文献

J-GLOBAL ID：201802215369161611   整理番号：18A0805889

ダイズにおける5つのK+輸送体遺伝子ファミリーの詳細なゲノムおよびトランスクリプトーム解析は根粒形成に対するそれらの異なる発現を確認する【JST・京大機械翻訳】

In-Depth Genomic and Transcriptomic Analysis of Five K⁺ Transporter Gene Families in Soybean Confirm Their Differential Expression for Nodulation

著者 (7件)： Rehman Hafiz M. (Department of Biotechnology, Chonnam National University) ,  Nawaz Muhammad A. (Department of Biotechnology, Chonnam National University) ,  Shah Zahid Hussain (Department of Arid Land Agriculture, King Abdul-Aziz University) ,  Daur Ihsanullah (Department of Arid Land Agriculture, King Abdul-Aziz University) ,  Khatoon Sadia (Department of Biosciences, University of Wah) ,  Yang Seung Hwan (Department of Biotechnology, Chonnam National University) ,  Chung Gyuhwa (Department of Biotechnology, Chonnam National University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 804  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物は,成長と発達を調節するために,K+輸送システムの洗練されたネットワークを進化させた。限られたK+資源は,現在,植物需要がどのように満足できるかを調べるために強制している。この複雑な疑問に答えるために,植物におけるK+輸送体のゲノムとトランスクリプトームを理解しなければならない。ここでは,29のHAK/KT/KUP遺伝子,電位依存性K+チャンネルをコードする16の遺伝子,9つのTPK/KCO遺伝子,4つのHKT遺伝子および12のKEA遺伝子を含むダイズから70の推定K+輸送体遺伝子を同定した。ダイズにおける各ファミリーの分子進化を明らかにするために,それらの系統発生,重複の様式,エキソン構造およびスプライスサイトおよびパラログを分析した。さらに,5つの他の双子葉を横切るオーソログのクラスタ化とsynニー分析は,これらの遺伝子ファミリーの進化をさらに調査し,ダイズのデータが他のマメ科植物のモデルとして適切であることを示した。根粒形成に関するGenevestionatorから入手可能なマイクロアレイデータセットを評価し,Webサーバにより利用可能なRNA配列データによりさらに確認した。各ファミリーに対して,表現モデルを,Transcripts PerキロベースMilion(TPM)値に基づいて設計した。結果は,根粒形成に関連した異なる発現を示し,遺伝子の推定上の役割を確認した。著者らのような徹底的な研究は,他の全ての植物におけるK+在庫を理解するための基礎を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  RNA【核酸】 ,  *ゲノム ,  分子進化 ,  系統発生 ,  *遺伝子 ,  ネットワーク ,  *トランスクリプトーム ,  *ダイズ
準シソーラス用語： オルソログ ,  スプライス部位 ,  *根粒形成 ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *遺伝子ファミリー ,  *輸送体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： K+輸送体 ,  HAK/kT/kup ,  電圧ゲートK+チャンネル ,  TPK/KCO ,  HKT ,  KEA ,  ダイズ

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： ダイズ ,  輸送体 ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  トランスクリプトーム解析 ,  根粒形成 ,  発現