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J-GLOBAL ID：201802214246193614   整理番号：18A0965659

重み付き遺伝子共発現ネットワーク分析による結腸癌生存との関連する転写モジュール【JST・京大機械翻訳】

Associating transcriptional modules with colon cancer survival through weighted gene co-expression network analysis

著者 (8件)： Liu Rong (Department of Clinical Pharmacology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, People’s Republic of China) ,  Liu Rong (Institute of Clinical Pharmacology, Central South University; Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Changsha, People’s Republic of China) ,  Zhang Wei (Department of Clinical Pharmacology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, People’s Republic of China) ,  Zhang Wei (Institute of Clinical Pharmacology, Central South University; Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Changsha, People’s Republic of China) ,  Liu Zhao-Qian (Department of Clinical Pharmacology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, People’s Republic of China) ,  Liu Zhao-Qian (Institute of Clinical Pharmacology, Central South University; Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Changsha, People’s Republic of China) ,  Zhou Hong-Hao (Department of Clinical Pharmacology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, People’s Republic of China) ,  Zhou Hong-Hao (Institute of Clinical Pharmacology, Central South University; Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Changsha, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 361  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:結腸癌(CC)は複雑な遺伝子ネットワークにより影響される不均一な疾患である。このように,ネットワークとCCの間の関係は,腫瘍生物学へのさらなる洞察を得るために解明されなければならない。【結果】mRNA発現から共発現した遺伝子ネットワークを抽出するために使用された強力な技術である加重遺伝子共発現ネットワーク分析を,461人の患者を有する発見データセットにおける11の共同制御モジュールを同定するために実施した。細胞周期過程に富む転写モジュールは,発見(HR=0.59;95%CI=0.42-0.81)および検証(HR=0.51;95%CI=0.25-1.05)データセットにおけるCC患者の無再発生存と相関した。ハブ遺伝子セントロメア蛋白質-A(CENPA)の予後的可能性も同定され,この遺伝子のアップレギュレーションは良好な生存と関連していた。他の細胞周期相関連遺伝子モジュールは,KRAS変異CCサブタイプを有する患者の生存と相関していた。サイクリン依存性キナーゼ1(CDK1)のようなこの共発現モジュールで見出されたそれらを含むいくつかの遺伝子のダウンレギュレーションは,乏しい生存と関連していた。【結論】ネットワークに基づくアプローチは,ステージIIまたはIII CC患者のサブセットの予後に対するバイオマーカーの発見を容易にする可能性があり,これらのアプローチは,直接的な個人化治療を助ける可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 変異 ,  タンパク質 ,  *ネットワーク ,  細胞周期 ,  患者 ,  バイオマーカー ,  *結腸腫瘍 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  治療法 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： mRNA発現 ,  遺伝子ネットワーク ,  *ネットワーク解析 ,  *共発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 大腸癌 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  システム生物学 ,  WGCNA ,  バイオマーカー

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (35件)：

• CA Cancer J Clin; Cancer statistics, 2013; R Siegel, D Naishadham, A Jemal; 63; 1; 2013; 11-30; 10.3322/caac.21166; CR1;
• Proc Natl Acad Sci U S A; Integrated genetic and epigenetic analysis identifies three different subclasses of colon cancer; L Shen, M Toyota, Y Kondo, E Lin, L Zhang, Y Guo, NS Hernandez, X Chen, S Ahmed, K Konishi; 104; 47; 2007; 18654-18659; 10.1073/pnas.0704652104; CR2;
• Arch Pathol Lab Med; Four molecular subtypes of colorectal cancer and their precursor lesions; GH Kang; 135; 6; 2011; 698-703; CR3;
• Gastroenterology; Association Between Molecular Subtypes of Colorectal Cancer and Patient Survival; AI Phipps, PJ Limburg, JA Baron, AN Burnett-Hartman, DJ Weisenberger, PW Laird, FA Sinicrope, C Rosty, DD Buchanan, JD Potter; 30; 14; 2014; 01192-01195; CR4;
• J Clin Oncol; Molecular staging for survival prediction of colorectal cancer patients; S Eschrich, I Yang, G Bloom, KY Kwong, D Boulware, A Cantor, D Coppola, M Kruhoffer, L Aaltonen, TF Orntoft; 23; 15; 2005; 3526-3535; 10.1200/JCO.2005.00.695; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 遺伝子 ,  共発現 ,  ネットワーク分析 ,  結腸癌 ,  生存 ,  転写 ,  モジュール