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J-GLOBAL ID：201802215130326733   整理番号：18A0356440

有害微小藻類のゲノム複雑性【Powered by NICT】

Genome complexity of harmful microalgae

著者 (8件)： Casabianca Silvia (Department of Biomolecular Sciences, University of Urbino, Viale Trieste 296, 61121 Pesaro, Italy) ,  Casabianca Silvia (CoNISMa, Italian Interuniversity Consortium on Marine Sciences, Piazzale Flaminio 9, 00196, Rome, Italy) ,  Cornetti Luca (Institute for Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Winterthurerstrasse 190, Zurich, Switzerland) ,  Capellacci Samuela (Department of Biomolecular Sciences, University of Urbino, Viale Trieste 296, 61121 Pesaro, Italy) ,  Capellacci Samuela (CoNISMa, Italian Interuniversity Consortium on Marine Sciences, Piazzale Flaminio 9, 00196, Rome, Italy) ,  Vernesi Cristiano (Department of Biodiversity and Molecular Ecology, Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, Via E. Mach 1, San Michele all’Adige, 38010 Trento, Italy) ,  Penna Antonella (Department of Biomolecular Sciences, University of Urbino, Viale Trieste 296, 61121 Pesaro, Italy) ,  Penna Antonella (CoNISMa, Italian Interuniversity Consortium on Marine Sciences, Piazzale Flaminio 9, 00196, Rome, Italy)
資料名： Harmful Algae  (Harmful Algae)
巻： 63  ページ： 7-12  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2138A  ISSN： 1568-9883  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 過去10年間に,次世代シークエンシング(NGS)技術は,天然微生物群集の多様性,動力学および代謝経路への新しい洞察を提供した。しかし,これらの新しい技術は,調査した種のゲノム複雑性のゲノムサイズとレベルに関連した課題に直面している。被覆深さとNGSに基づくアプローチによって達成された短鎖読み取り長さも会合のための主要課題である。これらの因子は,参照ゲノムを欠くと複雑性の高レベルにより特性づけられた種に対するこれらのハイスループット配列決定法の使用を制限する可能性がある。本研究では,進化の歴史,主に細菌と単細胞真核生物微小藻類への遺伝子移動事象,有害種を含むのを議論し,レビューし,微生物群集のNGS応用に関係しており,有害藻類ブルーム種と渦鞭毛藻類に特に注目した。遺伝的集団研究の文脈では,NGSに基づくアプローチ,遺伝子型(GBS)は一塩基多型(SNP)の発見と解析に用いることができた。NGS技術はまだ比較的新しく,更なる改善が必要である。特に,大きなデータセット,進化的に高度に動的ゲノムにより特徴づけHAB種の大部分を使用しなければならないを扱うために開発し,標準化ツールとアプローチする必要がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  渦鞭毛虫類 ,  代謝経路 ,  細菌 ,  真核生物 ,  一塩基多型 ,  *ゲノム ,  遺伝
準シソーラス用語： 単一細胞 ,  ハイスループット ,  ゲノムサイズ ,  微生物コンソーシアム ,  次世代シークエンシング ,  *複雑性 ,  *微小藻類 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 珪藻 ,  渦鞭毛藻類 ,  ゲノムサイズ ,  遺伝子タイピングによる配列決定(GBS) ,  有害藻類ブルーム(HABs) ,  一塩基多型(SNPs)

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 微小藻類 ,  ゲノム ,  複雑性