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J-GLOBAL ID：201802215587408808   整理番号：18A0787940

ニューイングランド沖の沿岸および斜面水における豊富で活発なプランクトン繊毛虫の分布【JST・京大機械翻訳】

Distribution of Abundant and Active Planktonic Ciliates in Coastal and Slope Waters Off New England

著者 (5件)： Tucker Sarah J. (Department of Biological Sciences, Smith College) ,  McManus George B. (Department of Marine Sciences, University of Connecticut) ,  Katz Laura A. (Department of Biological Sciences, Smith College) ,  Katz Laura A. (Program in Organismic and Evolutionary Biology, University of Massachusetts) ,  Grattepanche Jean-David (Department of Biological Sciences, Smith College)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 2178  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物と古典的海洋食物網を結びつけるそれらの重要な役割にもかかわらず,微生物真核生物の生物地理学的パターンに関するデータは限られており,活性(すなわち,それらの発現遺伝子)コミュニティメンバーを評価するための分子ツールを用いた研究は少ない。海洋繊毛虫多様性はクロロフィル最大で最大と信じられており,そこでは豊富な独立栄養餌食が存在し,しばしば深さとともに減少すると仮定されている。ここでは,新しいイングランド沿岸(北西大西洋)沖の2つの観測所,沿岸(40m深さ)から43km離れた沿岸観測所,および沿岸(1,000m)の斜面観測所において,水柱全体を通して豊富な(DNA)および活性(RNA)海洋繊毛虫群集を評価した。DNAフィンガープリント法を用いて繊毛虫群集を分析し,豊富なコミュニティメンバーのパターンを捕捉する,変性剤化勾配ゲル電気泳動(DGGE)を行った。著者らは,SSU-rDNA(豊富な)とSSU-rRNA(活性)からの繊毛虫群集の推定を比較し,水カラムを通して複雑なパターンを見出し,光帯下の多くの活性系統を含んでいる。著者らの解析は,(1)豊富で活発な多数の広く分布する分類群を明らかにした。(2)沖合試料における分類群の存在/不在のパターンにおけるかなりの不均一性は,水柱全体を通して50m離れた。(3)海岸と深さからの位置に基づく3つの明確な繊毛虫集合。活性(RNA)分類群の分析は,従来のDNAに基づくアプローチ(例えばクローンライブラリー,rDNAアンプリコン研究)に隠された生物多様性をカバーしていない。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 海岸 ,  遺伝子 ,  *プランクトン ,  海洋 ,  DNAフィンガープリント法 ,  ゲル電気泳動 ,  真核生物 ,  生物多様性 ,  不均一性 ,  DNA【核酸】 ,  *繊毛虫類 ,  *沿岸 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 分類群 ,  食物網 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： RNA: DNA ,  深さ ,  繊毛虫 ,  Oligotrichia ,  Choreotrichia ,  DGGE

分類 (5件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  土壌生物  (FB04050N) ,  海洋汚濁  (SB02040B) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (6件)： ニューイングランド ,  沿岸 ,  斜面 ,  プランクトン ,  繊毛虫 ,  分布