対して信号経路の濃縮分析を行ったところ、最も代表的なシグナル伝達経路は「ABCトランスポーター」(ko02010)であることが分かった。鳥由来Pm中のABC輸送体スーパーファミリーはCip耐性メカニズムにおいて重要な役割を果たす可能性があると推測した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 感受性菌 ,  定量的PCR法 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  *耐性菌 ,  ABC輸送体 ,  蛍光 ,  トランスクリプトーム ,  脂環式化合物 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族フッ素化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  ケト酸
準シソーラス用語： 耐性機構 ,  品質評価 ,  RNA-seq ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： avian Pasteurella multocida ,  RNA sequencing ,  GO analysis ,  KEGG pathways analysis ,  resistance mechanism

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： シプロフロキサシン

タイトルに関連する用語 (3件)： シプロフロキサシン ,  耐性株 ,  分析