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J-GLOBAL ID：201802215930424121   整理番号：18A0966690

Rhodococcus ruber株Chol-4における3-ケトステロイドδ1-デヒドロゲナーゼアイソザイムの機能的分化【JST・京大機械翻訳】

Functional differentiation of 3-ketosteroid Δ 1 -dehydrogenase isozymes in Rhodococcus ruber strain Chol-4

著者 (4件)： Guevara Govinda (Department of Biochemistry and Molecular Biology I, Universidad Complutense de Madrid, Madrid, Spain) ,  Heras Laura Fernandez de las (Faculty of Science and Engineering, Microbial Physiology-Gron Inst Biomolecular Sciences & Biotechnology, Groningen, The Netherlands) ,  Perera Julian (Department of Biochemistry and Molecular Biology I, Universidad Complutense de Madrid, Madrid, Spain) ,  Llorens Juana Maria Navarro (Department of Biochemistry and Molecular Biology I, Universidad Complutense de Madrid, Madrid, Spain)
資料名： Microbial Cell Factories (Web)  (Microbial Cell Factories (Web))
巻： 16  号： 1  ページ： 42  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7049A  ISSN： 1475-2859  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Rhodococcus ruber株Chol-4ゲノムは,ステロイド環分解に関与するフラビン酵素をコードする少なくとも3つの推定3-ケトステロイドΔ1-デヒドロゲナーゼORF(kstD1,kstD2およびkstD3)を含む。本研究の目的は,異なるバイオテクノロジー応用の開発に先立つこれらの酵素の機能的特性化である。【結果】3つのR.ruber KstD酵素には,種々の基質プロファイルがある。kstD1は9OHADとテストステロンに対して優先性を示し,プロゲステロン,デオキシコルチコステロンAD,最後に4-BNC,コルチコステロン及び19OHADが続いた。KstD2はプロゲステロンに対して最大の選択性を示し,続いて5α-Tes,DOC,ADテストステロン,4-BNCおよび最後に19OHAD,コルチコステロンおよび9OHADが続いた。KstD3の選択は飽和ステロイド基質(5α-Tes)で,プロゲステロンとDOCが続いた。KstD蛋白質の触媒ポケットをモデル化する予備的試みは,おそらくそれらの触媒的差異に関連するいくつかの構造的差異を明らかにした。kstD遺伝子の発現をRT-PCRとRT-qPCRによって研究した。全てのkstD遺伝子は,分析した全ての条件下で転写されたが,コレステロールとADの更なる誘導はkstD1とkstD3のコレステロールで観察された。いくつかの相関遺伝子の共転写を示すことができた。転写開始シグナルはin silicoとin vivoの両方で検索されている。kstD1,kstD2及びkstD3遺伝子上流の遺伝子間領域における推定プロモーターを同定し,アプラマイシンプロモーター試験ベクターにおいてプローブし,これらのR.ruber kstDプロモーターの機能的証拠を導いた。【結論】少なくとも3つの推定3-ケトステロイドΔ1-デヒドロゲナーゼORFs(kstD1,kstD2およびkstD3)が同定され,R.ruber株Chol-4において機能的に確認された。kstD1およびKstD2は,コレステロール分解経路(9OHADおよびAD)および他のステロイド化合物のよく知られた中間体に関して広範囲の基質選択性を示す。KstD3は飽和基質に対する優先性を有する狭い基質範囲を示した。それらの触媒特性におけるKstDsの違いは,予備的な構造モデリングによって明らかにされた構造的差異に関連していた。R.ruber kstD遺伝子の転写は特異的プロモーターから駆動される。3つの遺伝子は構成的に転写されるが,さらなる誘導はkstD1とkstD3で観察される。これらの酵素は広い汎用性を有し,KstD細胞活性の微細な調節を可能にする。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 基質特異性 ,  プロモーター領域 ,  キャラクタリゼーション ,  *ステロイド ,  触媒 ,  *Rhodococcus ,  タンパク質 ,  *デヒドロゲナーゼ ,  基質 ,  ゲノム ,  バイオテクノロジー ,  ステロール ,  脂環式アルコール ,  エノン ,  脂環式ケトン ,  ジオール ,  ジケトン ,  第二アルコール ,  ヒドロキシケトン ,  黄体ホルモン ,  ステロイドホルモン

著者キーワード (5件)： Rhodococcus ruber ,  3-ケトステロイド-δ1-デヒドロゲナーゼ ,  プロモーター ,  発現 ,  ステロイド

分類 (5件)： 性ホルモン  (EB08050O) ,  生殖器官  (EJ15020P) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  酵素生理  (EG03052C) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (4件)： コレステロール ,  コルチコステロン ,  プロゲステロン ,  テストステロン

引用文献 (74件)：

• Appl Environ Microbiol; Extracellular polysaccharides of Rhodococcus rhodochrous S-2 stimulate the degradation of aromatic components in crude oil by indigenous marine bacteria; N Iwabuchi, M Sunairi, M Urai, C Itoh, H Anzai, M Nakajima, S Harayama; 68; 2002; 2337-2343; 10.1128/AEM.68.5.2337-2343.2002; CR1;
• Proc Natl Acad Sci USA; The complete genome of Rhodococcus sp. RHA1 provides insights into a catabolic powerhouse; MP McLeod, RL Warren, WW Hsiao, N Araki, M Myhre, C Fernandes, D Miyazawa, W Wong, AL Lillquist, D Wang; 103; 2006; 15582-15587; 10.1073/pnas.0607048103; CR2;
• Can J Microbiol; Adventures in Rhodococcus-from steroids to explosives; KC Yam, S Okamoto; 57; 2011; 155-168; 10.1139/W10-115; CR3;
• J Environ Manag; Monitoring of natural and synthetic hormones in a polluted river; K Barel-Cohen, LS Shore, M Shemesh, A Wenzel, J Mueller, N Kronfeld-Schor; 78; 2006; 16-23; 10.1016/j.jenvman.2005.04.006; CR4;
• Environ Sci Pollut Res Int; Modulation of steroidogenesis by coastal waters and sewage effluents of Hong Kong, China, using the H295R assay; T Gracia, PD Jones, EB Higley, K Hilscherova, JL Newsted, MB Murphy, AK Chan, X Zhang, M Hecker, PK Lam; 15; 2008; 332-343; 10.1007/s11356-008-0011-6; CR5;

タイトルに関連する用語 (4件)： Rhodococcus ,  株 ,  ケトステロイド ,  分化