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J-GLOBAL ID：201802215858097364   整理番号：18A1805172

単一細胞の発生と再プログラミングの軌跡の調整は筋原性再プログラミング結果の分子決定因子を同定する【JST・京大機械翻訳】

Aligning Single-Cell Developmental and Reprogramming Trajectories Identifies Molecular Determinants of Myogenic Reprogramming Outcome

著者 (23件)： Cacchiarelli Davide (Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM), Armenise/Harvard Laboratory of Integrative Genomics, Pozzuoli, Italy) ,  Cacchiarelli Davide (Department of Translational Medicine, University of Naples Federico II, Naples, Italy) ,  Cacchiarelli Davide (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Qiu Xiaojie (Molecular & Cellular Biology Program, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Qiu Xiaojie (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Srivatsan Sanjay (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Manfredi Anna (Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM), Armenise/Harvard Laboratory of Integrative Genomics, Pozzuoli, Italy) ,  Ziller Michael (Max-Planck Institute of Psychiatry, Munich, Germany) ,  Overbey Eliah (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Grimaldi Antonio (Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM), Armenise/Harvard Laboratory of Integrative Genomics, Pozzuoli, Italy) ,  Grimsby Jonna (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Pokharel Prapti (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Livak Kenneth J. (Fluidigm Corporation, South San Francisco, CA, USA) ,  Li Shuqiang (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Meissner Alexander (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Meissner Alexander (Department of Stem Cell and Regenerative Biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Mikkelsen Tarjei S. (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Mikkelsen Tarjei S. (Department of Stem Cell and Regenerative Biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Mikkelsen Tarjei S. (Harvard Stem Cell Institute, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Rinn John L. (The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA) ,  Rinn John L. (Department of Stem Cell and Regenerative Biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Trapnell Cole (Molecular & Cellular Biology Program, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Trapnell Cole (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA, USA)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 7  号： 3  ページ： 258-268.e3  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 定義された因子の操作による細胞再プログラミングは,治療に使用するために必要な細胞型の大規模生産と遺伝子調節の原理を明らかにするために非常に有望である。しかし,ほとんどの再プログラミングシステムは非効率的であり,セルの一部のみを望ましい状態に変換する。ここでは,単一細胞RNA-seqを用いた擬時間分解能で,明確な因子による直接変換のための良く特性化されたモデル系である筋管へのヒト線維芽細胞のMYOD仲介再プログラミングを解析した。効率的な変換への障壁を明らかにするために,2つの生物学的プロセスにわたる遺伝子発現動力学の定量的比較を可能にする新しい分析技術,軌跡アラインメントを導入した。再プログラムされた細胞は,異常または不完全な再プログラミング結果で終了する不正確な分枝を選択する細胞を用いて,2つの代替決定点に対応する分岐点を持つ軌跡をナビゲートする。これらの分岐点の分析は,再プログラミングの重要な分子決定因子としてインシュリンとBMPシグナル伝達を明らかにした。単一セル軌道アラインメントは,開発,再プログラミング,および他のコンテキストにおける多様なプロセスで見られる生物学的軌跡間の厳密な定量的比較を可能にする。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 時間分解能 ,  インスリン ,  遺伝的調節 ,  遺伝子発現 ,  アラインメント ,  線維芽細胞 ,  ヒト ,  筋管 ,  *軌跡 ,  キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  RNA-seq ,  決定因子 ,  *リプログラミング ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 単一細胞ゲノミクス ,  擬似時間 ,  リプログラミング

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  発生と分化  (EJ16020W)

タイトルに関連する用語 (6件)： 単一細胞 ,  再プログラミング ,  軌跡 ,  分子 ,  決定因子 ,  同定