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J-GLOBAL ID：201802214083924599   整理番号：18A1946956

実験とシステムレベルの組合せ分析はヒト神経形成中のmiR-124の複雑な調節ネットワークを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Combined Experimental and System-Level Analyses Reveal the Complex Regulatory Network of miR-124 during Human Neurogenesis

著者 (17件)： Kutsche Lisa K. (Technische Universitaet Dresden, DFG Research Center for Regenerative Therapies, Dresden 01307, Germany) ,  Gysi Deisy M. (Department of Computer Science, Bioinformatics Group, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig 04107, Germany) ,  Gysi Deisy M. (Faculty of Mathematics and Computer Science, Swarm Intelligence and Complex Systems Group, University of Leipzig, Leipzig 04109, Germany) ,  Gysi Deisy M. (Faculty for Biology, Chemistry and Pharmacy, Freie Universitaet Berlin, Institute for Biology, Berlin 14195, Germany) ,  Fallmann Joerg (Department of Computer Science, Bioinformatics Group, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig 04107, Germany) ,  Lenk Kerstin (Technische Universitaet Dresden, DFG Research Center for Regenerative Therapies, Dresden 01307, Germany) ,  Petri Rebecca (Department of Experimental Medical Science, Laboratory of Molecular Neurogenetics, Wallenberg Neuroscience Center and Lund Stem Cell Center, Lunds Universitet, Lund 22184, Sweden) ,  Swiersy Anka (Technische Universitaet Dresden, DFG Research Center for Regenerative Therapies, Dresden 01307, Germany) ,  Klapper Simon D. (Technische Universitaet Dresden, DFG Research Center for Regenerative Therapies, Dresden 01307, Germany) ,  Pircs Karolina (Department of Experimental Medical Science, Laboratory of Molecular Neurogenetics, Wallenberg Neuroscience Center and Lund Stem Cell Center, Lunds Universitet, Lund 22184, Sweden) ,  Khattak Shahryar (Technische Universitaet Dresden, DFG Research Center for Regenerative Therapies, Dresden 01307, Germany) ,  Stadler Peter F. (Department of Computer Science, Bioinformatics Group, Interdisciplinary Center for Bioinformatics, University of Leipzig, Leipzig 04107, Germany) ,  Stadler Peter F. (Max Planck Institute for Mathematics in the Sciences, Leipzig 04103, Germany) ,  Stadler Peter F. (Santa Fe Institute, 1399 Hyde Park Road, Santa Fe, NM 87501, USA) ,  Jakobsson Johan (Department of Experimental Medical Science, Laboratory of Molecular Neurogenetics, Wallenberg Neuroscience Center and Lund Stem Cell Center, Lunds Universitet, Lund 22184, Sweden) ,  Nowick Katja (Faculty for Biology, Chemistry and Pharmacy, Freie Universitaet Berlin, Institute for Biology, Berlin 14195, Germany) ,  Busskamp Volker (Technische Universitaet Dresden, DFG Research Center for Regenerative Therapies, Dresden 01307, Germany)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 7  号： 4  ページ： 438-452.e8  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コードRNAは神経発生を含む多くの生物学的過程を調節する。脳に富むmiR-124は,その複合体を介して神経分化の重要なプレーヤーとして割り当てられているが,数千のアノテーションされた標的についてはほとんど理解されていない。その調節機能を系統的にチャートするために,CRISPR/Cas9遺伝子編集を用いて,ヒト誘導多能性幹細胞における全6つのmiR-124対立遺伝子を破壊した。ニューロン誘導により,miR-124欠失細胞は神経形成を受け,形態と神経伝達物質の変化を変化させたが,機能的ニューロンになった。RNA誘導サイレンシング複合体沈殿を用いて,98の高信頼性miR-124標的を同定し,それらのいくつかは生存率の低下に直接導いた。高度転写因子ネットワーク分析を行うことにより,アポトーシス,ニューロンサブタイプ分化,および以前に特性化されていない亜鉛フィンガー転写因子の調節に対する間接的miR-124効果を同定した。著者らのデータは,ヒト脳で見出された多様な神経細胞型の神経形成におけるそれらの関与を含む,包括的には,また,miRNA機能を明らかにするために,実験的およびシステムレベル分析の組み合わせの必要性を強調する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分化 ,  *ヒト ,  アノテーション ,  アポトーシス ,  生存率 ,  *ネットワーク ,  複合体 ,  キャラクタリゼーション ,  ニューロン ,  転写因子 ,  対立遺伝子 ,  多能性幹細胞
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *miR-124 ,  *神経発生 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： システム生物学 ,  miRNA調節 ,  miRNA動力学 ,  MiR-124のtargeトーム ,  遺伝子調節ネットワーク分析 ,  miRNA転写因子ネットワーク ,  ニューロンmiRNA ,  AGO2-RIP-seq ,  ヒト幹細胞からのニューロン分化 ,  ZNF787

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発生と分化  (EJ16020W) ,  生物学的機能  (EB04020F)

タイトルに関連する用語 (7件)： 実験 ,  組合せ ,  分析 ,  ヒト ,  神経形成 ,  miR-124 ,  調節ネットワーク